[发明专利]一种适用于质谱鉴定的草莓雌蕊蛋白提取方法有效
| 申请号: | 202010463875.0 | 申请日: | 2020-05-27 |
| 公开(公告)号: | CN111592586B | 公开(公告)日: | 2021-12-03 |
| 发明(设计)人: | 裘劼人;王淑珍;柴伟国;童建新;周历萍 | 申请(专利权)人: | 杭州市农业科学研究院 |
| 主分类号: | C07K14/415 | 分类号: | C07K14/415;C07K1/36;C07K1/34;C07K1/30;C07K1/14;C12P21/06;G01N30/02;G01N30/86;G01N1/28;G01N1/34 |
| 代理公司: | 杭州中成专利事务所有限公司 33212 | 代理人: | 金祺 |
| 地址: | 310024 浙江省*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 适用于 鉴定 草莓 雌蕊 蛋白 提取 方法 | ||
1.一种适用于质谱鉴定的草莓雌蕊蛋白提取方法,包括:步骤1)、以草莓花雌蕊作为样品;步骤2)、蛋白提取;步骤3)、蛋白酶解;其特征是:所述步骤2)依次包括以下步骤:
2.1)、在0.2g样品中加入800±50μl预冷的提取液Ⅰ混匀,再加入800±50μl预冷的提取液Ⅱ进行首次抽提,得到溶液层以及位于底部的细胞沉淀;所述溶液层分为3层,从上至下依次为酚层、中间层和水层;
所述提取液Ⅰ:含0.7M蔗糖、0.1M氯化钾、0.5M Tris、2%巯基乙醇和50mM EDTA的水溶液,调pH至8.0;
所述提取液Ⅱ:苯酚在Tris-HCl缓冲液中充分饱和的溶液;
2.2)、在步骤2.1)首次抽提所得的酚层中加入600±50μl提取液Ⅰ进行二次抽提,得二次抽提酚层;
2.3)、在步骤2.1)首次抽提所得的中间层和水层中加入800±50μl氯仿进行抽提;去除抽提所产生的水层,将抽提所产生的中间层和位于最下层的氯仿层与上述步骤2.2)所得的二次抽提酚层进行合并;
在所得的合并液中,加入6±1ml预冷的0.1M醋酸铵甲醇,于-18~-22℃静置12~16小时,离心后弃上清;所得的沉淀经预冷的甲醇清洗,冻干,得蛋白粉;
所述步骤2.1)、步骤2.2)、步骤2.3)的抽提均为:冰上颠倒混匀30±5min,于3~5℃离心;
2.4)、在步骤2.3)所得的蛋白粉中加入400±50μL裂解液,涡旋后超声,使蛋白粉溶解,所得的溶解液离心,取上清为蛋白溶液;
所述裂解液为:8M尿素,0.1M Tris-HCl,1mM PMSF,调pH至8.0。
2.根据权利要求1所述的一种适用于质谱鉴定的草莓雌蕊蛋白提取方法,其特征是:所述步骤3)为:将步骤2)所得的蛋白溶液还原烷基化,超滤除杂后于30~37℃胰酶酶解,所得肽段溶液除盐后冻干,得冻干肽段。
3.根据权利要求2所述的一种适用于质谱鉴定的草莓雌蕊蛋白提取方法,其特征是:所述步骤3)为:
取含200μg蛋白的蛋白溶液加入50mM NH4HCO3定容至100μL,再加入11μL、100mM的DTT溶液,混匀后于37±1℃反应1±0.2h;加入12μL 500mM的IAM溶液,避光室温反应25~35min;
将所得反应液利用Amicon-Ultra-15超滤管除杂后加入50mM NH4HCO3至体积为200μl,加入4μg Trypsin,于37℃酶解12h~16h;酶解完成后,离心;再向超滤管中加入50mMNH4HCO3后,离心;得肽段溶液。
4.根据权利要求3所述的一种适用于质谱鉴定的草莓雌蕊蛋白提取方法,其特征是:
所述步骤2.4)的超声为:于冰水浴中,以1000000焦耳能量、超声3s间歇5s的模式超声2min。
5.根据权利要求1~4任一所述的一种适用于质谱鉴定的草莓雌蕊蛋白提取方法,其特征是:所述步骤1)为:取开花一天期的草莓花,将雌蕊液氮研磨成粉,作用样品。
6.根据权利要求5所述的一种适用于质谱鉴定的草莓雌蕊蛋白提取方法,其特征是:所述草莓为红颊草莓。
7.利用如权利要求1~6任一方法所得的冻干肽段进行的质谱鉴定方法,其特征是:
冻干肽段用0.1%甲酸水复溶后,经AcclaimTM PepMapTM 100 C18液相色谱柱2h梯度在线分离后,进入Q Exactive质谱仪进行DIA模式扫描分析;得到的原始文件导入分析软件Spectronaut Pulsar,与已有的草莓柱头蛋白鉴定库匹配后得到蛋白鉴定结果。
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