[发明专利]一种肺癌患者的治疗预后评估模型

说明书

本发明涉及在患有癌症特别是晚期肺癌的受试者中评估治疗预后的评价模型。本发明进一步涉及使用所述评价模型对所述受试者的治疗预后进行评估的系统和方法。

技术领域

本发明涉及生物信息学领域。具体来说，提供了一种通过建立计算模型对肺癌患者特别是晚期肺癌患者治疗预后的预测。

背景技术

肺癌是全球癌症死亡的主要原因，是我国发病率和死亡率均居首位的恶性肿瘤。70％～80％的肺癌患者就诊时已处于中晚期，错过了最佳的治疗时机，具有五年生存率低、预后差的特点。

近年来患者拥有越来越多的治疗选项，包括放疗、化疗、靶向药物，以及免疫疗法。然而，癌症患者对某种治疗的响应性具有个体差异。为了使患者特别是中晚期患者得到最有效的治疗，临床医生对晚期肺癌患者临床获益和预期生存时间的及时、可靠的评估非常重要，因为其有助于医生和患者共同选择合适的治疗方案，从而实现个体化治疗。

因此，仍需要一种方便、有效的模型来完成对治疗预后的评估。

发明内容

本申请的发明人通过统计、分析患者治疗前后的免疫状态和预后之间的关联，建立了一种在患有肺癌的受试者中基于患者的TCR多样性、血液中相关细胞类型的变化和吸烟史评估治疗预后的计算模型，由此完成了本发明。

因此，第一方面，本发明涉及一种在患有肺癌的受试者中评估治疗预后的系统，其包括：

(1)存储装置，其中存储以下信息：所述受试者是否为吸烟者，所述受试者的TCR多样性，以及所述受试者治疗前和治疗后的血常规检测结果，

(2)计算装置，其通过受试者的吸烟状态、TCR多样性以及治疗前和治疗后的血常规检测结果的变化计算风险评分，

(3)输出装置，其输出所述风险评分或基于所述风险评分预测的预后结果。

第二方面，本发明提供一种在患有肺癌的受试者中评估治疗预后的方法，包括通过受试者的吸烟状态、TCR多样性以及治疗前和治疗后的血常规检测结果的变化计算风险评分。

第三方面，本发明提供一种预测癌症治疗方法或治疗药物在受试者中的治疗效力的系统，包括：

(1)存储装置，其中存储以下信息：所述受试者是否为吸烟者，所述受试者的TCR多样性，以及所述受试者在使用所述治疗方法或治疗药物之前和之后的血常规检测结果，

(2)计算装置，其通过受试者的吸烟状态、TCR多样性以及治疗前和治疗后的血常规检测结果的变化计算风险评分，

(3)输出装置，其输出所述风险评分或基于所述风险评分预测的治疗效力。

第四方面，本发明提供一种在患有肺癌的受试者中预测癌症治疗方法或治疗药物的治疗效力的方法，包括通过受试者的吸烟状态、TCR多样性以及治疗前和治疗后的血常规检测结果的变化计算风险评分。

优选地，所述血常规检测结果包括血小板计数(P)、中性粒细胞计数(N)和淋巴细胞计数(L)。更优选地，所述计算装置计算所述受试者治疗前和治疗后的系统免疫炎症(SII)指数，所述SII指数＝P x N/L。

所述TCR多样性通过使用所述受试者的外周血构建TCR序列文库并进行测序来确定。所述TCR序列文库使用外周血DNA或外周血RNA来构建，优选使用外周血RNA来构建。优选地，所述TCR多样性是通过计算所述受试者治疗之后TCR的香农-威纳指数并以10为底对所述香农-威纳指数进行对数换算确定的TCR多样性值。所述TCR多样性是治疗前TCR多样性或治疗后TCR多样性，优选治疗后TCR多样性。

优选地，所述风险评分按照如下公式计算：