[发明专利]基于胃癌组织病理图像纹理特征的MSI预测模型构建方法在审
| 申请号: | 202011052554.8 | 申请日: | 2020-09-29 | 
| 公开(公告)号: | CN112183557A | 公开(公告)日: | 2021-01-05 | 
| 发明(设计)人: | 阎婷;安卫超;张楠;王彬 | 申请(专利权)人: | 山西医科大学 | 
| 主分类号: | G06K9/46 | 分类号: | G06K9/46;G06K9/62;G16B40/00 | 
| 代理公司: | 成都东恒知盛知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 51304 | 代理人: | 何健雄;廖祥文 | 
| 地址: | 030000 *** | 国省代码: | 山西;14 | 
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 基于 胃癌 组织 病理 图像 纹理 特征 msi 预测 模型 构建 方法 | ||
1.一种基于胃癌组织病理图像纹理特征的MSI预测模型构建方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤1、获取胃癌患者的组织病理图像、病灶部位的标记以及临床病理信息;
步骤2、针对胃癌患者的组织病理图像,提取原始图像的纹理特征和经过小波变换后的纹理特征;
步骤3、使用LASSO对步骤2中得到的纹理特征进行特征选择,选择10倍交叉验证误差最小时的λ值对应的非零系数特征,得到筛选后的纹理特征;
步骤4、根据步骤3所选择的纹理特征的特征值及其系数权重进行线性拟合,从而得到胃癌患者的MSI标签;
步骤5、结合步骤4得到的MSI标签和患者的临床病理信息构建MSI预测模型。
2.根据权利要求1所述的基于胃癌组织病理图像纹理特征的MSI预测模型构建方法,其特征在于,步骤2中提取的纹理特征包括一阶统计量、灰度共生矩阵、灰度大小区域矩阵、灰度游程长度矩阵、相邻灰度色调差异矩阵和灰度依赖矩阵。
3.根据权利要求1所述的基于胃癌组织病理图像纹理特征的MSI预测模型构建方法,其特征在于,步骤3中LASSO筛选图像纹理特征的具体操作包括:
1)对步骤2中提取到的纹理特征应用LASSO回归,对高维数据执行特征选择并进行正则化,通过惩罚估计函数提高预测准确性,将L1惩罚项添加到普通线性模型,估计为:
其中Y是预测标签,X为特征向量,λ为正则化系数,λ0,随着参数λ变大,大多数协变量系数缩小为零;βj为第j个特征的权重系数,d是特征矩阵的维度;
2)选择交叉验证误差最小时为模型最优值,筛选出系数不为0的特征作为与MSI状态最相关的纹理特征。
4.根据权利要求1所述的基于胃癌组织病理图像纹理特征的MSI预测模型构建方法,其特征在于,步骤4中构建胃癌患者的MSI标签具体操作包括:
根据步骤3所筛选的纹理特征按各自系数权重及对应特征值进行线性拟合,MSI标签计算公式如下:
MSI-tag=FeatureValvei*αi
其中αi是第i个特征的系数,Feature Valvei是患者第i个特征值;
计算后得到胃癌患者的MSI标签。
5.根据权利要求1所述的基于胃癌组织病理图像纹理特征的MSI预测模型构建方法,其特征在于,步骤5中构建MSI预测模型的具体操作包括:
结合临床病理信息和影像分数,通过logistics回归构建预测模型,并绘制Nomogram图将预测模型可视化。
6.根据权利要求1所述的基于胃癌组织病理图像纹理特征的MSI预测模型构建方法,其特征在于,所述LASSO以缩小特征集为思想,是一种收缩估计方法,LASSO能够将特征的系数进行压缩并使某些回归系数变为0,进而达到特征选择的目的。
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