[发明专利]一种肿瘤风险等级划分方法、系统、终端以及存储介质

说明书

本申请涉及一种肿瘤风险等级划分方法、系统、终端以及存储介质。所述方法包括：获取患者的转录组数据以及临床生存状态信息；根据所述转录组数据以及临床生存状态信息获取所述患者的预后关联基因；将所述临床生存状态信息和预后关联基因输入统计模型进行分子标志物筛选，并获取所述筛选的分子标志物在所述患者中的基因表达值；根据所述分子标志物以及所述基因表达值对所述患者进行打分，根据分值分布对所述患者进行肿瘤风险等级划分。本申请实施例可以最大化保留所有预后关联基因，使得所得预后关联基因具备更好的准确性，并使得分子标志物的获取具备更低的错误率，风险等级划分结果具备更好的合理性。

技术领域

本申请属于生物医学技术领域，特别涉及一种肿瘤风险等级划分方法、系统、终端以及存储介质。

背景技术

虽然现在对肿瘤有了一定的治疗策略，但肿瘤的预后一直较差，由于肿瘤存在很高的快递发展以及转移的可能性，因此对肿瘤进行不同风险人群划分有助于及早发现高风险疾病群体，对于肿瘤的诊断和提供合适的监管措施发挥重大的作用。传统上，肿瘤患者的所处临床阶段、转移情况等临床表型特征常被用来对患者风险进行评估，但该手段未充分考虑到患者内在固有分子水平差异，使得对风险判断缺乏准确性，在实际操作中对肿瘤患者无法提供精准预后判断。

近年来基于基因的表达数据获取跟患者预后相关联分子标志物得以广泛应用，目前基于基因表达水平进行不同风险人群划分的通用方法主要包括三大步骤：

1)人群分组，比如将人群划分为肿瘤组和正常组，转移组和未转移组，然后根据基因表达水平获取组间差异表达基因；

2)结合患者的生存信息，采用生存分析获取跟预后相关联的基因，进一步采用统计模型筛选预后关联的分子标志物；

3)根据分子标志物的基因表达水平结合生存分析中的回归系数进行个体打分，然后根据分值高低排序，以中位数为分界点将人群划分为不同风险人群。

综上所述，现有的风险人群划分方法存在的缺陷包括：

一、现有方法单纯依靠简单的人群划分获取差异表达基因，忽略了人群间真实差异表达基因，即每个患者个体内部的分子组成都不一样，在组间存在表达差异的基因在组内可能也存在巨大的表达差异；另外，有些基因在人群划分所得不同组间虽然不存在差异表达，但其仍然跟预后相关联，而现有方法存在漏掉其他潜在预后关联基因的可能。

二、现有方法在对预后关联基因进行筛选的过程中采用lasso惩罚Cox比例风险模型，该模型需要进行交叉验证来选择Lambda值，基于该值再次确定分子标志物，而现有方法结果往往具备随机性，即每运算一次结果所得Lambda值都不一样。

三、现有方法在对人群进行风险划分时，采用打分值的中位数为分界点划分，该值未必是所有分值划分的最佳点，从而会导致最终的风险划分结果存在一定的错误性。

发明内容

本申请提供了一种肿瘤风险等级划分方法、系统、终端以及存储介质，旨在至少在一定程度上解决现有技术中的上述技术问题之一。

为了解决上述问题，本申请提供了如下技术方案：

一种肿瘤风险等级划分方法，包括以下步骤：

获取患者的转录组数据以及临床生存状态信息；其中，所述转录组数据至少包括每个基因在所述患者中的基因表达值；

根据所述转录组数据以及临床生存状态信息获取所述患者的预后关联基因；

将所述临床生存状态信息和预后关联基因输入统计模型进行分子标志物筛选，并获取所述筛选的分子标志物在所述患者中的基因表达值；

根据所述分子标志物以及所述基因表达值对所述患者进行打分，根据分值分布对所述患者进行肿瘤风险等级划分。