[发明专利]一种评价猪达100kg体重日龄的分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种与猪达100kg体重日龄相关的SNP标记及其应用、检测所述SNP标记的多态性或基因型的物质及其应用、鉴定或辅助鉴定猪的生长速度的方法、筛选或辅助筛选达100kg体重日龄低的猪品种的方法、猪的遗传改良方法。所述与猪达100kg体重日龄相关的SNP标记位于猪参考基因组10.2版本4号染色体的核苷酸7,185,799处，存在A/G突变，该SNP位点的基因型为AA的猪达100kg体重日龄显著低于AG和GG基因型个体。本发明公开的与猪达100kg体重日龄相关的SNP标记，能够进行标记辅助选择，缩短猪育种周期，显著提高猪的生长速度，促进达100kg体重日龄低的猪品种的选育；公开的猪的遗传改良方法，能够加快猪达100kg体重日龄的遗传进展，减少猪生长性状的育种时间，有效提高猪育种的经济效益。

技术领域

本发明属于分子生物学技术领域，具体涉及与猪校正达100kg体重日龄相关的SNP标记及其检测方法和应用。

背景技术

在我国，猪肉消费量占肉类总量的68％左右，人口的增长及对猪肉需求的上升意味着养猪业有着更大的潜在市场。而在影响养猪业生产效率的诸多因素中，猪种的遗传因素起着主导作用，只有充分地利用现有的猪种资源，培育出具有优良生产性能的品种或品系，才能在同样饲养条件和投入下，获得养猪生产最大的产出和效益。因此，对猪品种的遗传改良格外重要。

若要改良群体的生产性能，必须在每一个世代对群体中每个个体的遗传价值进行评定，选择理想的个体作为种畜，从而保证群体的遗传水平向期望的方向发展。100kg体重日龄，是待测目标猪群体重在80-105kg范围内时，对其体重进行测量，然后按照达100kg体重日龄校正公式计算得到。该性状可以反映猪个体生长速度，同时也可以作为产肉速率这一生长性状的重要指标。

目前，基于高通量测序技术开发出的SNP芯片，使全基因组关联分析(genome-wideassociation studies,GWAS)逐渐成为一种鉴定畜禽经济性状重要候选基因的主流策略。GWAS是指将基因组范围内的单核苷酸突变作为分子标记，与人类及畜禽上一些疾病及复杂性状进行关联分析，从而鉴定出与目标性状相关的遗传变异。早在1996年，Risch等首次提出了全基因组关联分析的概念。其基本原理是：在特定群体中选择病例组或对照组，比较全基因组范围内SNP位点的基因型频率在不同分组间的差异，若某个位点的基因型在不同分组中的差异显著，则认为该位点与目标性状相关，并根据其物理位置推断候选基因。

目前，在猪的遗传改良中，对猪达100kg体重日龄相关基因的研究不足，缺少功能明确、效应显著且可直接用于育种的与猪达100kg体重日龄相关的SNP标记。

发明内容

为了克服上述问题，本发明人进行了锐意研究，提出了一种与猪达100kg体重日龄相关的SNP标记及其应用、检测所述SNP标记的多态性或基因型的物质及其应用、鉴定或辅助鉴定猪的生长速度的方法、筛选或辅助筛选达100kg体重日龄低的猪品种的方法、猪的遗传改良方法等。所述与猪达100kg体重日龄相关的SNP标记位于猪参考基因组10.2版本4号染色体的核苷酸7,185,799处，存在A/G突变，该SNP位点的基因型为AA的猪达100kg体重日龄显著低于AG和GG基因型个体。利用所述SNP标记能够进行标记辅助选择，缩短猪育种周期，显著提高猪的生长速度，加快猪的遗传进展，有效提高猪育种的经济效益，从而完成了本发明。

具体来说，本发明的目的在于提供以下方面：

本发明提供了一种SNP标记，其为猪基因组上的一个SNP位点，所述SNP标记与猪达100kg体重日龄相关。

其中，所述SNP标记位于猪参考基因组10.2版本4号染色体的核苷酸7,185,799处，碱基类型为A或G。

其中，所述SNP标记的基因型是AA、AG和GG，

SNP标记的基因型为AA的猪达100kg体重日龄显著低于AG和GG基因型个体。