[发明专利]功能改性的寡核苷酸及其亚单元在审
| 申请号: | 202010731202.9 | 申请日: | 2012-11-15 | 
| 公开(公告)号: | CN111808135A | 公开(公告)日: | 2020-10-23 | 
| 发明(设计)人: | 贡纳·J·汉森;德怀特·D·怀勒;蔡宝忠;周明 | 申请(专利权)人: | 萨勒普塔医疗公司 | 
| 主分类号: | C07F9/6558 | 分类号: | C07F9/6558;C07F9/6561 | 
| 代理公司: | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 | 代理人: | 王达佐;何可 | 
| 地址: | 美国华*** | 国省代码: | 暂无信息 | 
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 功能 改性 寡核苷酸 及其 单元 | ||
1.具有式(I)结构的化合物:
或其盐或异构体,
其中:
n为1-50的整数;
G5为卤素、OH、烃氧基、OSO2(烃基)、OSO2(芳基)或
每个B为独立选择的碱基对部分;
每个Y独立地为O或NR10;任选地,R10和X8e结合在一起形成环;
每个W独立地为S或O;
Z5为-(L11)-(R15)、-(L11)-(L15)-(R16)或-(L11)-(L12)-(R17);
L11选自:
k)–C(R23)2O-;
其中L13选自:
L12为选自以下的生物条件下可切割的连接臂:
a)-(C1-C10亚烃基)-OC(O)O-CH2O-;
b)-C(O)-(C1-C10亚烃基)-OC(O)O-CH2O-;
c)-C(O)-(CH=CH)-C(O)O-CH2O-;
d)-(C1-C10亚烃基)-S-S-CH2CH2O-;或
e)-C(O)-(C1-C10亚烃基)-S-S-CH2CH2O-;
L15为选自以下的二价基团:C1-C30亚烃基、C3-C8环亚烃基、C6-C30亚芳基、-(C6-C30亚芳基)-(C1-C30亚烃基)-、-(C1-C30亚烃基)-C(=O)-、-(C2-C30烃氧基)-C(=O)-、-(3-18元杂亚烃基)-C(=O)-、-(C3-C8环亚烃基)-C(=O)-、-(C3-C8环亚烃基)-(C1-C30亚烃基)-C(=O)-、-(C1-C30亚烃基)(C3-C8环亚烃基)-C(=O)-、-(C6-C30亚芳基)-C(=O)-、-(C6-C30亚芳基)-(C1-C30亚烃基)-C(=O)-、-(C1-C30亚烃基)-(C6-C30亚芳基)-C(=O)-、-(C1-C30亚烃基)-O-C(=O)-、-(C3-C8环亚烃基)-O-C(=O)-、-(C7-C30亚芳基)-O-C(=O)-、-(C6-C30亚芳基)-(C1-C30亚烃基)-O-C(=O)-、-(C6-C30亚芳基)-(C1-C30亚烃基)-O-C(=O)-、-C(=O)OR21或-P(=O)(R22)2;
R12为电子对,条件是如果R13为C1-C30烃基,则R12为电子对、N-氧化物或C1-C6烃基;
每个R10和R13独立地选自氢、细胞穿透肽、天然或非天然氨基酸、胍基、脒基、杂环基、C1-C30烃基、C3-C8环烃基;C6-C30芳基、C7-C30芳烃基、C1-C30烃基羰基、C3-C8环烃基羰基、C3-C8环烃基烃基羰基、C6-C30芳基羰基、C7-C30芳烃基羰基、C1-C30烃氧羰基、C3-C8环烃氧羰基、C7-C30芳氧基羰基、C8-C30芳烃氧羰基、-C(=O)OR21、-C(=O)NHR21或-P(=O)(R22)2;
