[发明专利]用于H1和H3亚型猪流感病毒检测与分型的荧光定量RT-PCR引物、探针及试剂盒在审
| 申请号: | 202010806504.8 | 申请日: | 2020-08-12 |
| 公开(公告)号: | CN111850175A | 公开(公告)日: | 2020-10-30 |
| 发明(设计)人: | 顾敏;陈凯彪;刘秀梵;施丽微;王晓泉;龙进学 | 申请(专利权)人: | 扬州大学 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11 |
| 代理公司: | 南京知识律师事务所 32207 | 代理人: | 卢亚丽 |
| 地址: | 225009 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 h1 h3 亚型猪 流感病毒 检测 荧光 定量 rt pcr 引物 探针 试剂盒 | ||
1.一种用于H1和H3亚型猪流感病毒检测与分型的双重荧光定量RT-PCR的引物和探针,其特征在于包括两对特异性引物和探针,所述引物及探针序列如下:
(1)检测H1亚型猪流感病毒的引物及探针:
H1-上游引物:GGCTAYCATGCBAACAATTC
H1-下游引物:TGGGTTGCCMAGGATCCA
H1-探针:FAM-ACAGACACTGTMGACACA-MGB
(2)检测H3亚型猪流感病毒的引物及探针:
H3-上游引物:GAAATGGGAAAAGCTCAATAATGA
H3-下游引物:ATTTCTCATYCCTGTTGCCAA
H3-探针:HEX-CCAAATGGAAGCATT-MGB。
2.如权利要求1所述的引物和探针,其特征在于,所述检测H1亚型猪流感病毒的探针5’端使用FAM荧光基团标记,3‘端使用猝灭基团MGB标记;检测H3亚型猪流感病毒的探针5‘端使用HEX荧光基团标记,3’端使用猝灭基团MGB标记。
3.权利要求1或2所述的引物和探针在制备用于检测H1和H3亚型猪流感病毒的制品中的应用。
4.如权利要求3所述的应用,其特征在于,所述的制品为荧光定量检测试剂盒。
5.一种荧光定量检测试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒中包含有权利要求1或者2所述的引物和探针。
6.一种用于H1和H3亚型猪流感病毒检测与分型的双重荧光定量RT-PCR方法,其特征在于,所述的方法包括如下的步骤:
1)配制一步法荧光定量RT-PCR反应体系
反应液每管20μL,含有2×One Step U+Mix 10μL,One Step U+Enzyme Mix 1μL,50×ROX Reference Dye 1或50×ROX Reference Dye 2 0.4μL,10μmol/μL权利要求1所述引物各0.8μL,探针各0.4μL,RNase Free ddH20 2.6μL,待检样品RNA 2μL;
2)荧光定量RT-PCR反应体系扩增步骤设置
将检测反应步骤设置成:第一阶段反转录:55℃15min;第二阶段预变性:95℃30s;第三阶段:95℃10s,60℃35s并收集荧光信号,共40个循环;
3)结果判定
阳性判定标准需同时满足Ct值低于38和扩增曲线为“S”型两个条件;
阴性判定标准需要阴性对照无Ct值且无扩增曲线出现;
若Ct值在38至40区间,视为可疑,需要重复实验鉴定。
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