[发明专利]检测玉米基因组中SNP的多态性的物质在鉴定玉米镉含量中的应用有效

专利信息
申请号: 202011319425.0 申请日: 2020-11-23
公开(公告)号: CN112226532B 公开(公告)日: 2022-05-31
发明(设计)人: 何振艳;冯璐;许文秀;闫慧莉 申请(专利权)人: 中国科学院植物研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 任凤华
地址: 100093 北京市海淀*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 检测 玉米 基因组 snp 多态性 物质 鉴定 含量 中的 应用
【说明书】:

发明公开了检测玉米基因组中SNP的多态性的物质在鉴定玉米镉含量中的应用。该SNP位点的名称为ZmCd10‑KASP‑158410625,位于序列表SEQ ID NO.1的第333位,其核苷酸种类为T或C。本发明所要保护的一个技术方案是检测玉米基因组中ZmCd10‑KASP‑158410625的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定玉米镉含量产品中的应用。在188份玉米自交系品种中,96.24%的SNP基因型TT的玉米品种籽粒镉含量均低于0.1mg/kg,85.45%的SNP基因型CC的玉米品种籽粒镉含量均高于0.1mg/kg,该SNP可用于玉米育种及低镉玉米品种的选育。

技术领域

本发明涉及植物分子生物技术领域,具体涉及检测玉米基因组中SNP的多态性的物质在鉴定玉米镉含量中的应用。

背景技术

随着工农业的发展,工业三废排放、矿产开采、电池乱扔以及农药、化肥的大量使用,导致部分土壤和水体的镉含量剧增。镉通过食物链在动植物和人体内累积,造成不可逆的毒害效应,严重危及人类健康。镉中毒还可导致肾脏、骨骼、肺等器官的损害,引起各种急慢性疾病,如肾结石、‘痛痛病’、肺炎等。玉米是是世界上重要的粮食兼饲料作物,种植面积广泛,截至2017年播种面积已达到4239.9万hm2,其在国民经济发展中的作用不可或缺。土壤镉污染问题对玉米等粮食作物的安全生产构成严重威胁,玉米等粮食作物的安全问题与人类健康息息相关。如何利用现有农田,种植玉米镉低积累品种,保障农作物玉米生产安全,有效阻断重金属镉进入食物链迫在眉睫。目前需要有效鉴别玉米镉积累性状的分子辅助手段。

发明内容

本发明所要解决的技术问题是如何鉴定或辅助鉴定玉米的镉积累性状或如何鉴定或辅助鉴定玉米籽粒的镉含量或如何进行玉米育种。

为了解决上述技术问题,本发明首先提供了检测玉米基因组中ZmCd10-KASP-158410625的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定玉米镉含量产品中的应用。所述ZmCd10-KASP-158410625是玉米基因组的一个SNP位点,为序列表中SEQ ID No.1的第333位核苷酸,其为T或C。

为了解决上述技术问题,本发明还提供了检测玉米基因组中ZmCd10-KASP-158410625的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定玉米镉含量产品中的应用。所述ZmCd10-KASP-158410625是玉米基因组的一个SNP位点,为序列表中SEQ ID No.1的第333位核苷酸,其为T或C。

为了解决上述技术问题,本发明还提供了检测玉米基因组中ZmCd10-KASP-158410625的多态性或基因型的物质在玉米育种或制备玉米育种产品中的应用。所述ZmCd10-KASP-158410625是玉米基因组的一个SNP位点,为序列表中SEQ ID No.1的第333位核苷酸,其为T或C。

所述玉米镉含量可为玉米籽粒镉含量。所述玉米可为玉米自交系。

所述SNP位点ZmCd10-KASP-158410625的基因型可为TT、CC或TC。基因型TT是ZmCd10-KASP-158410625为T的纯合型。基因型CC是ZmCd10-KASP-158410625为C的纯合型。基因型TC是ZmCd10-KASP-158410625为T和C的杂合型。所述SNP分子标记位点的基因型为基因型TT的玉米的籽粒镉含量低于或候选低于所述SNP分子标记位点的基因型为基因型CC的玉米。

为了解决上述技术问题,本发明还提供了一种产品,所述产品为含有上述检测玉米基因组SNP分子标记位点的多态性或基因型的物质的产品。可为下述G1)-G3)中的任一种:

G1)检测玉米镉含量相关的单核苷酸多态性或基因型的产品;

G2)鉴定或辅助鉴定玉米镉含量的产品;

G3)用于玉米育种的产品。

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