[发明专利]成像系统硬件

说明书

一种样品保持器，包括第一构件、第二构件和对正机构，第一构件具有第一保持机构特征，第一保持机构配置为保持包括样品的第一基板，第二构件具有第二保持机构特，第二保持机构配置为保持包括试剂介质的第二基板，并且对正机构连接到第一构件和第二构件中的至少一者并配置为对正第一构件和第二构件使得当第一构件和第二构件对正时样品接触试剂介质的至少一部分。

相关申请的交叉引用

本申请要求2019年11月6日递交的临时专利申请号62/931,779 的优先权。

这些申请的全部内容以引用的方式并入。

背景技术

由于不同细胞内变化的分析物水平(例如，基因和/或蛋白质表达)，受试者组织内的细胞在细胞形态和/或功能上具有差异。细胞在组织内的特定位置(例如，细胞的相对于相邻细胞的位置或细胞的相对于组织微环境的位置)可以影响例如细胞的形态、分化、命运、活性、增殖、行为和与组织中的其它细胞的信号转导和交互作用。

先前已利用一些技术对空间异质性进行了研究，所述技术仅在接触完整组织或组织的一部分时提供针对少量分析物的数据的技术、或者提供针对单细胞的大量分析物数据，而未能提供有关单细胞在亲本生物学样品(例如组织样品)中的位置。

此外，关于空间分析物数据所使用的成像系统固有地在其分辨率和灵敏度上是可变的。这除了成像设备的布置结构、成像设备的各种类型之间的差异以及图像采集软件(的原因)之外，很大程度上还归结于针对成像系统部件的制造商的变化性。图像质量另外还受到由用户执行的图像采集的变动的影响。当试图对未知荧光强度的样品进行成像或由经验不同的用户对样品进行成像时，此问题将变得更加明显。

此外，在实验室环境中，使用各种处理方案来制备供分析用的样品。可以在试管中、在载玻片上或更一般地在由基板支撑的样品上执行这些方案。某些方案在稳定、受控的温度条件下执行，以确保样品和方案试剂的保真度。其它方案涉及温度循环及其它步骤，其中样品的温度以受控的方式被调节。为了在方案期间加热样品与其支撑基板，热循环仪、加热板或其它加热装置可被使用。作为一个示例，热循环仪可作为用于核酸扩增及转录和反转录分析序列中的聚合酶链反应方案的一部分。以热循环仪和其它加热装置对样品受控加热还可发生来促进对于例如限制性酶切消化和快速诊断的温度敏感性反应。

另外，生物样品可被置于固体支撑物上用于分析，以鉴定或特征化样品内的分析物(比如DNA、RNA或其它遗传物质)。印制的指南可有助于改善样品在固体支撑物上的置放。

发明内容

用于评估成像设备和成像系统的质量和分辨率的对照载玻片、方法和系统可利用各种基板实现。如本文中所使用的，术语“基板”指的是具有表面的支撑物(例如玻璃载玻片、水凝胶、膜层、层、多孔膜、流动池、固体材料等)。在实施例中，基板是玻璃载玻片。

“基板”如本文中所使用的且当未加修饰语“化学”或“序列分析”时指的是具有至少一个表面的构件，所述表面通常用于为生物样品、分析物和/或本文中所描述的任何其它化学的和/或物理的部分、试剂和结构(比如列阵)提供物理支撑。基板可以由以下形成：各种固体材料、基于凝胶的材料、胶体材料、半固体材料(例如至少部分交联的材料)、完全固化或部分固化的材料、以及为提供物理支撑经过相变或相转变的材料。可用在本文中描述的方法和系统中的基板的示例包括但不限于载玻片(例如由各种玻璃形成的载玻片、由各种聚合物形成的载玻片)、水凝胶、层和/或膜层、膜(例如多孔膜)、流动池、比色皿、晶片、板。在一些实施例中，基板可以可选地包括功能元素，比如凹部、突出结构、微流体元件(例如通道、贮器、电极、阀、密封件)和各种标记，如将在以下进一步详细论述的。

本公开进一步描述了用于保持或支撑基板的装置。尤其，所描述的装置包括分别接收第一和第二基板的第一和第二构件。在一些实施例中，本公开的装置可用于将第一和第二基板夹叠(sandwich)在一起，以用于空间转录组学应用。在一些实施例中，第一基板可在它的表面上支撑样品(例如，生物基质)。在一些实施例中，第二基板可包括多个条形码探针和/或透化试剂。