[发明专利]一种预测HLA相合机率及错配类型的方法

权利要求书

1.一种预测HLA相合机率及错配类型的方法，其特征在于，包括以下步骤：（1）构建HLA数据库；（2）录入并提交待比对基因型，录入的基因型为HLA-A,B,C,DRB1,DQB1位点基因型；（3）将步骤（2）录入的等位基因的格式转换成与HLA数据库中的格式相匹配；（4）将步骤（3）经格式转换后的基因型进行排列组合，得出单倍型组合；（5）将步骤（4）得出的单倍型组合与步骤（1）构建的HLA数据库进行比对；（6）通过比对得到预测结果。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述HLA数据库包括HLA等位基因CWD数据库、HLA单倍型频率数据库和HLA负连锁数据库；其中所述HLA单倍型频率数据库包括10/10相合预测数据库、9/10相合预测数据库和C,DQB1预测数据库。

3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述HLA等位基因CWD数据库包含基因型、C/WD/R、频数；

所述10/10相合预测数据库包含A-B-C-DRB1-DQB1单倍型、A, B,C,DRB1,DQB1基因型、频数、频率、排序、C/WD/R；

所述9/10相合预测数据库包括A错配数据库、B错配数据库、C错配数据库、DRB1错配数据库、DQB1错配数据库；每个错配数据库包含错配的单倍型、单倍型对应的错配基因型、频数；

所述C,DQB1预测数据库包含A-B-DRB1单倍型、单倍型对应的C,DQB1基因型、频数。

4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述步骤（4）中单倍型组合的个数为2^n-1组，其中n为基因位点的个数。

5.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述步骤（5）的比对方式包括10/10相合检索、9/10相合检索、A,B,DRB1位点6/6相合检索、等位基因CWD判读和负连锁检索。

6.一种预测HLA相合机率及错配类型的系统，其特征在于，该系统执行权利要求1-5任一项所述的预测HLA相合机率及错配类型的方法，该系统包括HLA数据库、基因型录入模块、格式转换模块、基因型组合模块和比对模块；

所述HLA数据库用于存储参考数据；

所述基因型录入模块，用于录入待比对基因型并对基因型的格式进行校验；

所述格式转换模块，用于对录入的等位基因进行处理和转换，统一成与HLA数据库匹配的格式；

所述基因型组合模块，用于将格式转换后的基因型进行排列组合，得出单倍型组合；

所述比对模块，用于将单倍型组合与步骤（1）构建的HLA数据库进行比对，得到HLA相合机率及错配类型。

7.一种预测HLA相合机率及错配类型的存储介质，其特征在于，所述存储介质执行权利要求1-5任一项所述的预测HLA相合机率及错配类型的方法。

8.一种预测HLA相合机率及错配类型的处理器，其特征在于，所述处理器用于运行程序，所述程序运行时执行权利要求1-5任一项所述的预测HLA相合机率及错配类型的方法。

9.一种预测HLA相合机率及错配类型的装置，其特征在于，所述装置用于实施权利要求1-5任一项所述的预测HLA相合机率及错配类型的方法。