[发明专利]长链非编码RNA LINC01679在诊断和治疗原发性翼状胬肉中的应用

说明书

本发明通过高通量测序对比了人原发性翼状胬肉组织与临近正常组织的基因表达谱变化，发现长链非编码RNA LINC01679,LOC102724238异常高表达，且其表多集中于细胞质区域，通过细胞学实验验证了高表达的LINC01679,LOC102724238促进了细胞的增殖、迁移和侵袭，利用特异性的抑制剂抑制LINC01679,LOC102724238的表达后逆转了细胞的上述表型，提示LINC01679,LOC102724238对人原发性翼状胬肉的发生发展有促进作用，是潜在的治疗靶点。

本发明属于生物医药领域，具体涉及长链非编码RNA对于原发性翼状胬肉应用领域。

背景技术

翼状胬肉(Pterygium)是一种只发生于人类的常见眼表疾病，Wu等在中国南方地区的流行病学调查显示,在年龄超过50岁的人群中翼状胬肉的发病率为33.01％。目前，翼状胬肉的具体发病机制仍不明确，除了手术之外也缺乏有效的治疗方法，而单纯胬肉切除的复发率高达30％以上，给患者带来极大的痛苦。因此，深入研究翼状胬肉的发病机制，更有效地阻止翼状胬肉的发生和降低术后复发率，是目前临床医生和基础研究亟待解决的关键问题。

近年来，随着对翼状胬肉发病机制的深入研究，翼状胬肉的类肿瘤样特性如局部浸润性、高复发率等特点被越来越多的基础及临床研究所证实。流行病学研究表明，翼状胬肉的发生与发展和环境因素有密切的关系。目前的观点倾向于认为翼状胬肉是一种与紫外照射相关的纤维血管异常增殖性疾病，可能与细胞的异常增生和凋亡失调密不可分，其病理表现为翼状胬肉组织中含有大量增生的血管及变性纤维，同时伴有大量的球结膜上皮细胞的异常增生。最新的肿瘤分子功能研究进一步证实TGF-β、Notch及生长因子(PDGF和EGF)等重要的分子信号通路在调控翼状胬肉发生发展的过程中也起了至关重要的作用。但有关长链非编码RNA在原发性翼状胬肉发生发展中的研究仍处于相对空白状态。

高通量测序(High-Throughput Sequencing)，又称深度测序(Deep sequencing)或下一代测序(Next-Generation Sequencing,NGS)，是研究基因表达和鉴定新型RNA种类的首选方法。与第一代测序方法相比，其主要优点是能够以更低的成本产出更大量的数据；与传统的DNA微阵列相比，高通量测序背景噪音更低，检测动态范围更大，且能够在不需要特异性探针的情况下鉴定和定量稀有转录本。最重要的是，高通量测序直接揭示了序列同一性，这对于分析未知基因和新的转录异构体至关重要。高通量测序技术可用于基因组测序和重测序、转录组分析(RNA-Seq)、DNA蛋白质互相作用(ChIP-Seq)以及表观基因组测序。转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下，细胞内所有转录产物的集合，包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA以及非编码RNA。针对转录组的研究对于阐释基因组的功能和揭示细胞和组织的分子组成成分以及理解发育和疾病至关重要。转录组学研究的主要目的是：将所有物种的转录本进行编目，包括mRNA、非编码RNA以及小RNA；从起始位点、剪切模式和其他转录后修饰等方面确定基因的转录结构；并且在发育期间和不同环境下定量转录本表达水平的改变。

人类基因组计划及其后续的DNA元件计划的研究结果表明，编码蛋白的基因序列仅占人类基因组序列的1-3％，而人基因组中绝大部分可转录的序列为非编码的RNA，包括小片段的如microRNA以及长链的非编码RNA(long non-coding RNA，lncRNA)。近年来的许多研究都表明示IncRNA参与了一系列重要的细胞调节过程。例如长链非编码RNA参与了调节目标基因的转录、遗传印记及细胞核内的运输等众多关键的调节控制的过程,和其它包括脱氧核糖核酸甲基化、遗传印记及染色质的重新构建等表观遗传形式一样,与疾病的关系持续成为关注的热点。