[发明专利]用于检测基因多态性的引物组、试剂盒及方法在审
| 申请号: | 202011500215.1 | 申请日: | 2020-12-18 |
| 公开(公告)号: | CN112608989A | 公开(公告)日: | 2021-04-06 |
| 发明(设计)人: | 赵方圆;智慧芳;倪君君 | 申请(专利权)人: | 成都和合医学检验所有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 济南信达专利事务所有限公司 37100 | 代理人: | 李世喆 |
| 地址: | 610100 四川省成都市成都经*** | 国省代码: | 四川;51 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 检测 基因 多态性 引物 试剂盒 方法 | ||
1.用于检测基因多态性的引物组,其特征在于,包括:下述4个引物对中的至少一个引物对;
用于检测ADRB1基因的rs1801253位点的引物对,其中,该引物对的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;
用于检测AGTR1基因的rs5186位点的引物对,其中,该引物对的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,下游引物的核苷酸序列由SEQ ID NO.4所示;
用于检测CYP2C9*3基因的rs1057910位点的引物对,其中,该引物对的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示,下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示;
用于检测CYP2D6*10基因的rs1065852位点的引物对,其中,该引物对的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示,下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示。
2.用于检测基因多态性的试剂盒,其特征在于,包括:如权利要求1所述的引物组。
3.基因多态性的检测方法,其特征在于,包括:
设计权利要求1所述的引物组,或,移取如权利要求2的试剂盒中的引物组;
从待测样本中提取基因组DNA作为扩增模板;
配制包含所述引物组和所述扩增模板的多重聚合酶链式反应PCR反应体系;
对所述多重PCR反应体系进行多重PCR扩增反应,得到PCR产物;
根据所述PCR产物,确定所述待测样本的ADRB1基因的rs1801253位点、AGTR1基因的rs5186位点、CYP2C9*3基因的rs1057910位点以及CYP2D6*10基因的rs1065852位点的基因型。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,
所述根据所述PCR产物,确定所述待测样本的ADRB1基因的rs1801253位点、AGTR1基因的rs5186位点、CYP2C9*3基因的rs1057910位点以及CYP2D6*10基因的rs1065852位点的基因型,包括:
利用电泳检测所述PCR产物,获得所述PCR产物的扩增片段的大小;
当所述PCR产物的扩增片段的大小正确时,对所述PCR产物进行核苷酸序列测定,获得所述待测样本的ADRB1基因的rs1801253位点、AGTR1基因的rs5186位点、CYP2C9*3基因的rs1057910位点以及CYP2D6*10基因的rs1065852位点的基因型。
5.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,
所述多重PCR反应体系还包括:DNA聚合酶、PCR缓冲液、4种dNTP的混合物和超纯水;
其中,DNA聚合酶的用量为0.5~6U,每种dNTP的终浓度均为30~500μM,4个引物对中的每条引物的终浓度为10-500nM。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,
所述DNA聚合酶包括:Taq聚合酶、KOD FX聚合酶、Pfu聚合酶或Phusion聚合酶。
7.根据权利要求3至6中任一所述的方法,其特征在于,
所述多重PCR反应体系的反应条件为:90~98℃条件下预变性30~400s;92~98℃条件下变性5~300s,52~68℃条件下退火10~90s,68~72℃条件下延伸10~300s,所述变性、所述退火和所述延伸循环25~45次;68~72℃条件下终延伸0~1800s。
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