[发明专利]用于区分鉴别薄壳山核桃与山核桃、大别山山核桃和湖南山核桃的SSR分子标记及其应用

说明书

本发明涉及植物分子标记技术领域，具体涉及用于区分鉴别薄壳山核桃与山核桃、大别山山核桃和湖南山核桃的SSR分子标记及其应用。本发明提供的SSR分子标记包括SSR‑2和选自SSR‑1、SSR‑3、SSR‑4中的一种或多种，其中，SSR‑2由引物SEQ ID NO.3‑4扩增得到，SSR‑1由引物SEQ ID NO.1‑2扩增得到，SSR‑3由引物SEQ ID NO.5‑6扩增得到，SSR‑4由引物SEQ ID NO.7‑8扩增得到。该SSR分子标记能够很好地将薄壳山核桃与山核桃、大别山山核桃和湖南山核桃区分开来，具有操作简单、重复性好、准确度高等优势，具有较高的应用价值。

技术领域

本发明涉及植物分子标记技术领域，具体涉及用于区分鉴别薄壳山核桃与山核桃、大别山山核桃和湖南山核桃的SSR分子标记及其应用。

背景技术

薄壳山核桃(Carya illinoinensis)，是胡桃科(Juglandaceae)山核桃属(Carya)的植物，是具有较高经济价值的干果树种之一。薄壳山核桃果实出仁率高且营养丰富，是理想的营养和保健食品，同时也是重要的油料植物。

山核桃(C.cathayensis)、大别山山核桃(C.dabieshanensis)和湖南山核桃(C.hunanensis)与薄壳山核桃(C.illinoinensis)虽然同属于胡桃科山核桃属植物，但是在营养价值和经济价值方面与薄壳山核桃差距较大。而且，薄壳山核桃不完整的种仁与山核桃、大别山山核桃和湖南山核桃的种仁在形态上很难区分，因此，容易造成山核桃、大别山山核桃和湖南山核桃与薄壳山核桃种仁的混淆。

随着分子生物学的发展，利用分子手段进行植物的种质资源分析和品种鉴定已成为有效的方法，因此，开发能够区分鉴别薄壳山核桃与山核桃、大别山山核桃和湖南山核桃的分子标记对于薄壳山核桃产品的生产和鉴别具有重要意义。

发明内容

本发明的目的是提供一种用于区分鉴别薄壳山核桃与山核桃、大别山山核桃和湖南山核桃的SSR分子标记及其应用。

为实现上述目的，本发明通过对薄壳山核桃与山核桃、大别山山核桃和湖南山核桃的全基因组序列进行分析，寻找薄壳山核桃特异的且在不同薄壳山核桃品种中高度保守的简单重复序列(Simple Sequence Repeat，SSR)，开发能够将薄壳山核桃与山核桃、大别山山核桃和湖南山核桃区分的SSR分子标记。经大量序列分析和薄壳山核桃与山核桃、大别山山核桃和湖南山核桃样品的验证，最终得到能够将薄壳山核桃与山核桃、大别山山核桃和湖南山核桃有效区分的SSR分子标记，实现了利用2～4个SSR分子标记即可较为准确地区分薄壳山核桃与山核桃、大别山山核桃和湖南山核桃。

基于上述发现，本发明提供以下技术方案：

本发明提供用于区分鉴别薄壳山核桃与山核桃、大别山山核桃和湖南山核桃的SSR分子标记，包括SSR-2和选自SSR-1、SSR-3、SSR-4中的一种或多种；其中，SSR-2由引物SEQ ID NO.3-4扩增得到，SSR-1由引物SEQ ID NO.1-2扩增得到，SSR-3由引物SEQ IDNO.5-6扩增得到，SSR-4由引物SEQ ID NO.7-8扩增得到。

以上所述的各引物序列如下：

本发明提供的上述4个SSR分子标记中，采用SSR-2以及选自SSR-1、SSR-3、SSR-4中的任一个即可实现薄壳山核桃与山核桃、大别山山核桃和湖南山核桃的区分。

为进一步提高鉴别的准确性，可将SSR-2与选自SSR-1、SSR-3、SSR-4中的两种或三种联合使用进行鉴别。

作为本发明的一种优选方案，所述SSR分子标记包括SSR-2、SSR-1、SSR-3和SSR-4。