[发明专利]预测鼻咽癌免疫治疗疗效的标志物组及应用

说明书

本发明公开了预测鼻咽癌免疫治疗疗效的标志物组及应用，所述标志物组包括ABI3、ACP5等第一组50个基因。基于第一组50个基因组成的标志物可有效将鼻咽癌患者进行免疫分型，分为免疫富集型与免疫荒漠型，方便指导患者的免疫治疗。结合由ACTN1、AEBP1等第二组50个基因组成的标志物后，可将患者区分为免疫激活型，免疫逃避型，与免疫荒漠型三个亚组，可以更为准确地指导患者的免疫治疗。通过实验证实了鼻咽癌中免疫激活型患者接受PD‑1单抗治疗的反应性显著优于其他两型（P=0.002），证实了免疫激活型患者可从PD‑1单抗免疫治疗中获益。

技术领域

本发明涉及肿瘤的免疫治疗领域，具体涉及预测鼻咽癌免疫治疗疗效的标志物组及应用。

背景技术

鼻咽癌是我国最为常见的头颈部肿瘤，尤为好发于华南地区，也被称之为“广东瘤”，主要是以放疗为核心，辅以化疗、靶向治疗等多学科综合治疗。随着治疗方式的革新以及规范化治疗的推行，早期鼻咽癌患者的生存率以及生活质量都获得了提高，然而中晚期鼻咽癌患者的预后仍旧不佳。因此，延长鼻咽癌患者，特别是分期较严重的中晚期患者的生存时间，提高治疗相关的生活质量，成为鼻咽癌治疗研究的焦点之一。

近些年，肿瘤免疫治疗取得飞速发展，引领了肿瘤治疗领域的重大突破，特别是以PD-1/PD-L1为代表的免疫检查点抑制剂是目前肿瘤免疫治疗较为成功的领域以及研究的热点。相关免疫治疗药物，如抗PD-1单抗纳武单抗、派姆单抗、卡瑞利珠单抗等等均在临床试验中证实可有效提高晚期鼻咽癌患者的生存率，使得鼻咽癌患者在治疗中获得更大的获益。然而免疫治疗仅对部分患者有效，亟需特异性的生物标志物能够筛选合适的鼻咽癌患者，接受免疫治疗，提高治疗获益，避免过度治疗，最终达到精准医疗。而目前仍然缺乏可有效预测鼻咽癌免疫治疗疗效的标志物。

发明内容

本发明的目的在于提供预测鼻咽癌免疫治疗疗效的标志物组及应用。

本发明所采取的技术方案是：

本发明的第一个方面，提供：

预测鼻咽癌免疫治疗疗效的标志物组，包括如下第一组50个基因：ABI3、ACP5、ADAMDEC1、AIF1、ARRB2、C1QA、C1QC、C2、C3AR1、CARD16、CASP1、CCR1、CD14、CD4、CD68、CD86、CSF1R、CTSC、CTSS、CYBB、DOK2、FCER1G、FGL2、FPR3、GBP1、GBP5、GIMAP4、GIMAP6、GRN、HAVCR2、IFI30、IL10RA、ITGB2、LAIR1、LCP2、LILRB4、MNDA、MPEG1、MYO1F、PLA2G7、PLEKHO2、SLAMF8、SLC31A2、SLC7A7、SPI1、STAT1、TCN2、THEMIS2、TMEM176B和TYROBP。

在一些实例中，通过检测肿瘤组织中第一组50个基因的mRNA表达情况，并对其进行非负矩阵分解一致性聚类法二聚类将鼻咽癌患者区分为免疫富集型患者或免疫荒漠型患者。

在一些实例中，免疫富集型亚组患者高表达与免疫激活相关的指标，如免疫富集标签、效应CD8+T细胞等，而免疫荒漠型则缺乏这一特征。

在一些实例中，还包括如下第二组50个基因：ACTN1、AEBP1、BGN、CALD1、COL12A1、COL15A1、COL1A1、COL1A2、COL3A1、COL4A1、COL4A2、COL5A1、COL5A2、COL6A1、COL6A2、COL6A3、CTHRC1、CTSK、EMILIN1、EMP1、ENG、FBLN2、FILIP1L、FN1、FSTL1、FURIN、GGT5、GREM1、ISLR、LUM、METRNL、MFAP2、MMP11、MMP2、MXRA8、MYADM、MYL9、NBL1、PCOLCE、PDGFRB、PDLIM7、PMP22、POSTN、RAB31、SPARC、SPON2、SULF1、TIMP2、TPM2和TPM4。