[发明专利]一种基于靶向蛋白质组学的癌症药物靶标作用预测方法

权利要求书

1.一种基于靶向蛋白质组学的癌症药物靶标作用预测方法，其特征在于：具体包括以下步骤：

S1、收集公共数据库内的癌症药物靶标的相关信息，建立药物靶标数据库，然后针对每一个靶标，从PDB数据库中收集该药物靶标与其对应的化合物之间的相互作用关系的数据，建立化合物数据库；

S2、根据收集的药物靶标数据库和化合物数据库，将其分成靶标组与癌症药物组，然后随机从癌症药物组和靶标组选择药物和靶标构建新的药物靶标相互作用关系，通过质谱shotgun分析法分析每个重新组合的药物和靶标中蛋白质与化合物的相互作用以及相互作用中的特异性；

S3、将存在特异性的目标蛋白质进行选择性检测，筛查出各组间具有显著性差异的化合物，通过检索TTD数据库鉴定出潜在的靶点；

S4、然后将药物新的潜在靶点以及该对应的药物靶标相互作用关系记录成表格形式，对癌症药物进行重新定位预测。

2.根据权利要求1所述的一种基于靶向蛋白质组学的癌症药物靶标作用预测方法，其特征在于：所述步骤S1中公共数据库为TTD、PubMed、ChEMBL和PDB数据库，其中癌症药物靶标的相关信息主要为靶标的序列信息、名称和相关癌症疾病。

3.根据权利要求1所述的一种基于靶向蛋白质组学的癌症药物靶标作用预测方法，其特征在于：所述步骤S2中质谱shotgun分析法是一种基于高分辨、高精度质谱的离子监视技术，首先利用四级杆质量分析器的选择检测能力，在一级质谱中(Q1)选择性地检测目标蛋白质的母离子信息，随后在Collision cell中对母离子进行碎裂，最后利用高分辨、高质量精度分析器在二级质谱中检测所选择的母离子窗口内的所有碎片的信息，对复杂样本中的目标蛋白质进行准确地特异性分析。

4.根据权利要求1所述的一种基于靶向蛋白质组学的癌症药物靶标作用预测方法，其特征在于：所述步骤S2中分析每个重新组合的药物靶标相互作用关系时，癌症药物与靶标之间会存在已知的相互作用和未知的相互作用，分析时将组合中相似的药物与相似的靶标之间已知的相互作用进行筛选过滤。

5.根据权利要求1所述的一种基于靶向蛋白质组学的癌症药物靶标作用预测方法，其特征在于：所述步骤S2中质谱shotgun分析法没有物种限制并能进行多目标同时分析。