[发明专利]前列腺癌的风险评估装置在审
申请号: | 202011296360.2 | 申请日: | 2020-11-18 |
公开(公告)号: | CN113528660A | 公开(公告)日: | 2021-10-22 |
发明(设计)人: | 陈欲超 | 申请(专利权)人: | 深圳汇芯生物医疗科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6851 |
代理公司: | 深圳市赛恩倍吉知识产权代理有限公司 44334 | 代理人: | 许春晓 |
地址: | 518110 广东省深圳市龙华区观澜街*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 前列腺癌 风险 评估 装置 | ||
1.一种前列腺癌的风险评估装置,其特征在于,包括:
收集装置,用于收集测试者的外泌体溶液;
核酸获取装置,用于提取所述外泌体溶液的RNA,得到样品RNA溶液;
扩增装置,用于定量检测所述样品RNA溶液中所述目标区域,所述目标区域包括PCA3基因、ERG基因以及SPDEF基因;
数据获取及分析装置,用于获取PCA3基因、ERG基因以及SPDEF基因的表达量,并计算出PCA3基因和ERG基因相对SPDEF基因的表达量,
其中,所述数据获取及分析装置通过记录PCA3基因、ERG基因及SPDEF基因的Ct值,将PCA3基因和ERG基因的表达水平归一化至SPDEF基因,分别计算得到PCA3基因和ERG基因的ΔCT值,利用相对表达量的计算公式ΔΔCT=2^ΔCt(PCA3)+2^ΔCt(ERG),计算出PCA3基因和ERG基因的相对表达量之和,再利用公式:(16.92-ΔΔCt)*1.83,计算出一分数,该分数能反映发生前列腺癌的风险级别。
2.根据权利要求1所述的前列腺癌的风险评估装置,其特征在于,所述扩增装置包括qRT-PCR扩增体系。
3.根据权利要求2所述的前列腺癌的风险评估装置,其特征在于,所述核酸提取装置提取所述外泌体溶液中的所述样品RNA溶液的方法包括:
向所述外泌体溶液中加入600~800μl Trizol溶液,18-25℃下孵育匀浆3~5min后,加入100~220μl氯仿,晃动混匀10~20s,在2~6℃、10000~12000rpm离心10~15min,取上层澄清溶液,将上层澄清溶液进行RNA纯化,得到样品RNA溶液。
4.根据权利要求2所述的前列腺癌的风险评估装置,其特征在于,所述扩增装置对所述样品RNA溶液的扩增方法包括:
将样品RNA溶液加入qRT-PCR扩增体系中,先在30℃~50℃条件下,扩增10min~30min,再在90℃~95℃条件下,扩增2min~10min;
进一步在90℃~95℃条件下,扩增10s~30s,最后在55℃~65℃条件下,扩增30s~60s,此步骤循环30次~50次,得到PCR产物;
其中,在55℃~65℃扩增的步骤采集荧光信号。
5.根据权利要求2所述的前列腺癌的风险评估装置,其特征在于,所述qRT-PCR扩增体系包括引物混合液、PCR缓冲液、PCR反应液和酶混液。
6.根据权利要求5所述的前列腺癌的风险评估装置,其特征在于,按浓度计算,所述引物混合液包括:100nM~500nM的ERG F、100nM~500nM的ERG R、100nM~500nM的ERG Pb、100nM~500nM的SPDEF F、100nM~500nM的SPDEF R、100nM~500nM的SPDEF R、100nM~500nM的SPDEF Pb、100nM~500nM的PCA3 F、100nM~500nM的PCA3 R、100nM~500nM的PCA3Pb、0.1~10ROX和余量的水。
7.根据权利要求5所述的前列腺癌的风险评估装置,其特征在于,所述PCR缓冲液包括浓度为50mM~800mM PH值为7.5~9.0的Tris-HCl溶液、浓度为50mM~800mM的KCl、浓度为50mM~500mM的硫酸铵和余量水。
8.根据权利要求5所述的前列腺癌的风险评估装置,其特征在于,所述PCR反应液包括1~10PCR缓冲液、1mM~6mM的MgCl2、重量百分比为0.5%~5%的甘油、0.1~1PC300和余量的水。
9.根据权利要求5所述的前列腺癌的风险评估装置,其特征在于,所述酶混液包括浓度为1U~10U的Taq-HS、浓度为1U~50U的RTase、Taq Buffer、0.1mM~1mMdNTPs、0.1~10PC300和余量的水。
10.根据权利要求1所述的前列腺癌的风险评估装置,其特征在于,所述收集装置还用于对所述外泌体溶液进行前处理,所述前处理包括提纯所述外泌体溶液。
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