[发明专利]一种鉴定大豆抗大豆花叶病毒SC3株系的SSR标记CH0211及其检测方法和应用

说明书

本发明公开了一种鉴定大豆对大豆花叶病毒(Soybean Mosaic Virus,SMV)流行株系SC3抗性鉴定的SSR标记CH0211及其检测方法和应用，通过利用新开发的与抗大豆花叶病毒SC3株系基因紧密连锁的SSR标记CH0211对大豆品种进行抗病性选择，以期获得抗SMV SC3株系的大豆新种质。本发明避免了大豆常规抗花叶病毒育种的周期长、工作量大、选择效率低、抗病表型选择易受环境影响等缺点，可大幅提高抗病育种选择效率，为对基因型的直接选择提供了可能，将极大地推动大豆抗病育种进程。

技术领域

本发明属于生物检测领域，具体涉及一种鉴定大豆抗大豆花叶病毒流行株系SC3品种的SSR标记CH0211及其检测方法和应用。

背景技术

大豆花叶病毒(Soybean Mosaic Virus,SMV)病是大豆生产中最常见、危害最为严重的病毒害之一，严重危害大豆的产量与品质(图2)。传统抗SMV育种需要人工接种鉴定每个后代家系的抗病性，耗时费力、且易受到环境(尤其是温度)等条件的限制，从而影响抗性材料表型的选择。随着现代分子生物学的发展，现代生物技术的进步为作物育种提供了强有力的帮助，分子标记辅助选择育种(Molecular Marker-Assisted Selection,MAS)作为其中一项重要技术，它与传统抗SMV育种相比，MAS技术可对抗病基因直接选择，能够更加高效、精准地选择抗SMV个体，大幅提高育种效率。

微卫星序列(Simple Sequence Repeat,SSR)标记具有重复性好，多态性高，共显性等优点，广泛分布在大豆基因组中。目前SSR标记已被广泛运用于MAS中，利用与抗病相关的SSR标记检测种质抗SMV的准确率较高，且快速、简便，可直接用于大豆抗SMV育种。

国内目前已经筛选了一些与抗SMV相关的分子标记，一些专家也利用这些标记进行抗SMV的辅助筛选，但筛选的标记选择与表型选择符合率不高，且所用材料样本偏小。滕卫丽等利用与SMV1抗性相关的SSR标记Satt114、Satt362、HSP176、Satt510、Satt334、Sct033和与SMV3抗性相关的SSR标记Satt114、Satt362，分别对70份大豆种质资源接种东北株系(SMV1和SMV3)进行抗性鉴定，验证结果表明SSR标记鉴定准确率分别为70.7％和75.6％。韩英鹏等利用SSR标记Satt114对146个F_2：5重组自交家系进行接种N1株系后的抗性鉴定，得出分子辅助选择的符合率为87.5％。李文福等用6个与大豆花叶病毒抗性相关的SSR标记Sat_229、Sat_317、Satt335、Satt160、Satt516和Sat_309对186份种质资源接种SMV1株系后进行检测，6个标记中Sat_317、Satt335、Satt516对抗病资源筛选的准确率70％以上。栾晓燕等利用分离群体分组分析法(Bulked Segregant Analysis,BSA)建立的F₂群体DNA抗感池中鉴定出与抗性表型紧密相关的SSR标记Satt296，该标记位于D1b连锁群，推测该标记有望用于大豆抗SMV3株系的分子标记辅助选择。

发明内容

本发明目的在于提供一种鉴定大豆抗大豆花叶病毒流行株系SC3的SSR标记CH0211及其检测方法和应用，通过利用新开发的与Rsc3紧密连锁的SSR标记CH0211的专用引物对大豆抗大豆花叶病毒SC3株系进行早期子代选择鉴定，大大减少了抗病育种工作量以及育种周期，因此能够快速、精准、高效地筛选出抗SMV SC3的大豆育种材料。

本发明技术方案如下：

本发明的第一个目的是提供一种鉴定大豆抗大豆花叶病毒SC3株系的SSR标记CH0211，所述SSR标记引物序列如下：

上游引物：5’-CAGGTCGATAAGTCTATGT-3’(SEQ ID NO.1)；

下游引物：5’-ATATGAACTCGGTCTGTTG-3’(SEQ ID NO.2)。