[发明专利]一种新型冠状病毒感染的外周血TCR标志物及其检测试剂盒和应用

说明书

本发明公开了一种新型冠状病毒感染的外周血TCR标志物及其检测试剂盒和应用，该标志物包括序列SpecSeq1‑100所示蛋白中的至少一种。本发明基于高通量测序方法，只需要采取少量外周血，提取RNA，通过对样本的处理建立免疫图谱文库，再经过高通量测序和TCR数据分析，首先确定新型冠状病毒感染外周血中特征性TCR序列，然后将待测样本测试结果与该特征性TCR序列比对，从而确定是否患有新型冠状病毒感染。本发明能够同时比较巨大数量的新型冠状病毒感染特异性TCR序列，相比单独检测一种或几种标记物，具有更高的特异性和准确性，提高了诊断效率。

技术领域

本发明属于基因工程技术领域，尤其涉及一种新型冠状病毒感染的外周血TCR标志物及其检测试剂盒和应用。

背景技术

新型冠状病毒(SARS-Cov-2)传染性强、危害大、目前尚未有特效的治疗药物。全球新冠病毒感染确诊人数已经超过1千万人，导致50万人死亡。

目前针对新冠病毒感染的诊断手段主要有病毒核酸检测、血清学IgM和IgG检测、双肺CT。新冠病毒核酸检测主要依赖PCR扩增反应，可以从待检样本中检测出是否有病毒核酸基因，因此是检测新型冠状病毒的标准。血清学IgM和IgG检测，则是通过检测病毒感染后体液免疫反应。血清学IgM和IgG抗体检测是早期感染的辅助诊断依据。IgM抗体阳性，表明已经感染了新冠病毒。一般新冠病毒感染后5-7天，人体会产生病毒抗原特异性IgM抗体反应，但IgM抗体反应维持时间短，很快就消失了。新冠病毒感染后10-15天，人体会产生病毒抗原特异性IgG抗体反应。病毒特异性IgG抗体可以在血液中保持很长时间。IgG抗体阳性，表示曾经感染过新冠病毒并且已经产生了一定的免疫抵抗力。但是，新冠病毒感染后，并不是所有的人都会产生IgM或者IgG抗体。

人体内的B淋巴细胞和T淋巴细胞是获得性免疫系统中重要的两类细胞。B细胞通过细胞表面的BCR识别抗原，后期BCR在B细胞分化成浆细胞时，表达成抗体，分泌到细胞外。T细胞通过细胞表面的TCR识别抗原。BCR和TCR的多样性是建立获得性免疫系统的基础。BCR多样性的理论值是10¹⁸，TCR多样性的理论值是10¹⁴。在各种疾病中，随着不同的抗原刺激，BCR和TCR的多样性或者表达水平都会发生改变。因此，利用BCR或者TCR高通量测序结果可以追踪疾病的发生发展。病毒感染人之后，人体最早的特异性免疫反应是T细胞反应。从病毒感染人的第二天起，就有特异性的T细胞反应。第四天以后才会有B细胞反应，产生IgM抗体；第十天以后才会产生IgG抗体。

目前针对新冠病毒感染的诊断手段主要有病毒核酸检测、血清学IgM和IgG检测、双肺CT。这三种方法都有各自的缺点。核酸检测由于取样的限制，会有30％-40％的假阴性，就是检测不出病毒核酸。血清学IgM和IgG检测依赖于新冠病毒感染后病人产生特异性的抗体反应。新冠病毒感染后需要有持续的病毒抗原才能刺激B细胞产生特异性的抗体反应。而双肺CT检测需要病人已经有了肺部损伤，发生了病变。

发明内容

本发明的目的在于：针对现有技术中存在的不足，提供一种新型冠状病毒感染的外周血TCR标志物及其检测试剂盒和应用。

本发明采用的技术方案如下：

一种新型冠状病毒感染的外周血TCR标志物，包括序列SpecSeq1-100所示蛋白中的至少一种，如表1所示：

表1标志物序列

进一步地，标志物的蛋白序列为SpecSeq1-100所示的序列经取代、缺失和/或替换一个或多个碱基后，能表达相同功能的蛋白。

上述的标志物在制备检测或治疗新型冠状病毒感染的制剂中的应用。