[发明专利]一种胎儿亲子关系鉴定方法

权利要求书

1.一种胎儿亲子关系鉴定方法，其特征在于，包括如下步骤：

(a)根据孕妇人群的基因序列，选定具有多样性差异的位点组，并记为G；

(b)获取待检孕妇外周血游离DNA、白细胞DNA以及待检疑父DNA，并分别对待检孕妇外周血游离DNA、白细胞DNA以及待检疑父DNA中与G相同的位点进行高深度测序，并根据测序结果获得外周血游离DNA中各个位点的深度分布，白细胞DNA中各个位点的基因型，以及待检疑父DNA中各个位点的基因型；

(c)基于待检孕妇白细胞DNA中各个位点的基因型和外周血游离DNA中各个位点的深度分布，选取位点集，并记为G1，G1选取条件为：测序深度高于阈值时，该位点上至少有2种多态性位点，且对应于白细胞DNA上为纯合子；随后，对选取的G1上多态性位点的深度分布采用最大似然法获得胎儿DNA在待检孕妇外周血DNA中的浓度，并记为P1，其中，P1为使得式1取得最大值的p值，

式1中，p为胎儿DNA在待检孕妇外周血DNA中的浓度，Xi为相应位点的多态性深度分布；

(d)基于待检孕妇白细胞DNA中各个位点的基因型和待检疑父DNA中各个位点的基因型，选取位点集，并记为G2，G2选取条件为：待检孕妇白细胞DNA和待检疑父DNA为不同基因型纯合子的位点；随后，基于待检孕妇外周血游离DNA在G2上多态性位点的深度分布采用最大似然法获得胎儿DNA在待检孕妇外周血DNA中的浓度，并记为P2，其中，P2为使得式2取得最大值的p值，

(e)选取和待检孕妇和待检疑父无亲缘关系的随机男性DNA样本N个，并记为Fi,再根据步骤(d)计算每位随机男性对应的P2(i)，其中，i为1，2，3…N；

(f)按照H＝P2/P1和Hi＝P2(i)/P1分别计算H值和Hi值，并根据H值与{Hi}的显著性差异确定待检疑父与待检孕妇所怀胎儿的亲子关系。

2.根据权利要求1所述的鉴定方法，其特征在于，所述步骤(f)中，根据H值与{Hi}的显著性差异确定待检疑父与待检孕妇所怀胎儿的亲子关系包括：

若H值显著大于{Hi}，则待检疑父与待检孕妇所怀胎儿为亲子关系，若H值与{Hi}没有显著性差异，则待检疑父与待检孕妇所怀胎儿为非亲子关系。

3.根据权利要求1所述的鉴定方法，其特征在于，所述步骤(a)中，孕妇人群中孕妇数量不低于50人。

4.根据权利要求1所述的鉴定方法，其特征在于，所述步骤(b)中，高深度测序的深度不低于20×。

5.根据权利要求1所述的鉴定方法，其特征在于，所述步骤(c)中，所述阈值为20×。

6.根据权利要求1所述的鉴定方法，其特征在于，所述步骤(e)中，N大于20。

7.根据权利要求1或2所述的鉴定方法，其特征在于，所述步骤(f)中，采用t检验判断H值与{Hi}的显著性差异。