[发明专利]与油茶种仁含油率相关的SNP分子标记及其应用有效
申请号: | 202010477542.3 | 申请日: | 2020-05-29 |
公开(公告)号: | CN111534630B | 公开(公告)日: | 2023-07-14 |
发明(设计)人: | 林萍;任华东;王开良 | 申请(专利权)人: | 中国林业科学研究院亚热带林业研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 陈征 |
地址: | 311400 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 油茶 种仁 含油率 相关 snp 分子 标记 及其 应用 | ||
1.与油茶种仁含油率相关的SNP分子标记组合,其特征在于,所述SNP分子标记组合包括PB.57703.1-685、PB.93518.1-182、PB.93518.1-191、PB.93518.1-224、PB.93518.1-270、PB.93518.1-284、PB.93518.1-288、PB.103793.1-1118、PB.103793.1-1172、PB.103793.1-1175、PB.47687.1-148、PB.47687.1-215、PB.47687.1-258、PB.47687.1-264、PB.47687.1-282、PB.47687.1-297、PB.47687.1-360、PB.47687.1-366、PB.47687.1-367、PB.85097.1-125、PB.85097.1-197、PB.85097.1-293、PB.85097.1-356、PB.85097.1-532、PB.35678.1-1129、PB.70158.1-51、PB.70158.1-187、PB.70158.1-306、PB.70158.1-314、PB.70158.1-408、PB.70158.1-413、PB.70158.1-419、PB.70158.1-473、PB.70158.1-649、PB.70158.1-704、PB.70158.1-707、PB.70158.1-778、PB.70158.1-854、PB.70158.1-930、PB.70158.1-935、PB.70158.1-944、PB.70158.1-1025、PB.76391.3-1354、PB.76391.3-1385、PB.76391.3-1417、PB.63477.1-1109、PB.63477.1-1163和PB.63477.1-1166;
其中,SNP分子标记PB.57703.1-685含有如SEQ ID NO.19所示序列第685位的多态性为C/T的核苷酸序列;
SNP分子标记PB.93518.1-182含有如SEQ ID NO.20所示序列第182位的多态性为T/C的核苷酸序列,SNP分子标记PB.93518.1-191含有如SEQ ID NO.20所示序列第191位的多态性为T/C的核苷酸序列,SNP分子标记PB.93518.1-224含有如SEQ ID NO.20所示序列第224位的多态性为G/A的核苷酸序列,SNP分子标记PB.93518.1-270含有如SEQ ID NO.20所示序列第270位的多态性为G/A的核苷酸序列,SNP分子标记PB.93518.1-284含有如SEQ ID NO.20所示序列第284位的多态性为G/A的核苷酸序列,SNP分子标记PB.93518.1-288含有如SEQID NO.20所示序列第288位的多态性为C/T的核苷酸序列;
SNP分子标记PB.103793.1-1118含有如SEQ ID NO.21所示序列第1118位的多态性为A/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.103793.1-1172含有如SEQ ID NO.21所示序列第1172位的多态性为G/A的核苷酸序列,SNP分子标记PB.103793.1-1175含有如SEQ ID NO.21所示序列第1175位的多态性为A/C的核苷酸序列;
SNP分子标记PB.47687.1-148含有如SEQ ID NO.22所示序列第148位的多态性为A/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.47687.1-215含有如SEQ ID NO.22所示序列第215位的多态性为G/T的核苷酸序列,SNP分子标记PB.47687.1-258含有如SEQ ID NO.22所示序列第258位的多态性为C/T的核苷酸序列,SNP分子标记PB.47687.1-264含有如SEQ ID NO.22所示序列第264位的多态性为C/T的核苷酸序列,SNP分子标记PB.47687.1-282含有如SEQ ID NO.22所示序列第282位的多态性为T/C的核苷酸序列,SNP分子标记PB.47687.1-297含有如SEQID NO.22所示序列第297位的多态性为C/T的核苷酸序列,SNP分子标记PB.47687.1-360含有如SEQ ID NO.22所示序列第360位的多态性为A/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.47687.1-366含有如SEQ ID NO.22所示序列第366位的多态性为T/C的核苷酸序列,PB.47687.1-367含有如SEQ ID NO.22所示序列第367位的多态性为G/C的核苷酸序列;
SNP分子标记PB.85097.1-125含有如SEQ ID NO.23所示序列第125位的多态性为C/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.85097.1-197含有如SEQ ID NO.23所示序列第197位的多态性为G/C的核苷酸序列,SNP分子标记PB.85097.1-293含有如SEQ ID NO.23所示序列第293位的多态性为A/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.85097.1-356含有如SEQ ID NO.23所示序列第356位的多态性为T/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.85097.1-532含有如SEQ ID NO.23所示序列第532位的多态性为A/T的核苷酸序列;
SNP分子标记PB.35678.1-1129含有如SEQ ID NO.24所示序列第1129位的多态性为G/C的核苷酸序列;
SNP分子标记PB.70158.1-51含有如SEQ ID NO.25所示序列第51位的多态性为G/A的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1-187含有如SEQ ID NO.25所示序列第187位的多态性为A/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1-306含有如SEQ ID NO.25所示序列第306位的多态性为C/T的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1-314含有如SEQ ID NO.25所示序列第314位的多态性为A/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1-408含有如SEQ ID NO.25所示序列第408位的多态性为T/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1-413含有如SEQ IDNO.25所示序列第413位的多态性为T/A的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1-419含有如SEQ ID NO.25所示序列第419位的多态性为A/T的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1-473含有如SEQ ID NO.25所示序列第473位的多态性为C/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1-649含有如SEQ ID NO.25所示序列第649位的多态性为A/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1-704含有如SEQ ID NO.25所示序列第704位的多态性为G/A的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1-707含有如SEQ ID NO.25所示序列第707位的多态性为A/C的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1-778含有如SEQ ID NO.25所示序列第778位的多态性为C/T的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1-854含有如SEQ ID NO.25所示序列第854位的多态性为A/C的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1-930含有如SEQ ID NO.25所示序列第930位的多态性为C/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1-935含有如SEQ IDNO.25所示序列第935位的多态性为T/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1-944含有如SEQ ID NO.25所示序列第944位的多态性为A/T的核苷酸序列,SNP分子标记PB.70158.1-1025含有如SEQ ID NO.25所示序列第1025位的多态性为C/T的核苷酸序列;
SNP分子标记PB.76391.3-1354含有如SEQ ID NO.26所示序列第1354位的多态性为A/C的核苷酸序列,SNP分子标记PB.76391.3-1385含有如SEQ ID NO.26所示序列第1385位的多态性为G/A的核苷酸序列,SNP分子标记PB.76391.3-1417含有如SEQ ID NO.26所示序列第1417位的多态性为T/C的核苷酸序列;
SNP分子标记PB.63477.1-1109含有如SEQ ID NO.27所示序列第1109位的多态性为A/G的核苷酸序列,SNP分子标记PB.63477.1-1163含有如SEQ ID NO.27所示序列第1163位的多态性为G/A的核苷酸序列,SNP分子标记PB.63477.1-1166含有如SEQ ID NO.27所示序列第1166位的多态性为A/C的核苷酸序列。
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