[发明专利]与肝癌生存率相关的SNP位点、引物对、试剂盒及应用

说明书

本发明适用于生物技术领域，提供了一种与肝癌生存率相关的SNP位点、引物对、试剂盒及应用，该SNP位点为7p21.2区域上的rs2237492位点，rs2237492位点碱基为A或T，其周围的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:1所示。另外，本发明实施例还提供一种用于检测上述SNP位点基因型的引物对，其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:2～3所示，该引物对可以对rs2237492位点进行基因分型，其方法简便、快速、结果准确、明了，从而可以为肝癌生存率鉴定以及预后提供一个新的途径。

技术领域

本发明属于生物技术领域，尤其涉及一种与肝癌生存率相关的SNP位点、引物对、试剂盒及应用。

背景技术

原发性肝癌(Primary Hepatic Cancer，PHC)是全球高发的癌症之一，我国是肝炎大国，肝癌发病人数占全球人口的一半以上，已经成为严重威胁我国人民身心健康的恶性肿瘤之一。目前认为，肝癌发生的可能分子基础是多个遗传性因素及其特定组合的累积效应、病毒、生活方式及饮食习惯相互作用的结果。

早期PHC手术患者依靠定量组织RNA水平和蛋白表达水平来预测预后和疗效，但大部分中、晚期PHC患者无法接受手术，无法预测预后和疗效。随着科技的发展，针对癌症诊治、预后和疗效的不断研究，少部分患者得到了一定的改善，但对未受益患者的生存率等预后情况仍存在争议。因此，亟待开展预测PHC预后的标记物。

发明内容

本发明实施例的目的在于提供一种与肝癌生存率相关的SNP位点，旨在解决背景技术中提出的问题。

本发明实施例是这样实现的，一种与肝癌生存率相关的SNP位点，为7p21.2区域上的rs2237492位点，rs2237492位点碱基为A或T；另外，rs2237492位于基因MEOX2的3′UTR。

作为本发明实施例的一个优选方案，所述SNP位点周围的核苷酸序列(即7p21.2区域上的部分基因序列)如序列表SEQ ID NO:1所示，其中W碱基(即rs2237492位点碱基)为A或T。

本发明实施例的另一目的在于提供一种用于检测上述的SNP位点的引物对，其包括：

上游引物，其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:2所示；以及

下游引物，其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:3所示。

本发明实施例的另一目的在于提供一种试剂盒，其包括PCR缓冲液以及上述的引物对。

作为本发明实施例的另一个优选方案，所述试剂盒用于检测所述SNP位点的基因型。

本发明实施例的另一目的在于提供一种上述的SNP位点在制备用于判定肝癌患者生存率的试剂盒中的应用。

本发明实施例的另一目的在于提供一种上述的引物对在制备用于判定肝癌患者生存率的试剂盒中的应用。

本发明实施例提供的一种与肝癌生存率相关的SNP位点，为7p21.2区域上的rs2237492位点，其可以用于判定肝癌患者生存率。具体的，本发明实施例通过设计一组特异性引物对，可以对rs2237492位点进行基因分型，其方法简便、快速、结果准确、明了，从而可以为肝癌生存率鉴定以及预后提供一个新的途径，将该方法应用于对肝癌辅助治疗评判，有利于预测疾病的发展。

附图说明

图1为试验例统计分析得到的生存曲线图。

具体实施方式

为了使本发明的目的、技术方案及优点更加清楚明白，以下结合实施例，对本发明进行进一步详细说明。应当理解，此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本发明，并不用于限定本发明。

实施例1