[发明专利]一种水体菌落总数的自动计数方法在审
| 申请号: | 202011441713.3 | 申请日: | 2020-12-08 |
| 公开(公告)号: | CN112669261A | 公开(公告)日: | 2021-04-16 |
| 发明(设计)人: | 刘寿生;盖志刚;郭风祥;姜辛;柴旭;王宜豹;胡鼎;张妹;王邵琰;张丽丽;张学宇;陈志刚;孙小玲 | 申请(专利权)人: | 山东省科学院海洋仪器仪表研究所 |
| 主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06K9/62;G06N3/04;G06N3/08 |
| 代理公司: | 青岛华慧泽专利代理事务所(普通合伙) 37247 | 代理人: | 刘娜 |
| 地址: | 266200 山东省青岛市鳌山卫街*** | 国省代码: | 山东;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 水体 菌落 总数 自动 计数 方法 | ||
1.一种水体菌落总数的自动计数方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)对培养皿菌落图像进行样本采集;
(2)手工对采集的图像样本进行菌落实例标注;
(3)菌落检测级联网络的构建:采用SSD_MOBILENET_V1_FPN网络作为前端菌落目标检测网络,在前端菌落目标检测网络的输出端后面,级联SVM-Hog分类器;所采用的SSD_MOBILENET_V1_FPN网络,其中MOBILENET_V1的超参数宽度因子设置为0.25;
(4)对构建的菌落检测级联网络进行训练:采用前面标注的菌落样本图像数据,分别训练SSD_MOBILENET_V1_FPN检测网络模型和SVM-Hog分类器;
(5)菌落检测与筛选:将待测培养皿图像作为训练好的SSD_MOBILENET_V1_FPN检测网络模型的输入进行推理预测,得到候选菌落列表,根据筛选阈值T1,将置信度小于阈值T1的候选菌落从候选菌落列表中删除,根据筛选阈值T2,T2>T1,挑选置信度位于[T1,T2]区间的候选菌落,逐个截取候选菌落图片块作为训练好的SVM-Hog分类器的输入,判定是否为菌落,如果不是,从候选菌落列表中剔除该候选菌落;
(6)检测结果分析与计数:以上述经过菌落检测级联网络获取的菌落列表作为最终菌落列表,并以列表长度值作为菌落总数。
2.根据权利要求1所述的一种水体菌落总数的自动计数方法,其特征在于,步骤(1)中,对培养皿菌落图像进行样本采集时,以垂直距离d在培养皿正上方拍摄n份包含菌落的培养皿图像,其中:距离d的设置需确保培养皿充满画面,培养皿菌落图像份数n需确保菌落实例总数大于N,200<N<1000,假设第i张图像中的菌落数是ni,持续累加菌落数,当n1+n2+...+niN时,采集截止,表示采集数据充足。
3.根据权利要求1所述的一种水体菌落总数的自动计数方法,其特征在于,步骤(2)中,针对采集的每幅培养皿菌落图像,手动逐个标注其中的菌落位置,标注结果存入与培养皿图像同名的标注文件,每个标注文件对应一幅培养皿图像,标注文件内部是菌落的位置列表,列表每行代表一个菌落的起始像素坐标和像素长宽。
4.根据权利要求1所述的一种水体菌落总数的自动计数方法,其特征在于,SSD_MOBILENET_V1_FPN检测网络模型采用基于FPGA且支持AI计算加速的片上系统器件UltraScale+TMMPSoC EV进行计算。
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