[发明专利]一种鉴定或辅助鉴定猪眼肌面积的方法及其应用

说明书

本发明涉及一种鉴定或辅助鉴定猪眼肌面积的方法及其应用，供了与猪眼肌面积相关的SNP标记及其应用，基于猪10.2版参考基因组，检测待测猪的4号染色体正义链第122,930,793位核苷酸的基因型是CC/CA/AA中的哪一种。CC基因型猪是该位点为碱基C的纯合子；AA基因型猪是该位点为碱基A的纯合子；CA基因型猪是该位点为碱基CA的杂合子。在三种基因型猪中，CC基因型猪眼肌面积显著大于CA型和AA型。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体涉及一种鉴定或辅助鉴定猪眼肌面积的方法及其应用。

背景技术

眼肌面积是猪背部最长肌肉的横截面积，是现代猪遗传育种工作中衡量猪瘦肉率的重要指标。在生猪生产过程中，瘦肉率是一类非常重要的经济性状，该性状与猪眼肌面积的大小呈显著正相关，且直接影响猪肉在市场上的销售和价格。因此提高家猪瘦肉率和眼肌面积是猪遗传育种的重要工作内容。瘦肉率和眼肌面积均属于中高等遗传力的复杂性状。该类性状一般需要屠宰后进行测量，费时费力，且利用传统育种方法的改良速度较慢，准确度也比较低。更为重要的是，优秀种猪屠宰后无法继续利用，因而造成了严重的损失。随着测序技术的不断发展，猪基因组测序图谱、SNPs(单核苷酸多态性)标记图谱逐步完善，为猪基因组选择研究提供了大量可以参考的遗传标记。利用SNP芯片分型技术进行全基因组关联分析可以快速有效地挖掘出与猪眼肌面积大小相关的SNP位点，通过待测猪基因型的检测可对猪眼肌面积进行早期预测，节省生产成本并加速猪遗传育种改良工作。

发明内容

本发明的目的是提供一种鉴定或辅助鉴定猪眼肌面积的方法及其应用。

本发明提供一种产品，所述产品为用于检测待测猪基因组中所述SNP标记M1GA0006480的多态性或基因型的的物质，所述SNP标记M1GA0006480为猪参考基因组Sscrofa10.2中4号染色体正义链第122,930,793位核苷酸，其为C或A。

其中，所述检测SNP标记M1GA0006480的多态性或基因型的物质如下A1)或A2)或A3)或A4)：

A1)用于扩增含有SNP标记M1GA0006480的DNA片段的成套引物；

A2)含有A1)的PCR试剂；

A3)含有A1)或A2)的试剂盒；

A4)用于检测SNP标记M1GA0006480的多态性或基因型的SNP芯片。

所述的产品在鉴定或辅助鉴定猪眼肌面积中的应用也应在本发明的保护范围之中。

所述的产品在猪育种中的应用也应在本发明的保护范围之中。

本发明提供一种鉴定或辅助鉴定猪眼肌面积大小的方法，所述方法包括：检测待测猪基因组中SNP标记M1GA0006480的基因型，CA基因型与AA基因型的猪的猪眼肌面积小于CC基因型的猪的猪眼肌面积，AA基因型的猪的猪眼肌面积小于CA基因型的猪的猪眼肌面积；

其中，所述SNP标记M1GA0006480为猪参考基因组Sscrofa10.2中4号染色体正义链第122,930,793位核苷酸，其为C或A；

所述CC基因型为SNP标记M1GA0006480为C的纯合型；

所述CA基因型为SNP标记M1GA0006480为C和A的杂合型；

所述AA基因型为SNP标记M1GA0006480为A的纯合型。

所述的方法在鉴定或辅助鉴定猪眼肌面积中的应用也应在本发明的保护范围之中。

所述的方法在猪育种中的应用也应在本发明的保护范围之中。