[发明专利]功能改性的寡核苷酸及其亚单元在审

专利信息
申请号: 202010731202.9 申请日: 2012-11-15
公开(公告)号: CN111808135A 公开(公告)日: 2020-10-23
发明(设计)人: 贡纳·J·汉森;德怀特·D·怀勒;蔡宝忠;周明 申请(专利权)人: 萨勒普塔医疗公司
主分类号: C07F9/6558 分类号: C07F9/6558;C07F9/6561
代理公司: 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 代理人: 王达佐;何可
地址: 美国华*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 功能 改性 寡核苷酸 及其 单元
【权利要求书】:

1.具有式(I)结构的化合物:

或其盐或异构体,

其中:

n为1-50的整数;

G5为卤素、OH、烃氧基、OSO2(烃基)、OSO2(芳基)或

每个B为独立选择的碱基对部分;

每个Y独立地为O或NR10;任选地,R10和X8e结合在一起形成环;

每个W独立地为S或O;

Z5为-(L11)-(R15)、-(L11)-(L15)-(R16)或-(L11)-(L12)-(R17);

L11选自:

k)–C(R23)2O-;

其中L13选自:

L12为选自以下的生物条件下可切割的连接臂:

a)-(C1-C10亚烃基)-OC(O)O-CH2O-;

b)-C(O)-(C1-C10亚烃基)-OC(O)O-CH2O-;

c)-C(O)-(CH=CH)-C(O)O-CH2O-;

d)-(C1-C10亚烃基)-S-S-CH2CH2O-;或

e)-C(O)-(C1-C10亚烃基)-S-S-CH2CH2O-;

L15为选自以下的二价基团:C1-C30亚烃基、C3-C8环亚烃基、C6-C30亚芳基、-(C6-C30亚芳基)-(C1-C30亚烃基)-、-(C1-C30亚烃基)-C(=O)-、-(C2-C30烃氧基)-C(=O)-、-(3-18元杂亚烃基)-C(=O)-、-(C3-C8环亚烃基)-C(=O)-、-(C3-C8环亚烃基)-(C1-C30亚烃基)-C(=O)-、-(C1-C30亚烃基)(C3-C8环亚烃基)-C(=O)-、-(C6-C30亚芳基)-C(=O)-、-(C6-C30亚芳基)-(C1-C30亚烃基)-C(=O)-、-(C1-C30亚烃基)-(C6-C30亚芳基)-C(=O)-、-(C1-C30亚烃基)-O-C(=O)-、-(C3-C8环亚烃基)-O-C(=O)-、-(C7-C30亚芳基)-O-C(=O)-、-(C6-C30亚芳基)-(C1-C30亚烃基)-O-C(=O)-、-(C6-C30亚芳基)-(C1-C30亚烃基)-O-C(=O)-、-C(=O)OR21或-P(=O)(R22)2

R12为电子对,条件是如果R13为C1-C30烃基,则R12为电子对、N-氧化物或C1-C6烃基;

每个R10和R13独立地选自氢、细胞穿透肽、天然或非天然氨基酸、胍基、脒基、杂环基、C1-C30烃基、C3-C8环烃基;C6-C30芳基、C7-C30芳烃基、C1-C30烃基羰基、C3-C8环烃基羰基、C3-C8环烃基烃基羰基、C6-C30芳基羰基、C7-C30芳烃基羰基、C1-C30烃氧羰基、C3-C8环烃氧羰基、C7-C30芳氧基羰基、C8-C30芳烃氧羰基、-C(=O)OR21、-C(=O)NHR21或-P(=O)(R22)2

R15独立地选自:细胞穿透肽、天然或非天然氨基酸、胍基、脒基、杂环基、C1-C30烃基、C3-C8环烃基;C6-C30芳基、C7-C30芳烃基、C1-C30烃基羰基、C3-C8环烃基羰基、C3-C8环烃基烃基羰基、C6-C30芳基羰基、C7-C30芳烃基羰基、C2-C30烃氧羰基、C3-C8环烃氧羰基、C7-C30芳氧基羰基、C8-C30芳烃氧羰基、3-18元烃氧基烃基羰基、-SO2R21、-C(=O)OR21、-P(=O)(OH)2或-P(=O)(R22)2

R16为适于寡核苷酸的固相合成的固体支持基质;

R17为药物、蛋白或毒素;

每个R21独立地为C1-C30烃基或3-18元烃氧基烃基;

每个R22独立地为C6-C12芳氧基;

每个R23独立地为H或C1-C6烃基;或者任选地两个R23基团连接形成3-8元环;

R24为C1-C6亚烃基;

Q独立地选自X1、X2、X3、X4、X5、X6、X7或X8;

每个X独立地选自X1、X2、X3、X4、X5、X6、X7或X8,条件是至少一个X不为X1;

