[发明专利]用于胃癌预后判断的SNP

说明书

本申请提供了检测SNP位点rs13173911、rs4131826、rs3754509、rs4726、rs1059292中一个或多个多态性的试剂在制备预测胃癌预后的试剂盒中的应用；本申请还提供了相应试剂盒、位点组合和预测方法。

技术领域

本发明属于分子生物学领域和癌症诊治领域，具体的本申请提供了一种可用于胃癌预后判断的SNP以及相应的试剂盒、制备用途和预测方法。

背景技术

胃癌是危害人类健康的常见恶性肿瘤种类(仅次于肺癌、乳腺癌和肠癌)，每年全球新发超过百万例。由于基因和饮食习惯的原因，我国属于胃癌高发区，病例占全球40％以上。近年来虽然治疗方法和药物上有了较多的进展，但缺乏能够准确评估患者术后复发转移危险度等影响预后的指标，无法简单易行地开展术后监控是胃癌术后生存期难以延长的主要因素之一

琥珀酸脱氢酶(SDH)，为A、B、C、D四个不同亚基组成的四聚体结构，其嵌于线粒体膜上，为三羧酸循环和线粒体呼吸链的必要组成部分。作为抑癌基因，已知其突变与多种肿瘤相关，目前已经研究的包括胃肠道间质瘤、肠癌、肾癌、甲状腺癌、某些神经肿瘤。

CD98为溶质转运家族成员之一，除了氨基酸转运之外，还参与细胞黏附等过程，研究表明其突变与肺癌、黑色素瘤、肝细胞癌等肿瘤相关。

目前尚没有SDH和CD98上SNP与胃癌预后关联性的研究结果。

发明内容

申请人在整理相关项目统计研究数据时，发现了SDH和CD98上多个SNP位点与胃癌预后呈现相关性，为降低胃癌复发率、延长手术后生存时间提供了新的思路。

一方面，本申请提供了一种预测胃癌预后的试剂盒，包括检测SNP位点rs13173911、rs4131826、rs3754509、rs4726、rs1059292多态性的试剂。

进一步地，所述检测SNP位点rs13173911、rs4131826、rs3754509、rs4726、rs1059292多态性的试剂为SEQ ID NO.1-15的引物。

另一方面，本发明提供了预测胃癌预后的SNP位点组合，包括rs13173911、rs4131826、rs3754509、rs4726、rs1059292。

另一方面，本发明提供了检测SNP位点rs13173911、rs4131826、rs3754509、rs4726、rs1059292中一个或多个多态性的试剂在制备预测胃癌预后的试剂盒中的应用。

进一步地，其中SNP位点为rs13173911和rs4726，胃癌预后为死亡风险。

进一步地，其中检测SNP位点的试剂为SEQ ID NO.1-3、10-12的引物。

进一步地，其中SNP位点为rs13173911、rs4131826、rs4726和rs1059292，胃癌预后为复发风险。

进一步地，其中检测SNP位点的试剂为SEQ ID NO.1-3、7-15的引物。

另一方面，本发明提供了预测胃癌预后的方法，包括检测SNP位点rs13173911、rs4131826、rs3754509、rs4726、rs1059292中一个或多个多态性。

本申请中的胃癌包括但不限于腺癌、腺鳞癌、印戒细胞癌、未分化细胞癌等，发生部位包括但不限于胃上部、中部、下部、食管结合部等。

本申请中的胃癌预后包括但不限于生存期、复发概率、复发后的进展情况等。

检测SNP位点基因型的试剂/方法不限于实施例中所示的，其他可用于多态性位点基因型检测的试剂/方法也均可使用，包括但不限于扩增后直接测序所用的试剂，RFLP、SSCP等。

具体实施方式