[发明专利]一种基于RBIP标记鉴定甘薯品种的方法有效

专利信息
申请号: 202010419792.1 申请日: 2020-05-18
公开(公告)号: CN111647678B 公开(公告)日: 2022-04-26
发明(设计)人: 孟羽莎;王寅;赖齐贤;黄超 申请(专利权)人: 浙江省农业科学院
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 杭州求是专利事务所有限公司 33200 代理人: 邱启旺
地址: 310021 *** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 rbip 标记 鉴定 甘薯 品种 方法
【说明书】:

发明公开了6对甘薯RBIP引物对组合及其在品种鉴定中的应用。本发明提供了甘薯品种RBIP标记引物对组合及其在品种鉴定中的应用。本发明是基于RBIP标记鉴定方法,利用6对引物对不同甘薯品种进行鉴定的技术体系。该技术体系不仅能够快速、准确地对不同甘薯品种进行鉴定,还有利于甘薯品种的保护。

技术领域

本发明属于分子生物学分子标记领域,尤其涉及甘薯RBIP引物对的开发及其在品种鉴定中的应用。

背景技术

甘薯(Ipomoea batatas(L.)Lam.),旋花科,甘薯属,起源于中南美洲热带地区,目前广泛种植于世界上多个国家和地区,是重要的粮食、饲料等作物,同时也是新型的能源作物,年总产量11283.5万吨(Food and Agriculture Organization of the UnitedNations,FAO,2017)。中国是世界上最大的甘薯生产国,年种植面积达337.3万hm2,占世界总种植面积的36.7%,年总产量为7203.1万吨,占世界年总产量的63.8%(FAO,2017)。

甘薯品种数量繁多,多数国内品种都是高频率地利用少数骨干亲本来进行杂交选育的,造成了国内甘薯的遗传基础狭隘,使得通过表型性状来鉴定、区别不同甘薯品种难上加难。随着分子生物学技术的发展,利用DNA分子标记在DNA水平上对不同品种进行鉴定逐渐成为一种快速有效的方法,此方法较表型性状鉴定法更为便捷,为甘薯品种鉴定提供了新的途径。

RAPD、AFLP、SSR、RBIP等DNA分子标记均可用于甘薯遗传多样性分析,其中RBIP分子标记较其它标记相比具有以下优点:(1)基因组中含量多、覆盖率广;(2)应用点杂交检测可使其分析完全自动化,能够同时实现对多个样品的快速、高通量标记分析,且为共显性标记;(3)具有高多态性和高稳定性等特征,已广泛应用于遗传多样性分析、品种及亲缘关系鉴定和遗传连锁图谱构建等方面。因此,RBIP分子标记可以准确快速地应用于甘薯指纹图谱的构建。

目前已公布的甘薯RBIP分子标记还比较少,高效、多态的RBIP标记更为缺乏,盲目地使用未进行多态性鉴定的分子标记进行品种鉴定不仅费时费力,也难以得到准确地鉴定结果。因此,本发明为甘薯及其近缘种提供了6对高效、多态的RBIP引物,以期能够有效地应用于甘薯分子育种中。

发明内容

本发明的第一目的是提供甘薯RBIP引物组。

本发明提供鉴定甘薯品种的成套RBIP引物组,包括LTR-10、LTR-11、LTR-13、LTR-20、LTR-37和LTR-38引物对。

所述引物对LTR-10包括如SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列或与之具有75%同源性的核苷酸序列和如SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列或与之具有75%同源性的核苷酸序列。

所述引物对LTR-11包括如SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列或与之具有75%同源性的核苷酸序列和如SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列或与之具有75%同源性的核苷酸序列。

所述引物对LTR-13包括如SEQ ID NO:5所示的核苷酸序列或与之具有75%同源性的核苷酸序列和如SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列或与之具有75%同源性的核苷酸序列。

所述引物对LTR-20包括如SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列或与之具有75%同源性的核苷酸序列和如SEQ ID NO:8所示的核苷酸序列或与之具有75%同源性的核苷酸序列。

所述引物对LTR-37包括如SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列或与之具有75%同源性的核苷酸序列和如SEQ ID NO:10所示的核苷酸序列或与之具有75%同源性的核苷酸序列。

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