[发明专利]lncRNA靶基因的预测分析方法、装置、设备和介质

权利要求书

1.一种lncRNA靶基因的预测分析方法，其特征在于，所述方法包括：

统计每个处理中重复的mRNA表达量之和，并根据表达量过滤掉表达量之和为零的mRNA序列；

对mRNA和lncRNA的表达量进行相关性分析，并提取对应的相关性系数和概率P值作为相关性评判标准，以合并去冗余并分别以mRNA文件和lncRNA文件进行存储；

对去冗余后的lncRNA序列按照指定序列数目进行拆分，以分别生成批量任务运行shell脚本，并提交至集群以实现多线程运行。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述对mRNA和lncRNA的表达量进行相关性分析中，根据样本数量的不同选择不同的相关性分析方法。

3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述根据样本数量的不同选择不同的相关性分析方法，包括：

若样本数量小于15，则通过R软件包Hmsic中的rcorr函数对mRNA和lncRNA的表达量进行相关性分析；

反之，若样本数量大于15，则通过加权共表达网络分析对mRNA和lncRNA的表达量进行相关性分析。

4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述提取对应的相关性系数和概率P值作为相关性评判标准，包括：默认提取P0.05的所有关联的基因，将关联基因合并去冗余后分别以mRNA和lncRNA储存。

5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述对去冗余后的lncRNA序列按照指定序列数目进行拆分，以分别生成批量任务运行shell脚本，并提交至集群以实现多线程运行，包括：

将拆分结果分别储存至不同fasta文件，并将每个fasta文件的绝对路径储存至list文件；

序列拆分成功后，按行读取list路径文件生成批量任务运行shell脚本，以提交至集群实现多线程运行。

6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述对去冗余后的lncRNA序列按照指定序列数目进行拆分，以分别生成批量任务运行shell脚本，并提交至集群以实现多线程运行，还包括：

对lncRNA序列拆分成不同模块，并分别与mRNA表达量进行相关性分析，形成多线程运行模式，提高分析时效。

7.一种电子装置，其特征在于，所述装置包括：

mRNA过滤模块，用于统计每个处理中重复的mRNA表达量之和，并根据表达量过滤掉表达量之和为零的mRNA序列；

相关性过滤模块，用于对mRNA和lncRNA的表达量进行相关性分析，并提取对应的相关性系数和概率P值作为相关性评判标准，以合并去冗余并分别以mRNA文件和lncRNA文件进行存储；

多线程处理模块，用于对去冗余后的lncRNA序列按照指定序列数目进行拆分，以分别生成批量任务运行shell脚本，并提交至集群以实现多线程运行。

8.一种计算机设备，其特征在于，所述设备包括：存储器、及处理器；所述存储器用于存储计算机指令；所述处理器运行计算机指令实现如权利要求1至6中任意一项所述的方法。

9.一种计算机可读存储介质，其特征在于，存储有计算机指令，所述计算机指令被运行时执行如权利要求1至6中任一项所述的方法。