[发明专利]用于鉴定坛紫菜薄叶品系HR-5的InDel分子标记和方法

说明书

本发明公开了用于鉴定坛紫菜薄叶品系HR‑5的InDel分子标记和方法，属于植物分子生物学领域。本发明的InDel分子标记序列如SEQ ID NO:1所示，用于扩增该标记的引物InDel‑3，其序列为F:ggggatggcagttttac；R:gaatcttcatttcgtggtg。方法如下：提取坛紫菜的丝状体或叶状体基因组DNA，使用InDel‑3引物进行PCR扩增，扩增产物电泳检测，若可检测到一条长度为89bp的特异性条带，则判断该坛紫菜为HR‑5品系。本方法只需一次简单的PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳即可鉴别HR‑5品系，操作简单，快速，不受环境因素影响。

技术领域

本发明属于植物分子生物学领域，具有涉及一种用于鉴定坛紫菜薄叶品系 HR-5的InDel分子标记和方法。

背景技术

紫菜（ Pyropia/  Porphyra spp.）因味道鲜美、营养价值高，被人们广泛食用，在中日韩三国被大规模栽培。紫菜栽培不仅产生了较大的经济价值，而且对栽培海区的生态修复也具有重要效果。目前，在我国被大规模人工栽培的紫菜有温水性的坛紫菜（ Pyropia haitanensis）和偏冷水性的条斑紫菜（ Pyropia yezoensis），前者主要被栽培在福建、浙江和广东三省，后者被栽培于江苏和山东二省。2017年，我国紫菜产业规模达72977 hm², 年产量135251 t, 居世界首位，其中坛紫菜的产量约占全国紫菜总产量的78%。但它的产值却与产量只占22％左右的条斑紫菜相当，其主要原因是两种紫菜所适用的加工方式不同所致。

紫菜的藻体厚薄不仅制约着初级产品的加工方式，也影响了二次产品的附加值提升。条斑紫菜因藻体薄，适合于全自动机械化加工，初级产品经二次精深加工后，可被制成高附加值的可用于制作寿司等的菜饼。坛紫菜则因藻体较厚，绝大部分被加工成价值低廉的初级饼菜进行销售，无法再次加工成具有高附加值的二次产品。近年来，以厚度为选育目标，已选育出数个薄叶型的坛紫菜新品系，其中 HR-5品系的藻体厚度远低于传统的坛紫菜栽培种，且具有生长快、主要光合色素和色素蛋白含量高以及壳孢子放散量大等优良特性（ Ding HC, Lv F, Wu HX, Yan XH. Selection and characterization of an improved strain produced by interspecies hybridization between Pyropia sp. from India and Pyropia haitanensis from China. Aquaculture, 2018, 491: 177-183）。 HR-5品系的初步海区中试结果显示，该品系适宜大规模的生产栽培，其鲜菜有望被二次深加工成具有较高附加值的产品（ Ding HC, Wang TG, Zhang P, Lu YD, Yan XH. High-temperature resistance of the thin-blade strain of Pyropia haitanensis and its pilot cultivation in mariculture farm. Journal of Applied Phycology, 2020, 32: 2261-2270）。为了将 HR-5品系培育成一个可推广的新品种，需要得到该品系的可靠特异性标记，用于种质鉴定和产权保护。