R15独立地选自:细胞穿透肽、天然或非天然氨基酸、胍基、脒基、杂环基、C1-C30烃基、C3-C8环烃基;C6-C30芳基、C7-C30芳烃基、C1-C30烃基羰基、C3-C8环烃基羰基、C3-C8环烃基烃基羰基、C6-C30芳基羰基、C7-C30芳烃基羰基、C2-C30烃氧羰基、C3-C8环烃氧羰基、C7-C30芳氧基羰基、C8-C30芳烃氧羰基、3-18元烃氧基烃基羰基、-SO2R21、-C(=O)OR21、-P(=O)(OH)2或-P(=O)(R22)2;
R16为适于寡核苷酸的固相合成的固体支持基质;
R17为药物、蛋白或毒素;
每个R21独立地为C1-C30烃基或3-18元烃氧基烃基;
每个R22独立地为C6-C12芳氧基;
每个R23独立地为H或C1-C6烃基;或者任选地两个R23基团连接形成3-8元环;
R24为C1-C6亚烃基;
Q独立地选自X1、X2、X3、X4、X5、X6、X7或X8;
每个X独立地选自X1、X2、X3、X4、X5、X6、X7或X8,条件是至少一个X不为X1;
其中
X1为N(CH3)2;
X2选自:
a)-O-亚烃基-CO2H;
b)-O-亚烃基-CHN4;
c)-N(R1)-亚烃基-CO2H;
d)-N(R1)-亚烃基-CHN4;
e)-L1-CO-亚烃基-CO2H;
f)-L1-CO-亚烃基-CHN4;
g)-L1-CO-亚烯基-CO2H;
h)-L1-CO-亚烯基-CHN4;
i)-L1-CO-亚芳基-CO2H;
j)-L1-CO-亚芳基-CHN4;
k)-L1-CONH-亚烃基-CO2H;
l)-L1-CONH-亚烃基-CHN4;
m)-L1-CONH-亚芳基-CO2H;
n)-L1-CONH-亚芳基-CHN4;
o)-L1-SO2-亚烃基-CO2H;
p)-L1-SO2-亚烃基-CHN4;
q)-L1-SO2-亚芳基-CO2H;
r)-L1-SO2-亚芳基-CHN4;
s)-L1-亚烃基-CO2H;
t)-L1-亚烃基-CHN4;
u)-L1-亚芳基-CO2H;
v)-L1-亚芳基-CHN4;和
w)保护形式的任何以上X2基团;
X3选自:
a)-L1-烃基;
b)-L1-杂环基;
c)-O-亚烃基-CNH-NH2;
d)-N(R1)-亚烃基-CNH-NH2;
e)-L1-CNH-NH2;
f)-L1-亚烃基-CNH-NH2;
g)-L1-亚芳基-CNH-NH2;
h)-L1-CO-亚烃基-CNH-NH2;
i)-L1-CO-亚烯基-CNH-NH2;
j)-L1-CO-亚芳基-CNH-NH2;
k)-L1-CONH-亚烃基-CNH-NH2;
l)-L1-CONH-亚芳基-CNH-NH2;
m)-L1-SO2-亚烃基-CNH-NH2;
n)-L1-SO2-亚芳基-CNH-NH2;
o)-O-亚烃基-N(R1)2;
p)-N(R1)-亚烃基-N(R1)2;
q)-L1-N(R1)2;
r)-L1-亚烃基-N(R1)2;
s)-L1-亚芳基-N(R1)2;
t)-L1-CO-亚烃基-N(R1)2;
u)-L1-CO-亚烯基-N(R1)2;
v)-L1-CO-亚芳基-N(R1)2;
w)-L1-CONH-亚烃基-N(R1)2;
x)-L1-CONH-亚芳基-N(R1)2;
y)-L1-SO2-亚烃基-N(R1)2;
