[发明专利]一种基于TMPRSS2的新冠COVID-19治疗药物筛选系统在审
申请号: | 202010847901.X | 申请日: | 2020-08-21 |
公开(公告)号: | CN111986818A | 公开(公告)日: | 2020-11-24 |
发明(设计)人: | 王理;白鹤鸣;潘文洁;杨永杰;张远鹏 | 申请(专利权)人: | 南通大学;南通先进通信技术研究院有限公司 |
主分类号: | G16H70/40 | 分类号: | G16H70/40;G16B40/00 |
代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 朱小兵 |
地址: | 226019*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 tmprss2 covid 19 治疗 药物 筛选 系统 | ||
1.一种基于TMPRSS2的新冠COVID-19治疗药物筛选系统,其特征在于,包括依次连接的:
数据采集模块(1),用于采集与TMPRSS2相关的医疗文献资料;
生物医学概念实体提取模块(2),与所述数据采集模块(1)相连,使用自然语言处理从所述医疗文献资料中提取生物医学概念实体;
特征向量转化模块(3),与所述生物医学概念实体提取模块(2)相连,用于将所述生物医学概念实体转换为机器学习可识别的向量形式;以及
相似度分析模块(4),所述特征向量转化模块(3)输出至所述相似度分析模块(4),所述相似度分析模块(4)通过各向量间余弦相似度获得TMPRSS2与所述生物医学概念实体间的相似度,通过相似度分析获得治疗药物。
2.根据权利要求1所述的基于TMPRSS2的新冠COVID-19治疗药物筛选系统,其特征在于,还包括优先级排序模块(5),所述相似度分析模块(4)输出至所述优先级排序模块(5),所述优先级排序模块(5)用于对所述生物医学概念实体进行优先级排序。
3.根据权利要求1所述的基于TMPRSS2的新冠COVID-19治疗药物筛选系统,其特征在于,所述生物医学概念实体包括疾病类型、器官类别、基因种类以及药物类别。
4.根据权利要求3所述的基于TMPRSS2的新冠COVID-19治疗药物筛选系统,其特征在于,所述相似度包括TMPRSS2与器官类别、疾病类别、基因种类以及药物类别的相似度。
5.根据权利要求1所述的基于TMPRSS2的新冠COVID-19治疗药物筛选系统,其特征在于,所述生物医学概念实体提取模块(2)为信息提取工具QuickUMLS或信息提取工具MetaMap。
6.根据权利要求1所述的基于TMPRSS2的新冠COVID-19治疗药物筛选系统,其特征在于,所述特征向量转化模块(3)为EHR2Vec模型。
7.根据权利要求2所述的基于TMPRSS2的新冠COVID-19治疗药物筛选系统,其特征在于,所述优先级排序模块(5)为融合了PageRank算法的随机游走模型。
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