[发明专利]与慢性阻塞性肺疾病易感性辅助诊断相关的SNP位点及其应用

说明书

本发明公开了一种与慢性阻塞性肺疾病易感性辅助诊断相关的SNP位点，所述SN位点为rs2227485，其存在C/T多态性，相对于TT+TC基因型，当基因型为CC时，判断个体为慢性阻塞性肺疾病非易感性个体。本发明还公开了上述SNP位点在制备辅助诊断慢性阻塞性肺疾病易感性的产品中的应用。该SNP位点有利于综合评价中国汉族人群COPD发生发展及转归中的作用，而且对于指导COPD高危人群的预防和筛查具有重要的意义。

技术领域

本发明属于基因技术领域，具体涉及与慢性阻塞性肺疾病易感性辅助诊断相关的SNP位点及其应用。

背景技术

慢性阻塞性肺疾病(Chronic Obstructive Pulmonary Disease，COPD)，简称慢阻肺，是一种常见的慢性呼吸系统疾病，与环境和遗传因素的共同作用有关。慢阻肺临床上主要表现为慢性咳嗽、咳痰，伴或不伴喘息，病情进展引起进行性气急加重，急性加重与合并症影响病情的严重程度，反复发作引起劳动能力下降，生活质量降低，严重时可致死。据世界卫生组织估计，全球目前有6亿人患有慢阻肺，平均每年约有270万人死于慢阻肺。慢阻肺已成为次于脑血管病、心脏病等，与艾滋病的世界第四大致死原因。预计患病率还会继续上升，到2020年将成为全球第三大致死疾病。目前，慢阻肺患病率之高，死亡人数之多，已对社会造成了巨大的经济负担。随着人口老龄化的进展，慢阻肺所引起的医疗健康问题将越加严重。

目前与慢阻肺明确相关的致病基因仅有SERPINA1(serpin peptidaseinhibitor,clade A,member 1)，该基因突变导致α1-抗胰蛋白酶缺乏，进而导致抗蛋白酶-蛋白酶失衡，引起肺实质受损，形成慢阻肺。一项GWAS研究发现位于4号染色体的HHIP基因、FAM13A基因以及15号染色体的CHRNA基因、IREB2基因的多态性与慢阻肺易感性显著相关。一项基于候选基因的大型病例对照研究发现，位于MMP12基因的一个SNP位点在慢阻肺发病方面具有保护作用。另外，大量研究显示COPD是多基因遗传病，COPD的发病与环境危险因素的暴露和个体遗传易感性有关。在吸烟人群中，13.2％的人患有COPD，而非吸烟者仅占5.1％。然而事实上，只有20％的重度吸烟者最终发展成COPD，提示个体易感因素在COPD的发展中起着重要的作用。综上所述，遗传因素是慢阻肺的发生发展过程中的重要危险因素之一。

IL-22属于IL-10细胞因子家族(IL-10family of cytokines)中的2型α-螺旋细胞因子，人IL-22基因与小鼠IL-22基因高度同源。IL-22与受体形成IL-22-IL-22R信号通路，广泛参与了固有免疫反应与获得性免疫反应，在调节机体宿主防御反应、组织炎症反应与维持组织稳态等方面发挥着重要的作用。IL-22除了参与粘膜免疫防御屏障，在不同的微环境下，还起到促进病理性炎症反应或是促进组织修复的作用。在肺气道上皮中IL-22广泛存在，可能参与调节慢阻肺发生发展过程中气道炎症、气道阻塞、粘膜纤毛功能障碍等。此外，IL-22还参与了气道粘膜屏障抵御病原性细菌的入侵，可能还与慢阻肺急性发作有关。

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms，SNP)是指在基因组上单个核苷酸的变异，包括转换、颠换、缺失和插入，形成的遗传标记，其数量很多，多态性丰富。在人类基因组中大概每1000个碱基就有一个SNP，人类基因组上的SNP总量大概是3×10⁶个。因此，SNP成为第三代遗传标志，人体许多表型差异、对药物或疾病的易感性等等都可能与SNP有关。

COPD是一种多基因遗传性疾病，每个基因的作用程度和方式不同，不同基因之间、基因和环境之间都存在交互作用，各个致病基因作用于发育的不同环节。研究COPD的易感基因，探索易感基因与COPD之间的相互联系，检测易感人群的基因对提高我国人口素质，降低COPD的发生率有重要意义。因此，寻找IL-22基因上的SNP具有重要的生物学意义和临床意义。

发明内容

本发明的第一个目的在于提供一种与慢性阻塞性肺疾病易感性辅助诊断相关的SNP位点。