[发明专利]Myb28的遗传标志物

说明书

本发明涉及用于确定十字花科蔬菜植物的基因型以获得具有增加的硫代葡萄糖苷水平的植物的方法，包括从所述植物或其部分获得核酸样品并在所述核酸样品中检测与增加的硫代葡萄糖苷水平遗传关联的Myb28基因座处的多态性。该多态性可包括以下至少一种：a)在对应于SEQ ID NO:1的核苷酸83、136、226、563、610、830、995、1116、1513、1577、1606、1620、1825、1863、1877或2026的位置处的单核苷酸多态性(SNP)或b)在SEQ ID NO:1的核苷酸323和332之间、核苷酸521和524之间、核苷酸783和786之间、核苷酸909和914之间、核苷酸1365和1369之间、1811和1821之间或核苷酸2046和2056之间存在的核苷酸数目的多态性或c)在SEQ ID NO:1的核苷酸836和837之间、核苷酸867和868之间或核苷酸943和944之间存在的核苷酸数目的多态性。

本申请是申请日为2013年9月13日、申请号为201310429743.6、发明名称为“MYB28的遗传标志物”的发明专利申请的分案申请。

相关申请的交叉引用

本申请要求2012年9月13日提交的美国临时申请61/700,731号的利益，该申请通过引用全文并入。

序列表的并入

包含在微软视窗操作系统中测量的21kb的名称为“SEMB009US_ST25”的文件中和于2012年9月12日生成的序列表在此电子提交并通过引用并入。

技术领域

本发明涉及与赋予增加的硫代葡萄糖苷水平的转录因子Myb28基因座密切关联的分子标志物的鉴定，及用于产生具有增加的硫代葡萄糖苷水平的十字花科蔬菜植物的方法。

背景技术

十字花科蔬菜植物(例如芸苔属(Brassica)植物，如花椰菜)积聚4-甲基亚硫酰基丁基硫代葡萄糖苷(萝卜硫苷)和3-甲基亚硫酰基丁基硫代葡萄糖苷(屈曲花苷)。这些硫代葡萄糖苷水解成异硫氰酸盐。流行病学研究使富含十字花科蔬菜的饮食与癌症风险的降低相关联。高硫代葡萄糖苷的十字花科蔬菜(例如，高硫代葡萄糖苷的花椰菜)已经如WO99/52345和PCT/GB2009/001648中所述产生。硫代葡萄糖苷在十字花科蔬菜植物中的产生是复杂的，如可从图4中所示的植物中硫通量的图中看到的。在本发明之前，甲基硫代烷基苹果酸合酶(methylthioalkylmalate synthase)(MAM)代谢或分子标志物用于育种计划中。已知MAM1和MAM3与高硫代葡萄糖苷性状密切相关。

本发明人令人惊异地观察到一些具有高硫代葡萄糖苷(例如，萝卜硫苷)表型的芸苔属栽培种尽管与该性状相关，但不具有MAM标志物等位基因，因此得出结论，MAM标志物并不必然与高硫代葡萄糖苷特性密切关联或对于高硫代葡萄糖苷特性是关键的，且因此其在育种中用作标志物对于追踪这一性状并不是可靠的。

因此本发明人寻找到高硫代葡萄糖苷的标志物，其可以可靠地和一致地用于确定具有增加的硫代葡萄糖苷水平的植物的基因型。

发明简述

本发明的基本发现是转录因子Myb28基因座是十字花科蔬菜植物(如芸苔属植物，例如花椰菜)中产生增加水平的硫代葡萄糖苷(特别是4-甲基亚硫酰基丁基硫代葡萄糖苷(萝卜硫苷))和3-甲基亚硫酰基丁基硫代葡萄糖苷(屈曲花苷))的关键基因座。