[发明专利]一种创伤弧菌RPA-LFS快速检测方法的建立及应用在审
| 申请号: | 202010505555.7 | 申请日: | 2020-06-05 |
| 公开(公告)号: | CN111676302A | 公开(公告)日: | 2020-09-18 |
| 发明(设计)人: | 高嵩;董井泉;杨潇含;赵盼盼;董宇;王昱 | 申请(专利权)人: | 江苏海洋大学;连云港海恒生化科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6844;C12Q1/04 |
| 代理公司: | 北京和联顺知识产权代理有限公司 11621 | 代理人: | 闫超良 |
| 地址: | 222000 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 创伤 弧菌 rpa lfs 快速 检测 方法 建立 应用 | ||
1.一种创伤弧菌RPA-LFS快速检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)引物设计及筛选:
上游引物:5’-GAGATGGATTCTTTGTATAACATTGCGT
下游引物:5’-ACGATGACGTTGGTTGTGTTACATTATC
2)探针设计及筛选:
探针:
FITC-GGTGAAGTTGGCTGGTGGTTATTTTCAGAA[THF]CATGGTTGTTGAGCTC-SpC3。
3)RPA-LFS特异性检测。
4)RPA-LFS反应温度优化。
5)RPA-LFS反应时间优化。
6)RPA-LFS最低检出限测定。
2.根据权利要求1所述的一种创伤弧菌RPA-LFS快速检测方法的应用,其特征在于:
所述引物探针筛选探针长度至少46bp;
所述探针5’末端用FITC进行标记,3’末端引入3C-spacer进行末端封闭,在探针中间引入THF,即无嘌呤无嘧啶位点(AP位点);
所述AP位点前至少要保留30bp的碱基,AP位点之后至少有15bp的碱基,下游引物的5’末端标记生物素。
3.根据权利要求1所述的一种创伤弧菌RPA-LFS快速检测方法的应用,其特征在于,所述RPA-LFS初步应用检测,并用RPA-LFS检测体系对临床样本进行检测,所述检测结果同时与传统培养法和qPCR法对比,所述55个对虾样本中,RPA-LFS检测出7个阳性结果,25个贝类样本中检测出5个阳性结果,6个鱼和2个螃蟹样本检测结果均为阴性。
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