z)-O-亚烃基-N(R2)3;
aa)-N(R1)-亚烃基-N(R2)3;
bb)-L1-N(R2)3;
cc)-L1-亚烃基-N(R2)3;
dd)-L1-亚芳基-N(R2)3;
ee)-L1-CO-亚烃基-N(R2)3;
ff)-L1-CO-亚烯基-N(R2)3;
gg)-L1-CO-亚芳基-N(R2)3;
hh)-L1-CONH-亚烃基-N(R2)3;
ii)-L1-CONH-亚芳基-N(R2)3;
jj)-L1-SO2-亚烃基-N(R2)3;
kk)-O-亚烃基-杂环基;
ll)-N(R1)-亚烃基-杂环基;
mm)-L1-亚烃基-杂环基;
nn)-L1-亚芳基-杂环基;
oo)-L1-CO-亚烃基-杂环基;
pp)-L1-CO-亚烯基-杂环基;
qq)-L1-CO-亚芳基-杂环基;
rr)-L1-CONH-亚烃基-杂环基;
ss)-L1-CONH-亚芳基-杂环基;
tt)-L1-SO2-亚烃基-杂环基;
uu)-O-亚烃基-N(O)(R2)2;
vv)-N(R1)-亚烃基-N(O)(R2)2;
ww)-L1-N(O)(R2)2;
xx)-L1-亚烃基-N(O)(R2)23;
yy)-L1-亚芳基-N(O)(R2)2;
zz)-L1-CO-亚烃基-N(O)(R2)2;
aaa)-L1-CO-亚烯基-N(O)(R2)23;
bbb)-L1-CO-亚芳基-N(O)(R2)2;
ccc)-L1-CONH-亚烃基-N(O)(R2)2;
ddd)-L1-CONH-亚芳基-N(O)(R2)2;
eee)-L1-SO2-亚烃基-N(O)(R2)2;
fff)-O-亚烃基-NH-CNH-NH2;
ggg)-N(R1)-亚烃基-NH-CNH-NH2;
hhh)-L1-NH-CNH-NH2;
iii)-L1-亚烃基-NH-CNH-NH2;
jjj)-L1-亚芳基-NH-CNH-NH2;
kkk)-L1-CO-亚烃基-NH-CNH-NH2;
lll)-L1-CO-亚烯基-NH-CNH-NH2;
mmm)-L1-CO-亚芳基-NH-CNH-NH2;
nnn)-L1-CONH-亚烃基-NH-CNH-NH2;
ooo)-L1-CONH-亚芳基-NH-CNH-NH2;
ppp)-L1-SO2-亚烃基-NH-CNH-NH2;
qqq)-L1-SO2-亚芳基-NH-CNH-NH2;和
rrr)保护形式的任何以上X3基团;
条件是如果X1存在为N(CH3)2,且X7存在为哌啶基,则X3不为
X4选自:
a)-O-亚烃基-芳基;
b)-N(R1)-芳基;
c)-N(R1)-亚烃基-芳基;
d)-L1-CO-亚烃基-芳基;
e)-L1-CO-亚烯基-芳基;
f)-L1-CO-亚芳基-芳基;
g)-L1-CONH-亚烃基-芳基;
h)-L1-CONH-亚芳基-芳基;
i)-L1-SO2-亚烃基-芳基;
j)-L1-SO2-亚芳基-芳基;
k)-L1-亚烃基-芳基;
l)-L1-亚芳基-芳基;
m)-N(R1)-亚烃基-N(R1)-芳基;
n)-N(R1)-亚烃基-N(R1)CO-芳基;
o)-N(R1)-亚烃基-N(R1)SO2-芳基;
p)-N(R1)-亚烃基-N(R1)CH2-芳基;
q)-L1-芳基;
r)-L1-CO-芳基;
s)-L1-SO2-芳基;
t)-L1-亚烃基-P(芳基)3;
u)-L1-CO-亚烃基-P(芳基)3;
v)-L1-SO2-亚烃基-P(芳基)3;和
w)保护形式的任何以上X4基团;
