[发明专利]一种用于检测大肠埃希菌CTX-M基因的荧光定量PCR试剂盒在审

专利信息
申请号: 202010902830.9 申请日: 2020-09-01
公开(公告)号: CN111876508A 公开(公告)日: 2020-11-03
发明(设计)人: 姜芹;张妤;孙冰清;黄士新;张文刚;曹莹;顾欣;商军;严凤;张浩然;田恺;吴剑平;黄家莺;张亦菲;王博;徐汀 申请(专利权)人: 上海市动物疫病预防控制中心(上海市兽药饲料检测所;上海市畜牧技术推广中心)
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/6851;C12R1/19
代理公司: 上海骁象知识产权代理有限公司 31315 代理人: 林炜
地址: 201103 上*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 检测 大肠 埃希菌 ctx 基因 荧光 定量 pcr 试剂盒
【说明书】:

一种用于检测大肠埃希菌CTX‑M基因的荧光定量PCR试剂盒,包括含有用于检测CTX‑M‑1群基因的上游引物、下游引物和探针,还含有用于检测CTX‑M‑9群基因的上游引物、下游引物和探针,用于检测CTX‑M‑1群基因的上游引物的序列如SEQ ID NO.1所示,下游引物的序列如SEQ ID NO.2所示,探针的序列如SEQ ID NO.3所示;用于检测CTX‑M‑9群基因的上游引物的序列如SEQ ID NO.4所示,下游引物的序列如SEQ ID NO.5所示,探针的序列如SEQ ID NO.6所示。本发明使用的引物、探针具有良好特异性和灵敏度,对遏制细菌耐药具有积极意义。

技术领域:

本发明属于生物工程领域,涉及一种检测试剂盒,具体来说是一种用于检测产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)大肠埃希菌中CTX-M-1群和CTX-M-9群基因的荧光定量PCR试剂盒。

背景技术:

β-内酰胺类药物是化学结构中具有β-内酰胺环的一大类药物,是目前生产量和使用量最大的抗生素类型之一,包括临床最常使用的青霉素类与头孢菌素类等。近年来,单环β-内酰胺类以及碳青霉烯类也使用的越来越多。随着该类药物的广泛使用,细菌对该类药物的耐药性也日渐严重。国内外对其耐药情况研究也较为广泛,许多国家都发现了不同型的流行菌株。大肠埃希菌是寄居在人和动物肠道中的正常菌群,是临床最常见的一种革兰氏阴性菌,其对β-内酰胺类药物耐药的主要机制之一是产生超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)水解失活该类药物。

ESBLs主要包括CTX-M型、TEM型、SHV型和OXA型等多种家族的酶,其中CTX-M是目前全球范围内主要流行的ESBLs型。目前,已发现150多种CTX-M型β-内酰胺酶,根据其基因序列类型,同源性大于95%为同一群CTX-M酶,大致可分为CTX-M-1群、CTX-M-2群、CTX-M-8群、CTX-M-9群、CTX-M-25群和KLUC群6个。其中又以CTX-1群和CTX-9群为全球主要流行群。

目前还没有针对大肠埃希菌中主要流行的CTX-M型的超广谱β-内酰胺酶检测的试剂盒,因此,本发明有助于快速检测产CTX-M型酶的大肠埃希菌,对了解大肠埃希菌对β-内酰胺类药物的耐药情况及耐药基因分布和指导β-内酰胺类药物临床使用及评估耐药风险具有重要意义。

发明内容:

针对现有技术中的上述技术问题,本发明提供了一种用于检测产ESBLs大肠埃希菌中CTX-M-1群和CTX-M-9群基因的荧光定量PCR试剂盒,所述的这种用于检测产ESBLs大肠埃希菌中CTX-M-1群和CTX-M-9群基因的荧光定量PCR试剂盒要解决现有技术中没有合适的试剂盒用于检测常见产CTX-M型超ESBLs大肠埃希菌的现状。

本发明提供了一种用于检测大肠埃希菌CTX-M基因的荧光定量PCR试剂盒,包括含有用于检测CTX-M-1群基因的上游引物、用于检测CTX-M-1群基因的下游引物、用于检测CTX-M-1群基因的探针,用于检测CTX-M-9群基因的上游引物、用于检测CTX-M-9群基因的下游引物、用于检测CTX-M-9群基因的探针,所述的用于检测CTX-M-1群基因的上游引物的序列如SEQ ID NO.1所示,所述的用于检测CTX-M-1群基因的下游引物的序列如SEQ ID NO.2所示,所述的用于检测CTX-M-1群基因的探针的序列如SEQ ID NO.3所示,所述的用于检测CTX-M-9群基因的上游引物的序列如SEQ ID NO.4所示,所述的用于检测CTX-M-9群基因的下游引物的序列如SEQ ID NO.5所示,所述的用于检测CTX-M-9群基因的探针的序列如SEQID NO.6所示。

进一步的,还含有阴性对照、阳性对照。

进一步的,还含有聚合酶链式反应试剂、Taq DNA聚合酶。

本发明中,大肠埃希菌CTX-M-1的序列为:

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