[发明专利]一种核酸测序方法有效
申请号: | 202011289898.0 | 申请日: | 2020-11-17 |
公开(公告)号: | CN112322715B | 公开(公告)日: | 2022-11-25 |
发明(设计)人: | 白净卫;杜娟娟;徐扬 | 申请(专利权)人: | 清华大学 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12N9/12;C12P19/34 |
代理公司: | 北京领科知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11690 | 代理人: | 杨晞 |
地址: | 100084*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 核酸 方法 | ||
1.一种核酸测序方法,所述的测序方法包括如下步骤:
(1)提供聚合酶,所述的聚合酶通过可断裂基团与dNTP连接,并且所述的聚合酶可发出光信号;
(2)使所述聚合酶与待测核酸模板-引物复合体的引物3'端接触,所述聚合酶上的dNTP与待测核酸的序列上的碱基互补配对并在聚合酶酶促反应加入引物3'端;
(3)检测所述聚合酶发出的光信号;
所述聚合酶为Bst DNA Pol的变体,所述的Bst DNA Pol的变体的氨基酸序列如SEQ IDNO:10所示。
2.根据权利要求1所述的一种核酸测序方法,其特征在于,所述的可断裂基团含有可断裂结构X,所述的X选自:
其中,j为1-3的整数,
R选自H、C1-10直链或支链烷基、C2-10烯基、C2-10炔基、C3-10环烷基、芳基、含有N、O或S的杂环芳基、含有N、O或S的杂环烷基、-N(C0-10烷基)(C0-10烷基)、-CON(C0-10烷基)(C0-10烷基)、-N(C0-10烷基)CO(C0-10烷基)、COR1、CN,C1-10烷氧基,芳氧基,含有N、O或S杂芳氧基,上述基团中的H可被以下基团取代:卤素、-CN、-OCH2F、-OCHF2、-OCF3、-OH、C1-10直链或支链烷基、-N(C0-10烷基)(C0-10烷基)、-OC0-10烷基、C3-10环烷基、-O杂环烷基、-N杂环烷基、-S杂环烷基、-N杂环芳香基、-O杂环芳香基、-S杂环芳香基,R1选自H、OC0-10烷基、C1-10直链或支链烷基,
R'选自N或O。
3.根据权利要求2所述的一种核酸测序方法,其特征在于,所述的可断裂基团具有L1-L2-X-L3-L4结构,其中,L1为与dNTP或修饰的dNTP结合的端基,L2和L3不存在或为不可断裂连接基团,L4为与聚合酶结合的端基。
4.根据权利要求3所述的一种核酸测序方法,其特征在于,所述的L1或L4独立的选自马来酰亚胺基、羧基、巯基、叠氮基、炔基、环辛炔基及其衍生物、四嗪基、二硫吡啶基、乙烯基、烯砜基、琥珀酰亚胺基、醛基、酰肼基、胺氧基和α-卤代羰基。
5.根据权利要求3所述的一种核酸测序方法,其特征在于,所述的L2或L3独立的选自-O(CH2CH2O)i-、-(CH2)i-、-(CH2)iNH(CH2)i-、-(CH2)iCOO(CH2)i-、-(CH2)iCONH(CH2)i-、-(CH2)iO(CH2)i-、-(CH2)iCO(CH2)i-或中的一个或二个以上基团的组合,所述的i选自0-10的整数。
6.根据权利要求1所述的一种核酸测序方法,其特征在于,所述聚合酶连接有一个或多个荧光标记物、磷光标记物或者化学发光标记物。
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