X5选自:
a)-O-亚烃基-杂芳基;
b)-N(R1)-亚烃基-杂芳基;
c)-L1-CO-亚烃基-杂芳基;
d)-L1-CO-亚烯基-杂芳基;
e)-L1-CO-亚芳基-杂芳基;
f)-L1-CONH-亚烃基-杂芳基;
g)-L1-CONH-亚芳基-杂芳基;
h)-L1-SO2-亚烃基-杂芳基;
i)-L1-SO2-亚芳基-杂芳基;
j)-L1-亚烃基-杂芳基;
k)-L1-亚芳基-杂芳基;
l)-N(R1)-亚烃基-N(R1)-杂芳基;
m)-N(R1)-亚烃基-N(R1)CO-杂芳基;
n)-N(R1)-亚烃基-N(R1)SO2-杂芳基;
o)-N(R1)-亚烃基-N(R1)CH2-杂芳基;
p)-L1-杂芳基;和
q)保护形式的任何以上X5基团;
X6选自:
a)-O-亚烃基-(OCH2CH2)mOH;
b)-O-亚烃基-(OCH2CH2)mOCH3;
c)-N(R1)-亚烃基-(OCH2CH2)mOH;
d)-N(R1)-亚烃基-(OCH2CH2)mOCH3;
e)-N(R1)-亚芳基-(OCH2CH2)mOH;
f)-N(R1)-亚芳基-(OCH2CH2)mOCH3;
g)-L1-亚烃基-(OCH2CH2)mOH;
h)-L1-CO-亚烃基-(OCH2CH2)mOH;
i)-L1-CO-亚烃基-(OCH2CH2)mOCH3;
j)-L1-SO2-亚烃基-(OCH2CH2)mOH;
k)-L1-SO2-亚烃基-(OCH2CH2)mOCH3;
l)-L1-CO-亚芳基-(OCH2CH2)mOH;
m)-L1-CO-亚芳基-(OCH2CH2)mOCH3;
n)-L1-SO2-亚芳基-(OCH2CH2)mOH;
o)-L1-SO2-亚芳基-(OCH2CH2)mOCH3;
p)-L1-CO-(OCH2CH2)mOH;
q)-L1-CO-(OCH2CH2)mOCH3;
r)-N(R1)-(二苯并-18-冠-6);
s)氮杂-冠醚;和
t)保护形式的任何以上X6基团;
X7选自:
a)-杂环基;
b)-N(R1)(R3)
c)-L1-氢;
d)-L1-烃基;
e)-L1-CO-烃基;
f)-L1-CONH-烃基;
g)-L1-CON(烃基)-烃基;
h)-L1-SO2-烃基;和
i)保护形式的任何以上X7基团;
条件是如果X1存在为N(CH3)2,且X3存在为则X7不为哌啶基;
X8选自:
a)-L1-CA;
b)-L1-dCA;
c)-L1-COCH2(R4);
d)-L1-COCH(R4)NHCO2-烃基;
e)-OR5,其中R5和R10一起形成环;
f)保护形式的任何以上X8基团;
每个R1独立地为氢、烃基或细胞穿透肽;
每个R2独立地为C1-C12烃基,或者任选地当两个R2为C1-C12烃基时,两个R2连接形成杂环;
每个R3独立地为C2-C18烃基、烯基或炔基;
每个R4独立地为氢、烃基、羟基烃基、巯基烃基或芳基烃基;
每个R5独立地为C1-C12烃基;
每个R6独立地为氢或C1-C12烃基;
L1选自:
其中
每个Q1和Q2分别选自键、-O-或-N(R6)-;
每个E1独立地选自任选取代的芳基或任选取代的杂芳基;
每个E2独立地为任选取代的含氮的杂芳基;
每个L4和L5分别独立地为键、任选取代的C1-C6烃基或任选取代的杂烃基;并且
m、p、q、s和t分别独立地为1-4。
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