[发明专利]蝶叶侧柏SSR标记的指纹图谱及其构建方法与应用有效
| 申请号: | 202011020870.7 | 申请日: | 2020-09-25 |
| 公开(公告)号: | CN112029894B | 公开(公告)日: | 2022-10-21 |
| 发明(设计)人: | 刘国彬;曹均;张玉平;廖婷;王烨;郭丽琴;姚砚武 | 申请(专利权)人: | 北京市农林科学院 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 白艳 |
| 地址: | 100097 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 侧柏 ssr 标记 指纹 图谱 及其 构建 方法 应用 | ||
1.成套引物在如下1)和/或2)中的应用:
1)鉴定或辅助鉴定待测植物是否为蝶叶侧柏;
2)区分或辅助区分蝶叶侧柏与其他非蝶叶侧柏;
所述成套引物,其由引物对1至引物对8组成;
所述引物对1由序列表中序列1所示的单链DNA分子和序列表中序列2所示的单链DNA分子组成;
所述引物对2由序列表中序列3所示的单链DNA分子和序列表中序列4所示的单链DNA分子组成;
所述引物对3由序列表中序列5所示的单链DNA分子和序列表中序列6所示的单链DNA分子组成;
所述引物对4由序列表中序列7所示的单链DNA分子和序列表中序列8所示的单链DNA分子组成;
所述引物对5由序列表中序列9所示的单链DNA分子和序列表中序列10所示的单链DNA分子组成;
所述引物对6由序列表中序列11所示的单链DNA分子和序列表中序列12所示的单链DNA分子组成;
所述引物对7由序列表中序列13所示的单链DNA分子和序列表中序列14所示的单链DNA分子组成;
所述引物对8由序列表中序列15所示的单链DNA分子和序列表中序列16所示的单链DNA分子组成;
若待测植物的8对引物扩增结果满足如下条件,则待测植物为或候选为蝶叶侧柏;
若待测植物的8对引物扩增结果不满足如下条件,则待测植物不为或候选不为蝶叶侧柏;
所述条件为所述引物对1扩增产物为127bp和156bp;且所述引物对2扩增产物为233 bp和241 bp;且所述引物对3扩增产物为107 bp和109 bp;且所述引物对4扩增产物为153 bp和169bp;且所述引物对5扩增产物为235 bp和246 bp;且所述引物对6扩增产物为104 bp;且所述引物对7扩增产物为257 bp和265 bp;且所述引物对8扩增产物为184 bp和192 bp。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述成套引物的各个引物对中一条引物荧光标记。
3.一种鉴定或辅助鉴定待测植物是否为蝶叶侧柏的方法,包括如下步骤:
1)用成套引物扩增待测侧柏的基因组DNA,得到PCR扩增产物;
所述成套引物,其由引物对1至引物对8组成;
所述引物对1由序列表中序列1所示的单链DNA分子和序列表中序列2所示的单链DNA分子组成;
所述引物对2由序列表中序列3所示的单链DNA分子和序列表中序列4所示的单链DNA分子组成;
所述引物对3由序列表中序列5所示的单链DNA分子和序列表中序列6所示的单链DNA分子组成;
所述引物对4由序列表中序列7所示的单链DNA分子和序列表中序列8所示的单链DNA分子组成;
所述引物对5由序列表中序列9所示的单链DNA分子和序列表中序列10所示的单链DNA分子组成;
所述引物对6由序列表中序列11所示的单链DNA分子和序列表中序列12所示的单链DNA分子组成;
所述引物对7由序列表中序列13所示的单链DNA分子和序列表中序列14所示的单链DNA分子组成;
所述引物对8由序列表中序列15所示的单链DNA分子和序列表中序列16所示的单链DNA分子组成;
2)将所述PCR扩增产物进行检测;
若待测侧柏的8对引物扩增结果满足如下条件,则待测侧柏为或候选为蝶叶侧柏;
若待测侧柏的8对引物扩增结果不满足如下条件,则待测侧柏不为或候选不为蝶叶侧柏;所述条件为所述引物对1扩增产物为127bp和156bp;且所述引物对2扩增产物为233 bp和241 bp;且所述引物对3扩增产物为107 bp和109 bp;且所述引物对4扩增产物为153 bp和169bp;且所述引物对5扩增产物为235 bp和246 bp;且所述引物对6扩增产物为104 bp;且所述引物对7扩增产物为257 bp和265 bp;且所述引物对8扩增产物为184 bp和192 bp。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于:所述成套引物的各个引物对中一条引物荧光标记。
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