[发明专利]一种荒漠植物绵刺的微卫星位点及其扩增引物与应用

说明书

本发明公开了一种荒漠植物绵刺的微卫星位点及其扩增引物与应用。本发明公开的绵刺微卫星位点包括微卫星位点Pm1～Pm11中的一种或多种，Pm1～Pm11的序列分别如SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:11所示。本发明公开的绵刺微卫星位点及其扩增引物在对绵刺的保护遗传学研究、种质资源调查和辅助育种等方面中都起到重要作用，同时也为植物抗旱机制的研究提供基础材料。

技术领域

本发明属于生物技术领域，涉及荒漠植物绵刺的微卫星位点及其扩增引物与应用。

背景技术

绵刺(Potaninia mongolica Maxim)是蔷薇科、绵刺属植物，是分布于中国内蒙古的一种超耐旱也极耐盐碱的植物。绵刺是饲料植物，青鲜时骆驼、羊、马、驴等喜食。绵刺荒漠为中国的东阿拉善至西鄂尔多斯地区的主要放牧场地。

我国是世界上荒漠化和沙化面积大、分布广、危害重的国家之一，严重的土地荒漠化、沙化威胁着我国生态安全和经济社会的可持续发展，威胁中华民族的生存和发展。根据第三次全国荒漠化监测的数据来看，我国荒漠化面积达到了263.62万Km²，占我国国土面积的27.46％。绵刺的超强抗旱性和可饲食性使其成为植物抗旱机制和饲料应用的良好研究对象，绵刺的多态性研究可为这些研究提供基础数据。

微卫星标记(microsatellite)，又称为短串联重复序列(short tandem repeats,STRs)或简单重复序列(simple sequence repeats)，是均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列，由2～6个核苷酸的串联重复片段构成，由于重复单位的重复次数在个体间呈高度变异性并且数量丰富，因此微卫星标记的应用非常广泛。微卫星位点通常通过PCR扩增，扩增产物通过电泳分析并根据大小分离等位基因进行检测。PCR扩增后的等位微卫星可用荧光标记的方法进行检测，在适合的引物的5’端加上不同的荧光标记，对产物所对应的峰图进行分析，从而得到相应的结果。

发明内容

本发明基于对绵刺的分子遗传学研究结果，提供绵刺的微卫星位点及其扩增引物，以用于绵刺的育种和品种鉴定和检测。

在一个方面，本发明提供绵刺(Potaninia mongolica Maxim)微卫星位点，包括微卫星位点Pm1～Pm11中的一种或多种，例如其中的4、5、6、7、8、9、 10或11种，Pm1～Pm11的序列分别如SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:11所示。

在另一个方面，本发明还提供上述绵刺微卫星位点的扩增引物。

在一些实施方案中，上述扩增引物中，

用于扩增Pm1的引物对如SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:13所示；

用于扩增Pm2的引物对如SEQ ID NO:14和SEQ ID NO:15所示；

用于扩增Pm3的引物对如SEQ ID NO:16和SEQ ID NO:17所示；

用于扩增Pm4的引物对如SEQ ID NO:18和SEQ ID NO:19所示；

用于扩增Pm5的引物对如SEQ ID NO:20和SEQ ID NO:21所示；

用于扩增Pm6的引物对如SEQ ID NO:22和SEQ ID NO:23所示；

用于扩增Pm7的引物对如SEQ ID NO:24和SEQ ID NO:25所示；

用于扩增Pm8的引物对如SEQ ID NO:26和SEQ ID NO:27所示；

用于扩增Pm9的引物对如SEQ ID NO:28和SEQ ID NO:29所示；

用于扩增Pm10的引物对如SEQ ID NO:30和SEQ ID NO:31所示；