[发明专利]一种用于检测草莓斑驳病毒的专用引物、试剂盒及检测方法在审
申请号: | 202011309275.5 | 申请日: | 2020-11-20 |
公开(公告)号: | CN112410468A | 公开(公告)日: | 2021-02-26 |
发明(设计)人: | 邹小花;高清华;段可;白云;刘雅;纪颖 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11 |
代理公司: | 南京华恒专利代理事务所(普通合伙) 32335 | 代理人: | 裴素艳 |
地址: | 201403 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 草莓 斑驳 病毒 专用 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一种用于检测草莓斑驳病毒的专用引物,其特征在于,包括正向引物和反向引物;
所述正向引物的核苷酸序列选自如下序列中的一种:
SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:5;
所述反向引物的核苷酸序列选自如下序列中的一种:
SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7或SEQ ID NO:8。
2.根据权利要求1所述的用于检测草莓斑驳病毒的专用引物,其特征在于,所述反向引物序列的5′端用Biotin标记。
3.一种检测草莓斑驳病毒的试剂盒,包括权利要求1所述的专用引物。
4.根据权利要求3所述的检测草莓斑驳病毒的试剂盒,其特征在于,还包括具有SEQ IDNO:9所示核苷酸序列的探针。
5.根据权利要求4所述的检测草莓斑驳病毒的试剂盒,其特征在于,所述探针序列的5′端用FAM标记,3′端用C3 space标记,从5′端开始计算,第31个碱基‘T’用-THF-替代。
6.权利要求1所述的专用引物、权利要求3所述的试剂盒在检测草莓斑驳病毒中的应用。
7.一种快速检测草莓斑驳病毒的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取待测草莓样品的总RNA核酸;
(2)以步骤(1)的总RNA为模板,利用权利要求1所述的专用引物进行逆转录-重组酶聚合酶恒温扩增;
(3)利用琼脂糖凝胶电泳(AGE)方法或者试纸条夹心检测技术对恒温扩增产物进行检测,确定待测草莓样本是否含有草莓斑驳病毒。
8.根据权利要求7所述的快速检测草莓斑驳病毒的方法,其特征在于,步骤(2)中所述逆转录-重组酶聚合酶恒温扩增的反应体系,以总体积为50μL计,包括:10μM的正向引物1.5-2.5μL、5μM的反向引物1.5-2.5μL和10μM具有SEQ ID NO:9所示核苷酸序列的探针0.4-0.8μL。
9.根据权利要求7所述的快速检测草莓斑驳病毒的方法,其特征在于,步骤(2)中所述逆转录-重组酶聚合酶恒温扩增的温度为37-42℃,优选40℃,反应时间为10-20min,优选15min。
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