其中

X1为N(CH3)2

X2选自:

a)-O-亚烃基-CO2H;

b)-O-亚烃基-CHN4

c)-N(R1)-亚烃基-CO2H;

d)-N(R1)-亚烃基-CHN4

e)-L1-CO-亚烃基-CO2H;

f)-L1-CO-亚烃基-CHN4

g)-L1-CO-亚烯基-CO2H;

h)-L1-CO-亚烯基-CHN4

i)-L1-CO-亚芳基-CO2H;

j)-L1-CO-亚芳基-CHN4

k)-L1-CONH-亚烃基-CO2H;

l)-L1-CONH-亚烃基-CHN4

m)-L1-CONH-亚芳基-CO2H;

n)-L1-CONH-亚芳基-CHN4

o)-L1-SO2-亚烃基-CO2H;

p)-L1-SO2-亚烃基-CHN4

q)-L1-SO2-亚芳基-CO2H;

r)-L1-SO2-亚芳基-CHN4

s)-L1-亚烃基-CO2H;

t)-L1-亚烃基-CHN4

u)-L1-亚芳基-CO2H;

v)-L1-亚芳基-CHN4;和

w)保护形式的任何以上X2基团;

X3选自:

a)-L1-烃基;

b)-L1-杂环基;

c)-O-亚烃基-CNH-NH2

d)-N(R1)-亚烃基-CNH-NH2

e)-L1-CNH-NH2

f)-L1-亚烃基-CNH-NH2

g)-L1-亚芳基-CNH-NH2

h)-L1-CO-亚烃基-CNH-NH2

i)-L1-CO-亚烯基-CNH-NH2

j)-L1-CO-亚芳基-CNH-NH2

k)-L1-CONH-亚烃基-CNH-NH2

l)-L1-CONH-亚芳基-CNH-NH2

m)-L1-SO2-亚烃基-CNH-NH2

n)-L1-SO2-亚芳基-CNH-NH2

o)-O-亚烃基-N(R1)2

p)-N(R1)-亚烃基-N(R1)2

q)-L1-N(R1)2

r)-L1-亚烃基-N(R1)2

s)-L1-亚芳基-N(R1)2

t)-L1-CO-亚烃基-N(R1)2

u)-L1-CO-亚烯基-N(R1)2

v)-L1-CO-亚芳基-N(R1)2

w)-L1-CONH-亚烃基-N(R1)2

x)-L1-CONH-亚芳基-N(R1)2

y)-L1-SO2-亚烃基-N(R1)2

z)-O-亚烃基-N(R2)3

aa)-N(R1)-亚烃基-N(R2)3

bb)-L1-N(R2)3

cc)-L1-亚烃基-N(R2)3

dd)-L1-亚芳基-N(R2)3

ee)-L1-CO-亚烃基-N(R2)3

ff)-L1-CO-亚烯基-N(R2)3

gg)-L1-CO-亚芳基-N(R2)3

hh)-L1-CONH-亚烃基-N(R2)3

ii)-L1-CONH-亚芳基-N(R2)3

jj)-L1-SO2-亚烃基-N(R2)3

kk)-O-亚烃基-杂环基;

ll)-N(R1)-亚烃基-杂环基;

mm)-L1-亚烃基-杂环基;

nn)-L1-亚芳基-杂环基;

oo)-L1-CO-亚烃基-杂环基;

pp)-L1-CO-亚烯基-杂环基;

qq)-L1-CO-亚芳基-杂环基;

rr)-L1-CONH-亚烃基-杂环基;

ss)-L1-CONH-亚芳基-杂环基;

tt)-L1-SO2-亚烃基-杂环基;

uu)-O-亚烃基-N(O)(R2)2

vv)-N(R1)-亚烃基-N(O)(R2)2

ww)-L1-N(O)(R2)2

xx)-L1-亚烃基-N(O)(R2)23

yy)-L1-亚芳基-N(O)(R2)2

zz)-L1-CO-亚烃基-N(O)(R2)2

aaa)-L1-CO-亚烯基-N(O)(R2)23

bbb)-L1-CO-亚芳基-N(O)(R2)2

ccc)-L1-CONH-亚烃基-N(O)(R2)2

ddd)-L1-CONH-亚芳基-N(O)(R2)2

eee)-L1-SO2-亚烃基-N(O)(R2)2

fff)-O-亚烃基-NH-CNH-NH2

ggg)-N(R1)-亚烃基-NH-CNH-NH2

hhh)-L1-NH-CNH-NH2

iii)-L1-亚烃基-NH-CNH-NH2

jjj)-L1-亚芳基-NH-CNH-NH2

kkk)-L1-CO-亚烃基-NH-CNH-NH2

lll)-L1-CO-亚烯基-NH-CNH-NH2

mmm)-L1-CO-亚芳基-NH-CNH-NH2

nnn)-L1-CONH-亚烃基-NH-CNH-NH2

ooo)-L1-CONH-亚芳基-NH-CNH-NH2

ppp)-L1-SO2-亚烃基-NH-CNH-NH2

qqq)-L1-SO2-亚芳基-NH-CNH-NH2;和

rrr)保护形式的任何以上X3基团;

