[发明专利]核酸序列及其作为启动子的应用

说明书

本发明涉及基因工程技术领域，尤其涉及核酸序列及其作为启动子的应用。本发明提供了新的启动子序列，其为具有如SEQ ID NO:1所示核苷酸序列的核酸；或在此片段中取代、缺失或添加一个或多个核苷酸的核酸；或与其互补或部分互补的序列。该启动子序列能够驱动蛋白在多种组织或细胞中表达。

技术领域

本发明涉及基因工程技术领域，尤其涉及核酸序列及其作为启动子的应用。

背景技术

基因表达是指基因经过转录、翻译等，产生有生物活性的RNA或蛋白，表现出其储存的遗传信息的过程，受多个水平不同因素的调控。无论在真核生物体内还是在原核生物体内，大多数的调控事件发生在转录水平。转录不仅是基因表达的第一步，还是控制基因活动的关键步骤。启动子是转录水平调控的重要参与者，一直以来备受关注。

启动子(Promoters)是RNA聚合酶识别、结合开始转录启动的一段DNA序列，它含有RNA聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列，多数位于结构基因转录起始点的上游。这样的启动子本身不被转录，但有一些启动子(如tRNA启动子)位于转录起始点的下游，这些DNA序列也可以被转录。启动子的活性受到多种因素的影响，而在基因的异源表达中，常常需要根据实际需求选择不同活性的启动子。

在进化生物学领域中，常常有一些类群特有的基因组片段。这些基因组片段只出现在某一类物种中，是这类物种所特有的。早期对于这种基因组片段的研究相对较少，对其功能的了解也较少。然而最近，越来越多的研究结果发现，这些类群特有的基因组片段，往往具有重要的生物学功能，常常和物种适应环境或是新的表型的出现相关。另一方面，以往的研究多认为生物表型的产生主要是由于基因编码蛋白的编码区的突变所导致。而基因组中大量存在的非编码区往往被认为是冗余、无功能的所谓“垃圾片段”。然而，随着近些年科学的发展，人们发现这些非编码区往往具有重要的调控作用，常常使得基因获得新的组织/细胞表达模式，并且和基因产生新的功能具有重要联系。

因此，进一步在研究中发现新的具有转录启动活性的基因组片段，以及构建不同的表达系统具有重要意义。

发明内容

有鉴于此，本发明要解决的技术问题在于提供新的核酸序列及其作为启动子的应用，该片段来自于丽鱼科(也称慈鲷科)(Cichlidae)中的奈里朴丽鱼Pundamilianyererei。

本发明提供了如I)、II)或III)中任一项所述的核酸：

I)、具有如SEQ ID NO:1所示核苷酸序列的核酸；

II)、在I)所述的片段中取代、缺失或添加一个或多个核苷酸的核酸；

III)、与I)或II)部分互补或完全互补的核酸。

一些实施例中，所述核酸的核苷酸序列如SEQ IDNO:1～3中任一项所示。

在I)所述的片段中取代、缺失或添加一个或多个核苷酸的核酸，是指与具有如SEQID NO:1所示核苷酸序列的核酸具有至少60％同源性，且具有相似功能的序列。

其中，SEQ ID NO:1所示核酸片段是来自于东非丽鱼(African cichlid fishes)中的一种，奈里朴丽鱼P.nyererei的野生型片段，长度为2125bp。SEQ ID NO:2所述的核酸片段是在SEQ ID NO:l的基础上，缺失3bp形成的核酸片段，SEQ ID NO:3来自P.nyererei的近缘物种尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)，与SEQ ID NO:1所示核酸序列具有94％的同源性。

一些具体实施例中，在如SEQ IDNO:1～3中任一项所示的核酸的3’端还包括SEQID NO:4所示的核苷酸片段。