[发明专利]一种检测MECP2基因拷贝数变异的试剂盒

说明书

本发明公开了一种检测MECP2基因拷贝数变异的试剂盒。所述试剂盒中含有如下引物对：Q‑MECP2‑LF：CATCACAGCCAATGACGCCC，Q‑MECP2‑LR：accccgcacggccgacgtCG，Q‑MECP2‑MF：CAAAATGTCCCAAATAGCCCACG，Q‑MECP2‑MR：CAAAgcaggaactggtgagAcAg，Q‑MECP2‑RF：CTGCCTCTGCTCACTTGTTGAG，Q‑MECP2‑RR：cctggaggtcctggtcttcAgTc。本发明简单快捷，预实验成本低，适用于小批量检测和验证。

技术领域

本发明属于生物医学检测技术领域，具体涉及一种检测MECP2基因拷贝数变异的试剂盒。

背景技术

MECP2重复综合症是一种严重的神经发育障碍疾病，其主要特征为早发性肌张力减退、进食困难、胃食管反流和便秘、精神运动发育迟缓导致严重智力障碍、语言发育不良、进行性痉挛、反复呼吸道感染和癫痫发作等。MECP2重复综合症致病机制为MECP2基因的杂合全基因重复。该病主要以X连锁的方式遗传，多数男性患者遗传自母亲(杂合变异携带者)，少数为新发突变。女性携带者通常无症状，但也有文献报道女性携带者表现出轻度智力障碍以及类似于男性患者的症状。

拷贝数变异(Copy number variation，CNV)一般是指长度为1kb以上的基因组大片段的拷贝数增加或者减少，主要表现为亚显微水平的缺失、重复和倒位。与SNP相比，CNV数量虽然不多，但涉及更多的基因组序列，突变率更高。CNV是人类遗传多样性和个体间遗传差异的一个重要原因，除了一部分会致病以外也可以作为遗传多态性的一种。2004年，两项里程碑式的研究发现这种DNA拷贝数亚微观的变异(500kb)广泛存在于正常人类基因组中。

CNV是基因组结构变异(Structural variation，SV)的重要组成部分，过去几年中，随着基因组信息的不断挖掘以及检测技术的进步，CNV在遗传病发病中的作用越来越受到重视，其致病机制可能与基因剂量效应、基因断裂、基因融合和位置效应等有关。对CNV的深入研究，可能有助于更好的理解遗传性疾病的发病机制，有利于分子诊断和治疗手段的研究和开发。

基于PCR技术的方法中应用最为广泛的是qPCR，它利用相对定量实时PCR系统，对检测样本的目标基因(具有拷贝数多态)以及参照基因(无拷贝数多态)，利用2^-ΔΔCt相对定量分析法(Livak and Schmittgen，2001)进行拷贝数的分析。该方法简单易于操作，敏感性高，重复性好，速度快和污染少，但是不适合大样本的高通量检测。

发明内容

本发明旨在克服现有技术中的不足，提供一种检测MECP2基因拷贝数变异的试剂盒。

为了达到上述目的，本发明提供的技术方案为：

所述检测MECP2基因拷贝数变异的试剂盒中含有如下引物对：

Q-MECP2-LF：CATCACAGCCAATGACGCCC(SEQ ID NO.1)

Q-MECP2-LR：ACCCCGCACGGCCGACGTCG(SEQ ID NO.2)

Q-MECP2-MF：CAAAATGTCCCAAATAGCCCACG(SEQ ID NO.3)

Q-MECP2-MR：CAAAGCAGGAACTGGTGAGACAG(SEQ ID NO.4)

Q-MECP2-RF：CTGCCTCTGCTCACTTGTTGAG(SEQ ID NO.5)

Q-MECP2-RR：CCTGGAGGTCCTGGTCTTCAGTC(SEQ ID NO.6)。

优选地，所述试剂盒中还含有内参引物对：