[发明专利]菌株基因组注释查询方法、装置、电子设备及存储介质

说明书

本公开提供了菌株基因组注释查询方法、装置、电子设备及存储介质。该方法的一具体实施方式包括：接收终端设备发送的菌株基因组注释查询请求，其中，菌株基因组注释查询请求包括待查询菌株测序项目标识，在菌株基因组注释数据库中查询菌株测序项目标识与待查询菌株测序项目标识匹配的菌株基因组测序信息，其中，菌株基因组测序信息包括菌株编号、菌株测序项目标识以及基因组注释，菌株基因组注释数据库存储至少一个菌株基因组测序信息，将查询到的菌株基因组测序信息中的基因组注释发送至终端设备。该实施方式实现了菌株基因组注释的准确查询。

技术领域

本公开涉及计算机技术领域，具体涉及菌株基因组注释查询方法、装置、电子设备及存储介质。

背景技术

基因组注释是利用生物信息学方法和工具，对基因组所有基因的生物学功能进行高通量注释，是当前功能基因组学研究的一个热点。

随着微生物的分类、进化和功能相关的研究已进入基因组时代，需完善各微生物菌株的基因组测序和注释，以支撑微生物学的研究。

发明内容

本公开提出了菌株基因组注释查询方法、装置、电子设备及存储介质。

第一方面，本公开提供了一种菌株基因组注释查询方法，该方法包括：接收终端设备发送的菌株基因组注释查询请求，其中，菌株基因组注释查询请求包括待查询菌株测序项目标识；在菌株基因组注释数据库中查询菌株测序项目标识与待查询菌株测序项目标识匹配的菌株基因组测序信息，其中，菌株基因组测序信息包括菌株编号、菌株测序项目标识以及基因组注释，菌株基因组注释数据库存储至少一个菌株基因组测序信息；将查询到的菌株基因组测序信息中的基因组注释发送至终端设备。

在一些可选的实施方式中，菌株基因组注释查询请求是通过如下步骤生成的：接收终端设备发送的菌株测序项目标识查询请求，其中，测序项目标识查询请求包括待查询菌株编号；在基因组注释数据库中查询菌株编号与待查询菌株编号一致的菌株基因组测序信息中的菌株测序项目标识；根据查询到的菌株测序项目标识，生成菌株基因组注释查询请求。

在一些可选的实施方式中，菌株基因组测序信息还包括微生物保藏机构标识和菌株测序状态信息，其中，菌株测序状态信息用于表征是否已完成基因组测序；以及该方法还包括：接收终端设备发送的微生物保藏机构的菌株总体测序状态信息查询请求，其中，微生物保藏机构的菌株总体测序状态信息查询请求包括待查询微生物保藏机构标识；基于菌株基因组注释数据库和待查询微生物保藏机构标识，确定待查询微生物保藏机构的菌株总体测序状态信息；将菌株总体测序状态信息发送至终端设备，以供终端设备呈现菌株总体测序状态信息。

在一些可选的实施方式中，基于菌株基因组注释数据库和待查询微生物保藏机构标识，确定待查询微生物保藏机构的菌株总体测序状态信息，包括：在菌株基因组注释数据库中查询微生物保藏机构标识与待查询微生物保藏机构标识匹配的菌株基因组测序信息；在查询到的各菌株基因组测序信息中分别查询菌株测序状态信息用于表征未完成基因组测序的第一基因组测序信息和菌株测序状态信息用于表征已完成基因组测序的第二基因组测序信息；根据分别统计的各第一基因组测序信息与各第二基因组测序信息，生成待查询微生物保藏机构的菌株总体测序状态信息。

第二方面，本公开提供了一种菌株基因组注释查询装置，该装置包括：第一接收单元，被配置成接收终端设备发送的菌株基因组注释查询请求，其中，菌株基因组注释查询请求包括待查询菌株测序项目标识；查询单元，被配置成在菌株基因组注释数据库中查询菌株测序项目标识与待查询菌株测序项目标识匹配的菌株基因组测序信息，其中，菌株基因组测序信息包括菌株编号、菌株测序项目标识以及基因组注释，菌株基因组注释数据库存储至少一个菌株基因组测序信息；第一发送单元，被配置成将查询到的菌株基因组测序信息中的基因组注释发送至终端设备。