[发明专利]一种区分荔枝品种的SSR引物组及其应用

说明书

本发明属于分子生物学的技术领域，具体涉及一种区分荔枝品种的SSR引物组及其应用。所述SSR引物组包括6组荔枝SSR引物对，所述6组荔枝SSR引物对中的正向引物和引物的核苷酸序列分别如序列表中SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.12所示。所得SSR引物在荔枝中扩增的带型清晰容易判读，同时适合普通变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测平台和毛细管荧光检测平台检测，所述SSR引物的多态性高且扩增重复性好；本发明的SSR引物应用于荔枝遗传多样性分析、品种区分鉴定、DNA指纹图谱构建等领域，有利于保护育种者、生产者和消费者的合法权益，促进荔枝产业的良性发展。

技术领域

本发明属于分子生物学的技术领域，具体涉及一种区分荔枝品种的SSR引物组及其应用。

背景技术

荔枝原产于中国，至今已有2000多年的栽培历史。野生种质资源与栽培品种达到500余份，据统计，2018年，国内荔枝栽培面积达到860万亩，年产量60多万吨，栽培面积与年产量均居世界首位。

荔枝作为我国华南地区特有的热带亚热带果树，具有较高的经济价值。荔枝为常绿乔木，可以用于改善生态环境。而且树干木材坚实，耐腐，可用于家具制作；一些栽培时间长的荔枝树根造型好，甚至比红木更适合做根雕。荔枝果肉味酸甜，可进入心脏、脾脏和肝脏的经络，还具有止嗝、止腹泻和促进食欲的功效。是人们十分喜爱的南方水果，每年六月份为果农带来不小的经济效益。荔枝食用后的果壳也有很高的利用价值，果壳内富含的多酚和原花青素在食品科学和医学已得到广泛利用。虽然荔枝不耐贮藏，但可加工成罐头保质期达到1年之久，还可以通过利用荔枝干加工技术和荔枝果汁加工技术充分发挥荔枝的经济价值。

近年来，随着我国对品种权保护的重视程度越来越高，每年育种家和科研单位育成和申请品种权保护的品种数量也越来越多，如何快速准确的进行品种区分就变得十分重要。荔枝由于无性繁殖及多年生特性，极易造成市场上发生“一品多名”、“多品一名”以及假冒侵权等现象；并且利用传统的鉴定方法将鉴定品种种植在相同的生长条件下，在生长发育的各个阶段对多个质量性状、数量性状及抗病性等做出观察记载，并进行品种比较，鉴定品种的异同。该方法明显存在鉴定周期长、易受环境影响、测试性状多、工作量大等问题，无法适应大量品种的鉴定需求。因此快速鉴定区分荔枝品种，是激励荔枝育种创新，维护市场公平竞争良好环境的迫切需求。

分子标记技术可以从基因层面直接反应荔枝品种间的亲缘关系，并且可以把各个品种特有的基因型反应出来，形成能代表品种特有的“指纹图谱”，从而在一定程度上弥补表型性状鉴定周期长、性状观测易受主观性和环境条件影响的不足，能够较快速地解决以无性繁殖为主的果树中“一品多名”、“多品一名”问题。AFLP、RAPD、ISSR、SRAP等分子标记技术在荔枝亲缘关系鉴定、遗传多样分析和品种鉴定上已有应用研究。但是，RAPD重复性较差；AFLP操作较复杂，稳定性较差；RFLP操作过程繁琐，效率低，成本高；ISSR标记大多是显性标记，不能有效区分显性纯合基因型和杂合基因型。

发明内容

针对上述问题，本发明的目的在于提供一种区分荔枝品种的SSR引物组及其应用，所述SSR引物组扩增稳定、电泳条带清洗、多态性丰富，可有效用于荔枝遗传多样性分析、DNA指纹图谱构建和品种区分鉴定等研究。

本发明的技术内容如下：

本发明提供了一种区分荔枝品种的SSR引物组，所述SSR引物组包括6组荔枝SSR引物对，所述6组荔枝SSR引物对中的正向引物和反向引物的核苷酸序列分别如序列表中SEQID NO.1～SEQ ID NO.12所示。

所述区分荔枝品种的SSR引物组应用于包括荔枝遗传多样性分析、品种区分鉴定以及DNA指纹图谱构建。

本发明还提供了一种所述SSR引物组用于区分荔枝品种的方法，包括如下步骤：

1)提取荔枝品种的DNA；