[发明专利]一种鉴别人参属植物单核苷酸多态的系统以及鉴别方法有效
申请号: | 202011085927.1 | 申请日: | 2020-10-12 |
公开(公告)号: | CN112176089B | 公开(公告)日: | 2022-12-30 |
发明(设计)人: | 李志恒;奥伯克·克里斯托弗 | 申请(专利权)人: | 珠海澳加动力生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6827;C12Q1/6834;C12N15/11 |
代理公司: | 重庆强大凯创专利代理事务所(普通合伙) 50217 | 代理人: | 蒙捷 |
地址: | 519000 广东省珠海市横琴新区环岛北路252*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴别 人参 植物 核苷酸 系统 以及 鉴别方法 | ||
1.一种基于鉴别人参属植物单核苷酸多态的系统的鉴别方法,其特征在于:所述人参属植物包括西洋参和人参两种;所述系统包括用于检测DNA模板的检测单元;所述检测单元包括固定片段和LIDA混合溶液,所述固定片段的5’端固定在固相支持物上;LIDA混合溶液包括终浓度为30µM的游离片段、终浓度为30µM的特异性片段、终浓度为25 µM的检测片段、终浓度为25 µM的通用片段、连接酶反应缓冲液、终浓度为1.25 U/μL的T4 DNA连接酶;T4DNA连接酶为5 U/µL规格的TF连接酶;连接酶反应缓冲液的成分为:50 mM Tris-HCl、10 mMMgCl2、1 mM ATP、10 mM DTT,pH值为7.5,连接酶反应缓冲液和LIDA混合溶液的体积比为1:2;LIDA混合溶液中的镁离子的终浓度为20mM;
在检测人参的SNP位点时,固定片段为:NH2-5’-CAATTTAAG-3’;特异性片段为:5’-TCTTAAATTG-3’;检测片段为:5’-AbCACTTTC-3’-bio;通用片段为:5’-GAAAGTG-3’;游离片段为:NH2-5’-CAATTTAAG-3’;
在检测西洋参的SNP位点时,固定片段为:NH2-5’-CAATTTAAA-3’;特异性片段为:5’-TTTTAAATTG-3’;检测片段为:5’-AbCACTTTC-3’-bio;通用片段为:5’-GAAAGTG-3’;游离片段为:NH2-5’-CAATTTAAA-3’其中,NH2表示5’端氨基修饰,bio表示3’端生物素修饰,Ab表示无碱基功能团;
所述鉴别方法包括以下步骤:
(1)探针固定和模板获取:将固定片段固定在固相支持物上;从样品中获得Ⅰ类模板;
(2)连接过程:包括用于检测人参SNP位点的连接过程:使LIDA混合溶液、Ⅰ类模板与固定片段接触并进行4h的LIDA连接反应,获得第一连接产物;还包括用于检测西洋参SNP位点的连接过程;使LIDA混合溶液、Ⅰ类模板与固定片段接触并进行4h的LIDA连接反应,获得第二连接产物;
(3)检测第一连接产物的荧光信号,荧光信号的强度计为F1;检测第二连接产物的荧光信号,荧光信号的强度计为F2;当F1/F2>2时,样品含有纯的人参;当F1/F2<0.5时,样品含有纯的西洋参;当0.5≤F1/F2≤2时,样品含有人参和西洋参。
2.根据权利要求1所述的一种基于鉴别人参属植物单核苷酸多态的系统的鉴别方法,其特征在于:所述无碱基功能团为1’,2’-双脱氧核糖。
3.根据权利要求1所述的一种基于鉴别人参属植物单核苷酸多态的系统的鉴别方法,其特征在于:所述固相支持物为微流控生物芯片的醛基化的载玻片。
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