[发明专利]一种水稻白叶枯病抗性基因Xa1的分子标记、扩增引物及其应用

权利要求书

1.一种水稻白叶枯病抗性基因Xa1的分子标记，其特征在于，所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID No:3所示。

2.一种用于扩增水稻白叶枯病抗性基因Xa1的分子标记的引物，包括上游引物和下游引物，其特征在于，所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID No:1所示；所述下游引物的核苷酸序列如SEQ ID No:2所示。

3.权利要求1所述分子标记或权利要求2所述引物在辅助水稻育种中的应用。

4.权利要求1所述分子标记或权利要求2所述引物在水稻种质资源鉴定中的应用。

5.权利要求1所述分子标记或权利要求2所述引物在鉴定水稻白叶枯病抗性基因Xa1基因型中的应用。

6.一种鉴定水稻白叶枯病抗性基因Xa1基因型的方法，其特征在于，包括以下步骤：

1)利用权利要求2所述引物对待测水稻样品基因组DNA进行PCR扩增，获得扩增产物；

2)对所述扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳，根据电泳图中扩增条带的大小判断水稻的抗性：

当检测到472bp条带，则所述待测水稻样品含有Xa1抗病等位基因。

7.根据权利要求6所述方法，其特征在于，所述PCR扩增的反应程序为94℃预变性4min；95℃变性15s，55℃退火30s，72℃延伸30s，30个循环；最后72℃延伸5min。

8.根据权利要求6或7所述方法，其特征在于，所述PCR扩增的反应体系为10μL，具体如下：10×PCR反应缓冲液1μL、DNA模板1μL、2.5mmol/L dNTP 1μL、5.0μmol/L上游引物1μL、5.0μmol/L下游引物1μL、Taq DNA聚合酶0.25μL和ddH₂O 4.75μL。

9.根据权利要求6或7所述方法，其特征在于，所述琼脂糖凝胶的质量浓度为2％。