[发明专利]光亮果皮番茄品种选育的分子标记及其应用

说明书

本发明涉及番茄分子标记育种领域，具体涉及光亮果皮番茄品种选育的分子标记及其应用。本发明利用番茄自发突变体glossy与野生番茄LA1375构建F2分离群体，利用BSR定位策略及连锁分析将glossy基因定位在1号染色体600kb范围内，并获得与之紧密连锁的分子标记GLS，利用该分子标记及其引物进行番茄品种选育，为特殊番茄品种的开发提供了资源，并为果实发育生物学研究奠定了基础。

技术领域

本发明属于番茄育种领域，具体涉及光亮果皮番茄品种选育的分子标记及其应用。

背景技术

番茄表皮即角质膜，它是植物自我保护的第一级屏障，在植物的生长发育中发挥着重要作用。角质膜是植物与环境的作用界面，它能封闭植物细胞，减少植物遭受生物和非生物胁迫，如减少气孔蒸腾以外的水分散失，减少病菌侵染和昆虫取食。角质膜也能有效阻挡机械伤害，角质层里的多糖能影响植物角质的紧密度和坚硬度，进而影响植物外表皮的张力和致密度。番茄表皮既能影响果实的抗性、耐贮性，也能很大程度上影响果实的感观品质和风味，特别是影响食用口感。

果脯和果干作为传统食品，在现代社会依旧备受青睐。番茄可作为蔬菜和水果，也可以进一步加工成果脯和果干。常规番茄果脯或果干的加工过程需要经过清洗、烫漂、去皮、硬化、渗糖、晾晒或烘干等工艺，排除果实内丰富的水分并促进糖分的渗入，但是在去皮过程中，会造成维生素和番茄红素的流失。

基于此，开发一种能够快速选育出果皮嫩薄、易失水、适于制作果干果脯的番茄品种的分子标记，并将其应用于番茄育种领域，具有重要意义。

发明内容

基于此，本发明的目的在于提供一种光亮果皮番茄品种选育的分子标记及该分子标记在番茄育种中的应用。

本发明解决上述技术问题的技术方案如下：

本发明提供一种光亮果皮番茄品种选育的分子标记，以2.5版本的番茄参考基因组为准，所述分子标记为位于番茄1号染色体85257792bp处的58bp的核苷酸插入片段，该分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示。

本发明的保护范围还涉及到所有能够检测上述分子标记的扩增引物或杂交探针，所有能够检测上述分子标记的引物或探针均能够用于光亮果皮番茄品种的选育。

具体地，其中一对分子标记的引物核苷酸序列如下所示：

正向引物：TCCTAGACTTCTAGAAATACGTGTGG，如SEQ ID NO：2所示；

反向引物：TGGAAAAGAAAGGAGAAAGGATGAC，如SEQ ID NO：3所示。

本发明还提供了上述分子标记的获取方法，包括以下步骤：

(1)突变体的发现以及鉴定

该突变体是番茄品种Alisa Craig在组织培养过程中自发产生的，突变体果实表现为果皮薄而光亮，食用时化渣性好，入口即化，口感佳，命名为glossy。glossy番茄表皮嫩薄，易散失水份同时外源物质也容易渗透进去，可作为果脯和果干的原料，加工时无需去皮，可以减少营养物质的流失且能使加工品具有良好的外观形态；另外，其嫩薄的表皮也使得这类番茄鲜食口感较佳且外观鲜亮，具有吸引人购买的有利性状。突变体果实表型如附图1所示。经遗传研究发现glossy可以稳定遗传，为一个稳定的变异。

(2)glossy紧密连锁的分子标记开发

利用glossy突变体与番茄野生种质LA1375杂交，获得F1代，F1代自交获得F2，定植563株F2单株，到番茄果实绿熟时即可准确鉴别果实表型。F2群体中果实表现为glossy的单株有138株，利用卡平方检验发现卡平方值为0.8657，小于自由度为1的卡平方临界值判断该突变符合3:1的分离比，表明glossy受隐性单基因控制。

(3)基因定位及分子标记开发