[发明专利]病毒受体与人体靶器官的感染路径分析系统、电子设备有效
申请号: | 202011479964.0 | 申请日: | 2020-12-15 |
公开(公告)号: | CN112599201B | 公开(公告)日: | 2022-10-14 |
发明(设计)人: | 周文霞;韩露;张永祥;肖智勇;崔修亮;黄晏;刘港;高圣乔;罗丹 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00;G16B50/00;G16B45/00;G16B25/10 |
代理公司: | 北京清诚知识产权代理有限公司 11691 | 代理人: | 曹玲柱 |
地址: | 100039*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 病毒 受体 人体 器官 感染 路径 分析 系统 电子设备 | ||
1.一种病毒受体与人体靶器官的感染路径分析系统,其特征在于,包括:
病毒数据库,其存储有病毒的数据信息;
基因数据库,其存储有人体基因的数据信息;
基因表达数据库,其存储有人体器官的样本针对各个人体基因的基因表达值;
输入用户接口,用于接收用户输入或选定的:病毒;
关联信息查找模块,用于基于用户输入或选择的病毒,在病毒数据库中查找该病毒对应的数据项“Entrz ID”;基于该数据项“Entrz ID”的内容在基因数据库中查找对应的目标基因的数据项“基因Ensembl”;基于该数据项“基因Ensembl”的内容在基因表达数据库中确定目标基因的数据;
高表达器官筛选模块,用于基于该目标基因对应各个器官样本的基因表达值,筛选出对目标基因的高表达器官;
输出用户接口,用于将所述高表达的人体器官进行展示。
2.根据权利要求1所述的感染路径分析系统,其特征在于,所述高表达器官筛选模块包括:
基线对象选取子模块,用于选取基因表达数据库中的多个器官建立基线对象;
基线对象参数计算子模块,用于计算基线对象中各器官对应的样本针对目标基因的基因表达值的统计学参数;
器官参数计算子模块,用于分别计算各器官对应的样本针对目标基因的基因表达值的统计学参数;
筛选子模块,用于依据基线对象和各器官针对目标基因的基因表达值的统计学参数从各器官中筛选出目标基因的高表达器官。
3.根据权利要求2所述的感染路径分析系统,其特征在于:
所述基线对象参数计算子模块,用于计算基线对象中各器官对应的器官样本针对目标基因的基因表达值的均值和标准差SO,gene(k);
所述器官参数计算子模块,用于分别计算各器官对应的样本针对目标基因的基因表达值的均值和标准差;
所述筛选子模块,用于:
如时,确定人体器官organ(i)对于人体基因gene(k)为高表达;
如则器官organ(i)对于人体基因gene(k)为低表达;
除上述两种情况外,确定器官organ(i)对于人体基因gene(k)为中性表达;
其中,和Sorgan(i),gene(k)分别为人体器官organ(i)对于人体基因gene(k)的均值和标准差。
4.根据权利要求2所述的感染路径分析系统,其特征在于:所述基线对象选择子模块通过确定基线选取边界,从而将索引值在基线选取边界之内的器官组成基线对象;其中:
对于基因表达数据库中的人体器官,确定每一个人体器官对应一个独一无二的索引值;
基线选取边界包括:最小器官索引和最大器官索引,其中:最小器官索引=ceiling(P/k);最大器官索引=P-ceiling(P/k),其中,P为基因表达数据库中器官总数;k为基线参数,3≤k≤6。
5.根据权利要求2所述的感染路径分析系统,其特征在于,所述高表达器官筛选模块还包括:
数据清洗子模块,用于对基因表达数据库中的基因表达值数据进行清洗,去除其中的离群值。
6.根据权利要求1所述的感染路径分析系统,其特征在于,所述基因表达数据库记载了人体器官的样本针对人体基因的基因表达值;其中:
所述人体器官的总数不低于20个;
每个人体器官对应的样本不低于200个,人体器官的样本由器官从不同部位进行切分得到;
所述人体器官的样本针对人体基因的基因表达值由临床试验中对器官样本实验分析得出。
7.根据权利要求1所述的感染路径分析系统,其特征在于:
所述输出用户接口,用于依照高表达器官的基因表达值高低情况在人体组织层面动态生成人体器官图,对各个高表达器官使用不同深浅的颜色进行标记以反映所述病毒对人体各器官的感染程度。
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