[发明专利]一种通过指尖血评估生育力相关基因的检测方法及系统在审

专利信息
申请号: 202011315201.2 申请日: 2020-11-20
公开(公告)号: CN112375819A 公开(公告)日: 2021-02-19
发明(设计)人: 龚航;陈家生 申请(专利权)人: 和卓生物科技(上海)有限公司
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883
代理公司: 上海百一领御专利代理事务所(普通合伙) 31243 代理人: 马育麟
地址: 201203 上海市浦东新区中国(上海*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 通过 指尖 评估 生育 相关 基因 检测 方法 系统
【说明书】:

发明属于生物医药领域,涉及一种通过指尖血评估生育力的基因检测方法及其应用。所述的检测方法包括:获取指尖血样,采用磁珠法抽提干血斑核酸;构建文库并质控分析插入片段分布情况;根据生育力相关基因设计探针,测序数据获得后,对数据进行质控和低质量过滤,与人类参考基因组比对并进行SNP分型;通过常用数据库和/或工具对变异进行注释;通过与公共数据库以及自有数据库比对,集成LIMS系统从而形成检测分析报告;使用流程跟踪模块跟踪每一个检测步骤直至形成检测报告。本发明还包括相应的检测系统。本发明的检测方法和系统检测全面、结果准确、科学专业,能够用于查明不孕不育遗传学病因,指导辅助生殖方案。

技术领域

本发明属于生物医药领域,涉及基因检测方法,尤其涉及一种通过指尖血评估生育力相关基因的检测方法、系统及其应用。

背景技术

根据世界卫生组织的规定,育龄的夫妇在有规律的性生活的情况下,没有采取任何避孕措施,超过1年不怀孕属于不孕不育症。

不孕不育的原因多种多样。因男性原因导致配偶不孕者,称男性不孕症或男性不育症,习惯称男性不育。男性不育的原因主要有:(1)精子数量不足:正常男子每毫升精液能产生至少2千万个精子,如果少于2千万个精子则为数量不足。(2)精子活力不足:快速向前精子少于25%。(3)精子形态不良:畸形精子大于70%。(4)无精子或精子完全缺乏:睾丸功能衰竭、输精管堵塞及双侧输精管缺如。(5)性功能障碍:射精障碍或阳痿。(6)死精子症、逆行射精及血精子症。(7)内分泌功能异常,等等。女性的原因主要有:(1)输卵管因素:输卵管受损或阻塞,阻碍了卵子与精子的遇合。(2)卵巢因素:排卵异常或各种卵巢肿瘤性病变。(3)宫颈因素:子宫颈发育及腺体分泌不良或子宫颈各种炎症及肿瘤。(4) 子宫因素:先天发育不良、畸形、子宫肿瘤及子宫内膜异位症。(5)子宫内膜增殖症、子宫内膜炎症及粘膜下肿瘤,等等。出现上述症状的原因很多。

目前医院针对不孕不育症患者的检测项目很多也很专业,例如通过采集静脉血来操作必须由专业人员操作完成,且必须去医疗机构进行血样采集。很多患者碍于情面或者工作繁忙,不愿意去医疗结构参加不孕不育相关的门诊,但是所谓“不孝有三,无后为大”,长期处于备孕状态的育龄夫妇不仅需要面对自我疑惑,更要承受来自长辈、社会的质疑。

但是,到目前为止,尚未有关于帮助育龄夫妇了解不孕不育原因的快捷检测方法。

发明内容

本发明提供了一种通过指尖血评估生育力相关基因的检测方法,旨在通过采集受检者指尖血,用特定采样盒制作成血斑,从待测样本中提取遗传物质DNA,通过探针杂交捕获的方法,捕获中国人群常见生育率相关基因的外显子以及UTR±10bp以内的区域,并进行高通量测序,以检测相关基因的突变情况。

本发明提供了一种通过指尖血评估生育力相关基因的检测方法,所述的检测方法包括:

获取指尖血样,所述的指尖血样包括至少一个由20-50微升血样形成的干血斑;

采用磁珠法抽提干血斑核酸;

对所抽提DNA进行定量、打断并构建文库,对所构建文库质控分析插入片段分布情况,插入片段成正态分布,峰值在320bp-380bp之间;

使用识别生育力相关基因的探针进行检测,所述的探针的覆盖度不小于95%;

测序数据获得后,对数据进行质控和低质量过滤,与人类参考基因组比对,并进行SNP 分型;

通过常用数据库和/或工具对变异进行注释,通过与公共数据库以及自有数据库比对,集成公司自有实验室管理系统(LIMS系统),形成检测分析报告。

使用流程跟踪模块跟踪每一个步骤直至形成检测报告。

较好的,所述的获取指尖血样是在非医疗机构,使用采血针自行获取20-50微升血样。

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