[发明专利]一种用于猪蓝耳病毒全基因组测定的成套引物对及其应用在审
| 申请号: | 202011171097.4 | 申请日: | 2020-10-28 |
| 公开(公告)号: | CN112094952A | 公开(公告)日: | 2020-12-18 |
| 发明(设计)人: | 尹革芬;毕峻龙;刘霄;赵谦;王蕾;沈学文;杨贵树 | 申请(专利权)人: | 云南农业大学 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6806;C12N15/70;C12N15/11;C12R1/93 |
| 代理公司: | 昆明合众智信知识产权事务所 53113 | 代理人: | 张玺 |
| 地址: | 650000*** | 国省代码: | 云南;53 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 用于 猪蓝耳 病毒 基因组 测定 成套 引物 及其 应用 | ||
1.一种用于猪蓝耳病毒全基因组测定的成套引物对,其特征在于:包括12对引物,12对引物分别为1引物片段、2引物片段、3引物片段、4引物片段、5引物片段、6引物片段、7引物片段、8引物片段、9引物片段、10引物片段、11引物片段和12引物片段,1引物片段包括引物序列1F:5’-ATGACGTATTGGTGTTGGCTC-3’和1R:5’-CACCATGCTTGGTTTGATAGCC-3’;2引物片段包括引物序列2F:5'-GTGCTATGGCTGACGTCTATGACA-3’和2R:5'-AAGACTTGTTGCACCACGGAGGTA-3’;3引物片段包括引物序列3F:5'-CAAGTTATTGAGGATTGCTGCTGC-3’和3R:5'-CGTGTGAGGTAACATCACAAACCC-3’;4引物片段包括引物序列4F:5'-CATGTGGGATAGGGTTGACATGCT-3’和4R:5'-CTGATCTTTAGTCCGTTCAGCTGG-3’;5引物片段包括引物序列5F:5'-ACTGTGGTCGCTCAGCCTTATGAT-3’和5R:5'-TTCCAGTTCAGGTTTGGCAGCAA-3’;6引物片段包括引物序列6F:5'-CAGGCCAGTTTTGTAATGTG-3’和6R:5'-GCGGCTAGCAGTTTAAACACTGCT-3’;7引物片段包括引物序列7F:5'-GCCCTTGGTATGATGAACGT-3’和7R:5'-AGATGTTCAACCCACCAGTGGT-3’;8引物片段包括引物序列8F:5'-CAGCACATGGTGCTCAGTTACT-3’和8R:5'-TCTGCAATTGCCTGTGTGGGTCAT-3’;9引物片段包括引物序列9F:5'-ACTCCAGTCAAGGCGCCACATT-3’和9R:5'-CTTCTGTAATTGCTCAGGGTGAACG-3’;10引物片段包括引物序列10F:5'-TCGGATACAGCGTATCTGTACGAG-3’和10R:5'-AGCCACGATGCCTGACACATT-3’;11引物片段包括引物序列11F:5'-GACATCAGCTGCCTTAGGCAT-3’和11R:5'-AACAGCTTTTCTGCCACCCAACACG-3’;12引物片段包括引物序列12F:5'-TGATAACCACGCATTTGTCGTCCG-3’和12R:5'-AATTACGGCCGCATGGTTCTCGCCA-3’。
2.一种用于猪蓝耳病毒全基因组测定的成套引物对的应用,其特征在于,包括下列步骤:
(1)感染猪蓝耳病毒的样品预处理,剪取感染猪蓝耳病毒的猪仔的组织病料新鲜切面处约2~3cm3大小,在已预冷的研钵内进行研磨,研磨充分后取病料置于离心管内备用;
(2)核酸提取,将盛有病料的离心管通过病毒病毒提取试剂盒提取RNA;
(3)扩增,取步骤(2)中提取的RNA为模板用权利要求1中每对所述引物进行RT-PCR扩增反应获得扩增产物,每对引物的片段扩增3次;
(4)分析,将扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分析,在凝胶成像系统上观察并拍照,并对观察到的结果进行统计和分析。
3.如权利要求2所述的一种用于猪蓝耳病毒全基因组测定的成套引物对的应用,其特征在于,所述步骤(3)中的RT-PCR扩增反应的猪蓝耳病毒特异性基因扩增反转录体系为:在离心管中配制模板RNA/引物混合液,2×ES Reaction Mix 5μL,2×ES Reaction Mix 5μL,EasyScriptTMⅡRT/RI Emzyme Mix 4μL,下游引物1μL,模板RNA 2μL,反应体系为12μL,42℃反应30min,然后85℃恒温5min,得到的cDNA用于PCR扩增。
4.如权利要求2所述的一种用于猪蓝耳病毒全基因组测定的成套引物对的应用,其特征在于,所述步骤(3)中RT-PCR扩增反应的PCR反应体系为:2×PCR Mix 12.5μL,10μmol/L的上游引物与10μmol/L的下游引物各0.5μL,反转录产物1μL,ddH2O 10.5μL,反应体系为25μL。
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