[发明专利]一种基于不确定性引导的交互式医学图像分割方法有效
申请号: | 202010541439.0 | 申请日: | 2020-06-15 |
公开(公告)号: | CN111798458B | 公开(公告)日: | 2022-07-29 |
发明(设计)人: | 王国泰;孙雪瑞;张少霆 | 申请(专利权)人: | 电子科技大学 |
主分类号: | G06T7/11 | 分类号: | G06T7/11;G06T7/12;G16H30/20 |
代理公司: | 电子科技大学专利中心 51203 | 代理人: | 陈一鑫 |
地址: | 611731 四川省成*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 不确定性 引导 交互式 医学 图像 分割 方法 | ||
1.一种基于不确定性引导的交互式医学图像分割方法,该方法包括:
步骤1:建立训练数据集;
针对一个分割任务,收集临床影像数据,通过临床专家将感兴趣的分割目标手工分割出来,作为相应个体的分割标准,建立训练数据集;
步骤2:采用训练数据集对卷积深度神经网络模型进行训练,得到训练好的模型,使得该模型能同时得到分割结果与不确定性信息;
步骤3:对于新的待分割切片,使用训练好的模型进行分割预测,得到初始分割结果和不确定信息;
步骤4:利用不确定性信息对所有切片进行排序,依次取出不确定性最高的切片,推荐给操作者以进行修正;
步骤5:操作者在所推荐的切片上,通过交互式水平集算法对分割结果进行修正;
所述修正的方法如下:
在初始分割结果和操作者给定的交互点的基础上,采用交互式水平集方法得到修正后的分割结果;该交互式水平集对应的能量函数E(x)包含区域约束项Er、人工交互约束项Eu、长度约束项El和距离约束项Ed,定义如下:
E(x)=αEr+βEu+λEl+μEd 公式2
其中α,β,λ,μ分别为对应项的权重系数;
区域约束项Er定义如下:
其中P是分割的概率图,H∈是软化Heaviside函数,c1和c2是当前水平集轮廓内部和外部的平均前景概率值,φ(x)表示像素x处的水平集函数值;
人工交互约束项Eu定义如下:
其中F和B分别表示人工交互所给出的前景像素点的集合和背景像素点的集合;表示x到F的测地线距离,D是一个阈值,以确保人工交互只影响局部的分割结果;
长度约束项El和距离约束项Ed定义为:
其中δ∈是软化Dirac delta函数,p是基于水平集的梯度定义的势能函数,以保持水平集函数符合距离函数的特征,表示梯度算子;
步骤6:循环步骤4和步骤5,直到没有新的待修正切片的推荐,即完成整个交互式分割过程;
所述步骤2中的卷积深度神经网络模型包括N个并行的独立网络,每个独立网络的结构相同,每个并行网络单独对输入切片进行分割预测,得到N个分割结果和N个不确定信息;
所述步骤3中采用这N个分割结果的平均值作为该切片的初始分割结果;采用这N个分割结果的方差作为该切片分割的不确定信息。
2.如权利要求1所述的一种基于不确定性引导的交互式医学图像分割方法,其特征在于,所述步骤2中卷积深度神经网络模型包括:编码器、常规卷积层和解码器,输入图像的数据流依次经过编码器、常规卷积层、解码器;其中编码器和解码器都包括依次级联的4个卷积模块,每个卷积模块包括2个卷积单元;每个卷积单元都包括:分组卷积层、批归一化层和pReLU激活函数层;所述编码器中相邻两个卷积模块通过一个下采样层连接,解码器中相邻两个卷积模块通过一个上采样层连接;编码器和解码器中所有分组卷积层的分组数为N;所述常规卷积层的分组数为1。
3.如权利要求1所述的一种基于不确定性引导的交互式医学图像分割方法,其特征在于,所述步骤3中采用如下方法进一步计算不确定信息;
用表示卷积深度神经网络模型中第n个独立网络对像素x属于分割前景的概率值的预测,其中n=1,2,…,N;对于像素x的N个预测的方差为Ux;对于每一个切片,其切片级别的不确定性定义为:
其中Yx表示该切片的分割结果中像素x的类别标签:0或者1;ζ是一个极小数,以保证该公式中的计算稳定性。
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