[发明专利]一种利用土壤菌群评估深海噬菌体生物安全性的方法在审
申请号: | 202011103636.0 | 申请日: | 2020-10-15 |
公开(公告)号: | CN112626186A | 公开(公告)日: | 2021-04-09 |
发明(设计)人: | 章晓波;孙旭梅 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12Q1/26;C12Q1/34;C12Q1/28;C12Q1/04;G01N21/31 |
代理公司: | 杭州求是专利事务所有限公司 33200 | 代理人: | 刘静 |
地址: | 310058 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 利用 土壤 评估 深海 噬菌体 生物 安全性 方法 | ||
1.一种利用土壤菌群评估深海噬菌体生物安全性的方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:
(1)取陆地环境中的土壤样品,分为实验组和空白对照组,每组各3个重复;
(2)向实验组中加入用SM溶液(25mM Tris-HCl,200mM NaCl,20mM MgCl2,pH=7.5)溶解的深海噬菌体,空白对照组中加入SM溶液,分别混合均匀;24h后再次分别向实验组和空白对照组中加入用SM溶液溶解的深海噬菌体和SM溶液,共处理3次;每次处理实验组和空白对照组中土壤样品与SM溶液比例为1g:20μL;
(3)再静置处理7天,分别取两组土壤样品进行总DNA提取和土壤生态功能的测定;将提取的总DNA进行基因测序并分析测序结果,统计并分析土壤生态学功能测定结果;
(4)将实验组的实验结果与空白对照组的结果进行比较,若测序结果表明在深海噬菌体的影响下,存在细菌的丰度在实验组的三个重复中均发生改变而且实验组的土壤生态学功能发生了显著性降低(n=3,p0.01),则说明该深海噬菌体存在生物安全性问题。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,土壤样品中的土壤微生物菌群作为评估深海噬菌体生物安全性的模型,取自日常生活环境周围的陆地环境。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述基因测序采用的测序方法为16S rRNA基因测序。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述土壤生态学功能的测定包括:土壤脲酶酶活、土壤纤维素酶酶活、土壤硝酸还原酶酶活、土壤锰过氧化物酶酶活、土壤铵态氮含量、土壤硫元素转化能力、土壤铁离子还原能力。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所用的深海噬菌体为由不同的深海沉积物样品中分离的混合噬菌体。
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