[发明专利]一种大黄鱼虹彩病毒的双重TaqMan探针法荧光定量PCR检测试剂盒及制备方法在审
| 申请号: | 202010900766.0 | 申请日: | 2020-08-31 |
| 公开(公告)号: | CN111979356A | 公开(公告)日: | 2020-11-24 |
| 发明(设计)人: | 陈新华;郭睿;何天良 | 申请(专利权)人: | 福建农林大学 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11;C12R1/93 |
| 代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人: | 饶文君;蔡学俊 |
| 地址: | 350002 福建省福*** | 国省代码: | 福建;35 |
| 权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 大黄鱼 虹彩 病毒 双重 taqman 探针 荧光 定量 pcr 检测 试剂盒 制备 方法 | ||
1.一种大黄鱼虹彩病毒的双重TaqMan探针法荧光定量PCR检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含特异性引物和探针,其序列如下:
正向引物F1:5’-CTGAGGGTGGTCGTCTGGTT-3’;
正向引物F2:5’-CAACCACCTGCCGGTTACAG-3’;
反向引物R1:5’-ATGGCGACCCTGCTACTTCT-3’;
反向引物R2:5’-GTGACGGTGGAATAGCAGGC-3’;
荧光探针Q1:5’-AAGGTGGTGGCGTGAGTACACGCCA-3’;
荧光探针Q2:5’-CCGGCACCACCTTACCAGCCGCCTGCT-3’;
所述荧光探针Q1的5’端标记6-FAM荧光基团,3’端标记能够淬灭荧光基团荧光信号的淬灭基团BHQ1;
荧光探针Q2的5’端标记VIC荧光基团, 3’端标记能够淬灭荧光基团荧光信号的淬灭基团BHQ1。
2.一种如权利要求1所述试剂盒的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)制备盒体;
(2)配制检测试剂:
裂解液的配方为:终浓度5mol/L盐酸胍,0.1mol/L EDTA,去离子水定容至1L,pH为8.0;
吸附液的组成为玻璃粉、浓硝酸与水,所述玻璃粉、浓硝酸与水的配比为1g:5~6 mL:10~12 mL,所述浓硝酸的质量分数为55%-70%;
洗涤液的配方为:终浓度0.1mol/L 氯化钠,1mmol/L EDTA,10mmol/L Tris-HCl,去离子水定容至1L,pH为7.5,再加入等体积的无水乙醇;
荧光定量PCR反应液的配方为:每19μL中包含2×定量PCR预混液10μL,正向引物F1 0.4μL,F2 0.4μL,反向引物R1 0.4μL,R2 0.4μL,荧光探针Q1 0.2μL,荧光探针Q2 0.6μL,双蒸水6.6μL;
阳性对照为DNA拷贝数比1:1的pMD18-T-LYCIV-ORF021R和pMD18-T-LYCIV-ORF129R的混合溶液;
阴性对照为无菌水;
(3)将裂解液、吸附液、洗涤液、操作说明书、荧光定量PCR反应液、阴性对照、阳性对照置入盒体内,即得到大黄鱼虹彩病毒的双重TaqMan探针法荧光定量PCR检测试剂盒。
3.根据权利要求2所述的制备方法,其特征在于,所述阳性对照的制备方法为:
1)引物设计,具体方法为:
根据已公开的大黄鱼虹彩病毒基因组序列,采用Primer Premier 5设计能特异性鉴别大黄鱼虹彩病毒的正向引物F1、F2和反向引物R1、R2:
正向引物F1:5’-CTGAGGGTGGTCGTCTGGTT-3’;
正向引物F2:5’-CAACCACCTGCCGGTTACAG-3’;
反向引物R1:5’-ATGGCGACCCTGCTACTTCT-3’;
反向引物R2:5’-GTGACGGTGGAATAGCAGGC-3’;
2)重组质粒pMD18-T-LYCIV-ORF021R或pMD18-T-LYCIV-ORF129R的构建步骤为:
使用大黄鱼虹彩病毒特异检测引物,以大黄鱼虹彩病毒检测阳性的大黄鱼内脏组织样品DNA为模板,经过PCR反应,获得一段98 bp或103 bp的ORF021R或ORF129R基因片段,然后将PCR产物电泳目的条带使用Gel Extraction Kit切胶回收并连接到pMD18-T载体上,转化至Trans1-T1 Phage Resistant化学感受态细胞中,筛选阳性克隆并测序验证;
3)阳性对照的制备
提取构建好的pMD18-T-LYCIV-ORF021R或pMD18-T-LYCIV-ORF129R质粒,用分光光度计检测质粒的质量和浓度,按照如下公式计算出目的基因的拷贝数,然后用灭菌超纯水稀释成浓度为1×108拷贝/μL;将2种含相同拷贝数的质粒溶液1:1混匀,即为阳性对照;将该阳性对照稀释到1×107拷贝/μL后继续做10倍系列稀释,得1×106-1×102拷贝/μL质粒,用于制作标准曲线:
。
4.一种利用权利要求1所述试剂盒判定大黄鱼虹彩病毒的方法,其特征在于,以标准曲线中Ct值大小判断病毒的有无;阴性对照应无Ct值,阳性对照Ct值35,且出现S型典型扩增曲线;待测样品Ct值≤35且出现典型扩增曲线,可判定为阳性;若待测样品无扩增曲线,或Ct值35,可判定为阴性。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于福建农林大学,未经福建农林大学许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202010900766.0/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。





