[发明专利]基于BP神经网络和细胞力学特性参数的癌细胞分类方法在审
| 申请号: | 202010505655.X | 申请日: | 2020-06-05 |
| 公开(公告)号: | CN111860129A | 公开(公告)日: | 2020-10-30 |
| 发明(设计)人: | 田延岭;林旺江;朱鑫垚;王伟杰;刘柱;张伟;吕荣宇;卢康康;王福军;张大卫 | 申请(专利权)人: | 天津大学 |
| 主分类号: | G06K9/00 | 分类号: | G06K9/00;G06K9/62;G06N3/04;G06N3/08 |
| 代理公司: | 天津市北洋有限责任专利代理事务所 12201 | 代理人: | 杜文茹 |
| 地址: | 300072*** | 国省代码: | 天津;12 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 基于 bp 神经网络 细胞 力学 特性 参数 癌细胞 分类 方法 | ||
1.一种基于BP神经网络和细胞力学特性参数的癌细胞分类方法,其特征在于,以肝癌细胞7721、肝癌细胞HepG2、肺癌细胞A549和胃癌细胞SGC的细胞力学参数作为输入数据,以细胞的种类分类作为输出数据,建立BP神经网络,来识别细胞的类型;具体包括如下步骤:
1)分别获取肝癌细胞7721、肝癌细胞HepG2、肺癌细胞A549和胃癌细胞SGC的杨氏模量、黏附功、粘附力、细胞高度、表面粗糙度的数据作为输入数据;
2)将输入的数据随机打乱,重新排序,且按照4:1:5的比率,将输入数据分成训练数据、验证数据、测试数据,并进行归一化操作;
3)创建BP神经网络,其中输入层节点为5;隐含层为6层,每层的节点为10;输出层的节点为4;
4)确定BP神经网络的参数,包括:设置激活函数为Softmax函数,学习率为0.1,采用Batch Normalizarion来避免梯度消失,优化方法采用Adam,目标函数采用Cross Entropy;
5)将训练数据送入设置好参数的BP神经网络,进行BP神经网络的前向计算,得到相应的权值参数W、b和实际输出y;
6)将得到的实际输出y与期望输出计算误差,然后根据目标函数以及误差进行BP神经网络的反向传播计算,来更新BP神经网络的权值参数W和b,得到训练好的BP神经网络;
7)将验证数据输入训练好的BP神经网络,获得BP神经网络的预测输出,将所述的预测输出与期望输出做误差运算,得到BP神经网络的误差,并计算正确率,所述的正确率为95%;
8)重复步骤5)~步骤7),直到正确率达到设定值,得到最终的BP神经网络;
9)将测试数据代入最终的BP神经网络,来测试最终的BP神经网络的实际效果;
10)重新通过原子力显微镜分别对肝癌细胞7721、肝癌细胞HepG2、肺癌细胞A549和胃癌细胞SGC进行纳米压痕实验,再获取肝癌细胞7721、肝癌细胞HepG2、肺癌细胞A549和胃癌细胞SGC的杨氏模量、黏附功、粘附力、细胞高度、表面粗糙度的数据,放入最终的BP神经网络中,来快速识别细胞的类型。
2.根据权利要求1所述的基于BP神经网络和细胞力学特性参数的癌细胞分类方法,其特征在于,步骤1)是通过原子力显微镜分别对肝癌细胞7721、肝癌细胞HepG2、肺癌细胞A549和胃癌细胞SGC进行纳米压痕实验,获取肝癌细胞7721、肝癌细胞HepG2、肺癌细胞A549和胃癌细胞SGC的杨氏模量、黏附功、粘附力、细胞高度、表面粗糙度的数据。
3.根据权利要求1所述的基于BP神经网络和细胞力学特性参数的癌细胞分类方法,其特征在于,步骤2)所述的归一化操作,是将输入数据减去对应维度的最小值,再除以维度最大值减去维度最小值,将数值压缩到[0,1]的区间。
4.根据权利要求1所述的基于BP神经网络和细胞力学特性参数的癌细胞分类方法,其特征在于,步骤8)所述正确率的设定值为95%。
5.根据权利要求1所述的基于BP神经网络和细胞力学特性参数的癌细胞分类方法,其特征在于,针对不同类型的细胞力学数据重新训练BP神经网络,以此识别不同类型的细胞种类。
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