条件是如果X1存在为N(CH3)2,且X7存在为哌啶基,则X3不为

X4选自:

a)-O-亚烃基-芳基;

b)-N(R1)-芳基;

c)-N(R1)-亚烃基-芳基;

d)-L1-CO-亚烃基-芳基;

e)-L1-CO-亚烯基-芳基;

f)-L1-CO-亚芳基-芳基;

g)-L1-CONH-亚烃基-芳基;

h)-L1-CONH-亚芳基-芳基;

i)-L1-SO2-亚烃基-芳基;

j)-L1-SO2-亚芳基-芳基;

k)-L1-亚烃基-芳基;

l)-L1-亚芳基-芳基;

m)-N(R1)-亚烃基-N(R1)-芳基;

n)-N(R1)-亚烃基-N(R1)CO-芳基;

o)-N(R1)-亚烃基-N(R1)SO2-芳基;

p)-N(R1)-亚烃基-N(R1)CH2-芳基;

q)-L1-芳基;

r)-L1-CO-芳基;

s)-L1-SO2-芳基;

t)-L1-亚烃基-P(芳基)3

u)-L1-CO-亚烃基-P(芳基)3

v)-L1-SO2-亚烃基-P(芳基)3;和

w)保护形式的任何以上X4基团;

X5选自:

a)-O-亚烃基-杂芳基;

b)-N(R1)-亚烃基-杂芳基;

c)-L1-CO-亚烃基-杂芳基;

d)-L1-CO-亚烯基-杂芳基;

e)-L1-CO-亚芳基-杂芳基;

f)-L1-CONH-亚烃基-杂芳基;

g)-L1-CONH-亚芳基-杂芳基;

h)-L1-SO2-亚烃基-杂芳基;

i)-L1-SO2-亚芳基-杂芳基;

j)-L1-亚烃基-杂芳基;

k)-L1-亚芳基-杂芳基;

l)-N(R1)-亚烃基-N(R1)-杂芳基;

m)-N(R1)-亚烃基-N(R1)CO-杂芳基;

n)-N(R1)-亚烃基-N(R1)SO2-杂芳基;

o)-N(R1)-亚烃基-N(R1)CH2-杂芳基;

p)-L1-杂芳基;和

q)保护形式的任何以上X5基团;

X6选自:

a)-O-亚烃基-(OCH2CH2)mOH;

b)-O-亚烃基-(OCH2CH2)mOCH3

c)-N(R1)-亚烃基-(OCH2CH2)mOH;

d)-N(R1)-亚烃基-(OCH2CH2)mOCH3

e)-N(R1)-亚芳基-(OCH2CH2)mOH;

f)-N(R1)-亚芳基-(OCH2CH2)mOCH3

g)-L1-亚烃基-(OCH2CH2)mOH;

h)-L1-CO-亚烃基-(OCH2CH2)mOH;

i)-L1-CO-亚烃基-(OCH2CH2)mOCH3

j)-L1-SO2-亚烃基-(OCH2CH2)mOH;

k)-L1-SO2-亚烃基-(OCH2CH2)mOCH3

l)-L1-CO-亚芳基-(OCH2CH2)mOH;

m)-L1-CO-亚芳基-(OCH2CH2)mOCH3

n)-L1-SO2-亚芳基-(OCH2CH2)mOH;

o)-L1-SO2-亚芳基-(OCH2CH2)mOCH3

p)-L1-CO-(OCH2CH2)mOH;

q)-L1-CO-(OCH2CH2)mOCH3

r)-N(R1)-(二苯并-18-冠-6);

s)氮杂-冠醚;和

t)保护形式的任何以上X6基团;

X7选自:

a)-杂环基;

b)-N(R1)(R3)

c)-L1-氢;

d)-L1-烃基;

e)-L1-CO-烃基;

f)-L1-CONH-烃基;

g)-L1-CON(烃基)-烃基;

h)-L1-SO2-烃基;和

i)保护形式的任何以上X7基团;

条件是如果X1存在为N(CH3)2,且X3存在为则X7不为哌啶基;

X8选自:

a)-L1-CA;

b)-L1-dCA;

c)-L1-COCH2(R4);

d)-L1-COCH(R4)NHCO2-烃基;

e)-OR5,其中R5和R10一起形成环;

f)保护形式的任何以上X8基团;

每个R1独立地为氢、烃基或细胞穿透肽;

每个R2独立地为C1-C12烃基,或者任选地当两个R2为C1-C12烃基时,两个R2连接形成杂环;

每个R3独立地为C2-C18烃基、烯基或炔基;

每个R4独立地为氢、烃基、羟基烃基、巯基烃基或芳基烃基;

每个R5独立地为C1-C12烃基;

每个R6独立地为氢或C1-C12烃基;

L1选自:

其中

每个Q1和Q2分别选自键、-O-或-N(R6)-;

每个E1独立地选自任选取代的芳基或任选取代的杂芳基;

每个E2独立地为任选取代的含氮的杂芳基;

每个L4和L5分别独立地为键、任选取代的C1-C6烃基或任选取代的杂烃基;并且

m、p、q、s和t分别独立地为1-4。

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